TSR3 核糖体成熟因子; TSR3
TSR3,氨基羧基丙基转移酶核糖体成熟因子
ACP 转移酶 TSR3
HGNC 批准的基因符号:TSR3
细胞遗传学位置:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:1,349,240-1,351,878(来自 NCBI)
▼ 说明
真核核糖体生物发生是一个复杂的过程,除了核糖体 RNA(rRNA) 和蛋白质之外,还需要大量非核糖体蛋白质和小非编码 RNA。 TSR3 是参与 18S rRNA 超修饰的细胞质核糖体生物合成因子(Meyer et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析,Meyer 等人(2016) 将人类 TSR3 鉴定为酵母基因的直系同源物,该基因在删除时会诱导 20S pre-rRNA 积累。推导的 312 个氨基酸的人类蛋白质与其酵母直系同源物具有 50% 的同一性。酵母 Tsr3 包含预测的 SPOUT 类 RNA 甲基转移酶折叠和 S-腺苷甲硫氨酸(SAM) 结合位点。荧光显微镜将荧光标记的 Tsr3 定位在酵母细胞的细胞质中。
▼ 测绘
Robbins(2016) 根据 TSR3 序列(GenBank BC017325) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TSR3 基因定位到染色体 16p13.3。
▼ 基因功能
真核rRNA中最复杂的超修饰是小亚基18S rRNA上P位tRNA旁边的保守超修饰核苷酸N1-甲基-N3-氨基羧丙基-假尿苷,其中SAM是氨基羧丙基(acp)基团的来源。 Meyer 等人在 HCT116 人类结肠癌细胞中使用酵母缺失菌株和 RNA 干扰(2016) 表明 TSR3 在 18S rRNA 超修饰的最后一步中催化 acp 转移。酵母 Tsr3 缺失菌株显示 20S pre-rRNA 积累,HCT116 细胞中 TSR3 的缺失导致人类 20s pre-rRNA 等价的 18SE 积累。在 TSR3 耗尽的酵母和人类细胞中,早期核仁加工反应也受到抑制。酵母中 Tsr3 的缺失导致核糖体亚基失衡。