软骨粘附素; CHAD
HGNC 批准的基因符号:CHAD
细胞遗传学位置:17q21.33 基因组坐标(GRCh38):17:50,464,496-50,468,880(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
软骨粘附素(CHAD) 最初由 Larsson 等人描述(1991) 作为从牛软骨中分离出来的 36 kD 基质蛋白。它被证明可以介导软骨细胞-基质相互作用。对牛软骨细胞 mRNA 生成的 cDNA 的分析表明,软骨粘附素属于富含亮氨酸重复序列(LRR) 蛋白家族。在 LRR 蛋白中,软骨粘附蛋白与蛋白聚糖核心蛋白聚糖(125255)、双糖链蛋白聚糖(301870)、纤维调节蛋白(600245) 和 光蛋白聚糖(600616) 以及基质蛋白 PRELP(601914) 关系最为密切。这些分子中的每一个都存在于软骨的细胞外基质中,每一个都拥有 10 个相邻的 LRR 区域,两侧是二硫键结构域,并且每一个在 LRR 区域内都拥有用于 N 连接糖基化的共有基序。
格罗弗等人(1997) 使用基于 PCR 的技术克隆了人类 CHAD 基因的 cDNA。该基因编码 359 个氨基酸的蛋白质,其中前 21 个氨基酸代表推定的信号肽序列。它拥有 11 个富含亮氨酸的重复序列,两侧是富含半胱氨酸的区域。该 cDNA 具有 149 bp 的 5 引物非翻译区、包括终止密码子的 1,080 bp 编码区和终止于 Poly(A) 尾的 561 bp 3 引物非翻译区。该 cDNA 与 1.9 kb 的单个信使 RNA 杂交,该信使 RNA 存在于所有年龄段的软骨细胞中。
▼ 基因功能
阿卡提布等人(2013) 发现正常人类椎间盘(IVD) 中的 CHAD 是完整的,但在患有 IVD 退变的成人和青少年特发性脊柱侧凸中受损的椎间盘中,CHAD 是破碎的。碎片化的 CHAD 的数量与疾病的严重程度相关,但在所有情况下,CHAD 在 ile80 和 tyr81 之间特异性裂解。阿卡提布等人(2013) 发现胞外丝氨酸肽酶 HTRA1(602194) 产生的 CHAD 切割位点与原位存在的相同。在退化的成人和青少年脊柱侧凸样本中均观察到 HTRA1 蛋白,并且与正常椎间盘样本相比,HTRA1 蛋白有所升高。阿卡提布等人(2013) 得出结论,HTRA1 在退变椎间盘疾病的 CHAD 碎片中发挥作用。
▼ 基因结构
格罗弗等人(1997)确定CHAD基因含有3个外显子。
▼ 测绘
Grover 等人使用跨越 CHAD 基因的粘粒克隆(1997) 通过对人/仓鼠体细胞杂交体的 PCR 分析和荧光原位杂交,将该基因分配给 17q21.33。