无名指和 WD 含有重复结构域的蛋白质 3; RFWD3
HGNC 批准的基因符号:RFWD3
细胞遗传学位置:16q23.1 基因组坐标(GRCh38):16:74,621,399-74,666,877(来自 NCBI)
▼ 说明
RFWD3 是一种 E3 泛素连接酶,与复制蛋白 A 复合物(参见 RPA1,179835)相关并通过稳定 p53(TP53;191170)参与 DNA 损伤反应(Liu 等人的总结,2011)。
▼ 克隆与表达
傅等人(2010) 从 HeLa 细胞 cDNA 文库中克隆了全长人类 RFWD3。推导的 774 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端富含 SQ 的区域,随后是一个 RING 结构域、一个卷曲螺旋结构域和一个 C 端 WD40 结构域。
刘等人(2011) 发现 RFWD3 富含 SQ 的 N 端结构域(称为 SSQ 结构域)由 3 个近乎完美的 17 个氨基酸重复组成,其中包括基序 SSQ。
▼ 基因功能
在未受应激的细胞中,p53 被 E3 泛素连接酶 MDM2(164785) 多泛素化,并成为蛋白水解降解的目标。然而,作为对 DNA 损伤的反应,p53 变得稳定并激活细胞周期停滞和细胞凋亡所必需的转录程序。傅等人(2010) 发现 RFWD3 可以稳定 p53 以应对 DNA 损伤。 RFWD3 与 MDM2 和 p53 形成复合物,并与 MDM2 协同作用,对 p53 进行单泛素化,但这种相互作用限制了 MDM2 通过延长多泛素链来破坏 p53 的稳定性。 RFWD3 还被检查点激酶 ATM(607585) 和 ATR(601215) 磷酸化,这进一步增强了 DNA 损伤后 p53 单泛素化。傅等人(2010) 得出结论,RFWD3 是一种 E3 泛素连接酶,当 G1 细胞周期检查点激活时,它可以稳定 p53。
通过串联亲和纯化 293T 细胞,然后进行质谱分析,Gong 和 Chen(2011) 发现 RFWD3 与 RPA 复合物共纯化,RPA 复合物在 DNA 损伤位点结合并稳定单链 DNA。体外 Pull-down 测定显示 RFWD3 与 RPA2(179836) 特异性相互作用,但不与 RPA1 或 RPA3(179837) 相互作用。使用截短和内部缺失突变体揭示了 RFWD3 的卷曲螺旋结构域与 RPA2 C 末端附近的结构域特异性相互作用。免疫组织化学分析表明,RFWD3 与 RPA2 共定位于羟基脲诱导的 DNA 损伤灶处。通过小干扰 RNA 敲低 RFWD3 导致 DNA 损伤后检查点蛋白 CHK1(CHEK1; 603078) 磷酸化失败。无法与 RPA2 相互作用的 RFWD3 突变体和缺乏 E3 泛素连接酶 RING 结构域的 RFWD3 突变体也观察到 CHK1 激活失败。 RFWD3 的缺失导致对羟基脲过敏。 Kong 和 Chen(2011) 得出结论,RFWD3 的 E3 泛素连接酶活性对于复制检查点至关重要。
刘等人(2011) 发现,在正常生长的人类细胞的 S/G2 期,RFWD3 部分定位于 PML(102578) 核存储体,并以 RPA 依赖性方式易位到 DNA 损伤位点。 RFWD3 通过其卷曲螺旋结构域和 WD40 重复序列直接与 RPA2 相互作用,并且需要这种相互作用才能在 DNA 损伤位点积累。 RFWD3 或 RPA2 的敲低都会减弱这两种蛋白质的磷酸化。 RFWD3 的缺失延迟了响应复制阻断的 RAD51(179617) 焦点形成,并与 RAD51 和磷酸化 H2AX(601772) 焦点的持续存在相关,表明 DNA 修复有缺陷。
▼ 测绘
Hartz(2011) 根据 RFWD3 序列(GenBank AK001382) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 RFWD3 基因对应到染色体 16q23.1。
▼ 分子遗传学
Knies 等人对一名 12 岁德国女孩(患者 1143)进行了研究,该女孩的父母无关,患有范可尼贫血补充 W 组(FANCW;617784)(2017) 鉴定了 RFWD3 基因中的复合杂合突变(c.205_206dupCC, 614151.0001 和 I639K, 614151.0002)。在暴露于丝裂霉素 C(MMC) 和其他 DNA 交联剂后,患者细胞表现出染色体断裂增加、存活率降低和细胞周期停滞在 G2 期,这些缺陷可以通过表达野生型 RFWD3 来恢复。具体结果表明 BRCA2(600185) 依赖性同源重组(HR) 存在缺陷。 I639K 变体的体外研究表明,与野生型相比,它对细胞核和染色质的重定位较少,破坏了与 RPA 蛋白的物理相互作用(参见,例如 RPA2,179836),并导致转导细胞中的 HR 受损。产生 RFWD3 突变体的三种不同细胞模型概括了在患者细胞中观察到的缺陷,表明 RFWD3 通常促进 DNA 链间交联诱导的 HR。克尼斯等人(2017) 得出结论,RFWD3 位于 FA/BRCA 通路的后期,BRCA2/FANCD1 的下游。
▼ 动物模型
克尼斯等人(2017) 发现 Rfwd3 缺失小鼠能够存活,并且没有表现出明显的表型异常,尽管有一些证据表明胚胎致死率增加、早期死亡和生育力低下,与突变小鼠的睾丸和卵巢萎缩有关。突变小鼠胚胎成纤维细胞对 DNA 交联剂高度敏感,并且与对照相比,染色体断裂增加。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 FANCONI 贫血,补充组 W(1 名患者)
RFWD3,2-BP DUP,205CC
Knies 等人对一名 12 岁德国女孩(患者 1143)进行了研究,该女孩的父母无关,患有范可尼贫血补充 W 组(FANCW;617784)(2017) 鉴定出 RFWD3 基因中的复合杂合突变:2 bp 重复(c.205_206dupCC, NM_018124.3),导致 N 末端区域发生移码和提前终止(Leu69ProfsTer12),以及 c.1916T-颠换,导致 WD40 结构域中高度保守的残基处发生 ile639 到 lys(I639K;614151.0002)的取代,该残基负责 RPA2(179836) 结合。千人基因组计划或 ExAC 数据库中均未发现这两种突变。由于在患者细胞中未检测到截短的蛋白质,预计 c.205_206dupCC 突变会导致无义介导的 mRNA 衰减和功能无效等位基因。暴露于丝裂霉素 C(MMC) 和其他破坏剂后,患者细胞显示出更多的染色体断裂,并且这些缺陷可以通过野生型 RFWD3 的表达来恢复。具体结果表明 BRCA2(600185) 依赖性同源重组(HR) 存在缺陷。 I639K 变体的体外研究表明,与野生型相比,它对细胞核和染色质的重定位较少,并且与 RPA2 的相互作用受损,导致转导细胞中的 HR 受损。
.0002 FANCONI 贫血,补充组 W(1 名患者)
RFWD3、ILE639LYS
讨论 RFWD3 基因中的 c.1916T-A 颠换(c.1916T-A,NM_018124.3),导致 ile639 到 lys(I639K) 取代,这种情况在患有以下疾病的患者中以复合杂合状态发现: Knies 等人的范可尼贫血补充 W 组(FANCW;617784)(2017),参见 614151.0001。