MIR100-LET7A2 簇宿主基因,非编码; MIR100HG
脂肪生成下调转录 1; AGD1
长非编码 RNA,神经元,2
lncRNA-N2
HGNC 批准的基因符号:MIR100HG
细胞遗传学位置:11q24.1 基因组坐标(GRCh38):11:122,028,329-122,422,871(来自 NCBI)
▼ 说明
MIR100HG 被转录为多顺反子初级转录物,产生剪接的长基因间非编码 RNA(lincRNA)、短内含子编码序列(BLID; 608853) 和 3 个内含子 microRNA(miRNA):MIR100(613186)、MIR125B1(610104) 和LET7A2(MIRLET7A2;612142)。 MIR100HG lincRNA 在细胞增殖和分化中发挥作用(Emmrich et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
埃姆里奇等人(2014) 报道 MIR100HG 被剪接成 3.2 kb lincRNA。 MIR100HG 的内含子 3 产生 miRNA MIR100、LET7A2 和 MIR125B1 以及 BLID。定量 RT-PCR 分析检测到,与其他血细胞谱系相比,红细胞、造血干细胞(HSC) 和 B 细胞中 MIR100HG 高表达。与其他白血病细胞系相比,MIR100HG 以及同源 lincRNA 和 miRNA 宿主基因 MONC(MIR99AHG;615965) 在急性巨核细胞白血病(AMKL) 细胞系中高表达。然而,每个宿主基因中 LET7 旁系同源物的表达与剪接转录物的表达不相关,表明 LET7 的表达受到抑制。 RNA FISH 在 AMKL 细胞系的点状核分布中检测到 MONC 和 MIR100HG。
▼ 基因功能
埃姆里奇等人(2014) 发现,在具有高内源性 MIR100HG 表达的 AMKL 细胞系中敲低 MIR100HG,会降低细胞生长和集落形成能力,诱导细胞凋亡,并改变谱系特异性细胞表面标记。
▼ 基因结构
埃姆里奇等人(2014) 确定 MIR100HG 有 4 个外显子。 Intron 4 承载 MIR100、MIRLET7A2、BLID 和 MIR125B1。
▼ 测绘
埃姆里奇等人(2014) 报道 MIR100HG 基因定位于 11 号染色体。
Hartz(2014) 根据 MIR100HG 序列(GenBank AK021552) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 MIR100HG 基因对应到染色体 11q24.1。