WD 重复包含蛋白质 20; WDR20
HGNC 批准的基因符号:WDR20
细胞遗传学位置:14q32.31 基因组坐标(GRCh38):14:102,139,423-102,224,839(来自 NCBI)
▼ 说明
泛素化是翻译后修饰的一种广泛形式,其中泛素(191339) 的 C 末端与靶蛋白上的赖氨酸之间形成稳定的异肽键。泛素化标志着蛋白质降解或改变蛋白质功能,并且通常是可逆的。去泛素化通过泛素特异性蛋白酶(USP) 发生,例如 USP12(603091)。 WDR20 与 USP12 相互作用并刺激其去泛素化活性(Li 等人总结,2016)。
▼ 克隆与表达
Kee 等人通过对 USP12、UAF1(WDR48; 612167) 和 USP46(612849) 免疫沉淀的 HeLa 细胞蛋白进行质谱分析(2010) 确定了 WDR20。推导的 569 个氨基酸的蛋白质具有 4 个中央 WD40 结构域和位于 C 末端的另一个 WD40 结构域。系统发育分析显示 WDR20 从人类到粟酒裂殖酵母的保守性,但在酿酒酵母中没有检测到直系同源物。
▼ 基因功能
Kee 等人使用相互免疫沉淀分析和蛋白质下拉分析(2010) 证实了 WDR20 与 UAF1 或 USP12 之间的相互作用。 WDR20 单独与 USP12 和 UAF1 相互作用,并且 WDR20 与 UAF1-USP12 去泛素化复合物之间的相互作用更强。 WDR20 中第二个 WD40 重复序列的删除显着损害了其与 UAF1 和 USP12 的相互作用。重组 WDR20(而非缺少第二个 WD40 重复序列的 WDR20)显着刺激了 UAF1-USP12 复合物的去泛素化活性。 WDR20 没有与 UAF1-USP12 形成稳定的复合物,而是似乎与 UAF1-USP12 短暂相互作用。
▼ 生化特征
李等人(2016) 解析了单独的人 USP12、与 UAF1 的复合物以及与 UAF1 和 WDR20 的复合物的晶体结构。 USP12 单独采用了规范的右手 USP 折叠,由手指、拇指和手掌区域组成。在 USP 中,手指结构域支撑泛素的球状结构域,拇指和手掌结构域位于长而窄的催化裂口两侧,并结合延伸的泛素尾部,将其 C 末端呈现给活性位点半胱氨酸。 UAF1 和 WDR20 在远离 USP12 催化中心的不同位点与 USP12 相互作用,并在不改变其底物亲和力的情况下增加 USP12 催化活性。 UAF1 停靠在 USP12 指结构域的远端,并诱导一系列结构变化,到达 USP12 催化裂口附近的关键泛素接触环。 WDR20 采用 7 叶片 β 螺旋桨组织,并通过 3 个相邻 β 螺旋桨叶片的顶面与 USP12 相互作用。 WDR20 与 USP12 泛素接触环的基部结合,并直接变构优化其催化裂口。李等人(2016) 得出结论,UAF1 和 WDR20 通过促进催化半胱氨酸的亲核攻击来增强 USP12 活性。
▼ 测绘
Hartz(2017) 根据 WDR20 序列(GenBank BC028387) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 WDR20 基因对应到染色体 14q32.31。