核蛋白，共济失调-毛细血管扩张基因座； NPAT

E14基因

HGNC 批准的基因符号：NPAT

细胞遗传学位置：11q22.3 基因组坐标（GRCh38）：11:108,157,215-108,222,638（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

今井等人（1996） 在染色体 11q22-q23 上的 ATM 基因（607585） 区域内发现了一个新基因，他们将其命名为 NPAT。该基因编码一个 1,427 个氨基酸的蛋白质，包含核定位信号和与 E2F 相关的细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶磷酸化的靶位点（参见 189971）。 NPAT 的计算分子量为 154,300 Da。它的丝氨酸和苏氨酸相对丰富。在所有检查的人体组织中都检测到了 NPAT 的 mRNA，并且其基因组序列在真核生物中高度保守，表明 NPAT 基因可能是细胞维持所必需的，即管家基因。今井等人（1996） 提出启动子区域可能由 ATM 和 NPAT 共享，并且每个基因都可能影响另一个基因的表达。他们表示，他们在 8 名日本共济失调毛细血管扩张症（AT; 208900） 患者中没有发现 NPAT 突变。

伯德等人（1996） 鉴定了一个基因，他们将其命名为 E14，作为紧邻 ATM 基因 5 素端的新型开放解读码组。 E14 基因的转录方式与 ATM 共有的启动子区域不同。伯德等人（1996）发现该基因普遍表达。他们检测到了 3 种 mRNA：最丰富的转录本为 6.25 kb，含量较低的转录本为 8.8 kb 和 5.3 kb。他们提出，两种最丰富的物种是使用替代性聚腺苷酸信号产生的。伯德等人（1996）报道丝氨酸和苏氨酸残基占E14蛋白的21%。他们的研究表明，E14/ATM 基因间区域具有双向启动子的功能。 Byrd 等人对 5 名共济失调毛细血管扩张症患者进行了研究（1996）没有获得E14编码区或启动子区突变的证据。

Chen 等人使用磁珠介导的直接 cDNA 选择程序和人胎脑 cDNA 表达文库（1997） 鉴定了 NPAT 基因，他们将其称为 CAND3，代表“第三个候选基因”。 Northern blot分析检测到CAND3转录物大小约为5.8 kb和4.6 kb。 4.6 kb 转录物编码推导的 1,175 个氨基酸的蛋白质。作者没有检测到 100 名共济失调毛细血管扩张症患者的 CAND3 基因突变。

▼ 基因结构

伯德等人（1996） 估计完整的 E14 基因长度超过 55 kb。他们描述了它的外显子/内含子边界；外显子 13 长 1,653 bp，占编码序列的三分之一以上。

陈等人（1997） 报道 CAND3 跨越大约 140 kb 的基因组 DNA。

今井等人（1997） 确定 NPAT 编码序列由 18 个外显子组成。

▼ 基因功能

进入 S 期的标志是组蛋白和细胞周期蛋白 E（CCNE1;123837）-CDK2（116953） 基因表达增加。大多数组蛋白基因是复制依赖性的并聚集在染色体 1q21 和 6p21 上。 NPAT 是一种细胞周期蛋白 E-CDK2 磷酸化底物，可促进进入 S 期，细胞周期蛋白 E 和 CDK2 的共表达可增强 NPAT 对细胞周期进程的影响（Zhao et al., 1998）。通过免疫荧光显微镜，赵等人（2000） 证明 NPAT 集中在 G0 和 G1 期与 6 号染色体组蛋白位点相关的 2 个位点，S 期与 1 号和 6 号染色体组蛋白位点相关的 4 个位点，以及与 6 号染色体组蛋白位点相关的 2 个位点处于G2期。瞬时转染和报告基因检测表明，通过细胞周期蛋白 E-CDK2 共表达增强的 NPAT 特异性刺激组蛋白 H4（H4F2，位于 1q21；142750）、H2B（参见 609904）和 H3（142780）基因转录，并​​使用亚型核苷酸-65和-40之间的特定共有启动子元件（SSCS）序列。染色质免疫沉淀（CHIP） 分析确定内源性 NPAT 和细胞周期蛋白 E 与组蛋白基因位点相关。因此，NPAT 提供了细胞周期机制和组蛋白基因转录激活之间的联系。

▼ 命名法

NPAT 是通过 AT 区域定位克隆鉴定的基因。基因产物可以被转运到细胞核中，因为它具有与核定位信号相匹配的序列。因此，该基因暂时被命名为 NPAT，代表“对应到共济失调毛细血管扩张基因座的核蛋白”（今井，1996）。