CDKN1A 反义 DNA 损伤激活 RNA 的启动子; PANDAR

PANDA

HGNC 批准的基因符号：PANDAR

细胞遗传学位置：6p21.2 基因组坐标（GRCh38）：6:36,673,621-36,675,126（来自 NCBI）

▼ 说明

PANDAR 是一种长非编码 RNA（lncRNA），可调节参与 DNA 损伤凋亡反应的基因表达（Hung et al., 2011）。

▼ 克隆与表达

Hung 等人使用微阵列分析来识别 DNA 损伤后上调的转录本，然后进行人胎儿成纤维细胞 cDNA 文库的 5-prime 和 3-prime RACE（2011）克隆了 PANDAR，他们称之为 PANDA。 PANDA 大约长 1.5 个核苷酸，有帽，具有非常低的蛋白质编码潜力，并且在脊椎动物中保守。

▼ 基因功能

Hung 等人通过人胎肺成纤维细胞的定量 RT-PCR 进行了研究（2011） 发现 DNA 损伤诱导 CDKN1A（116899） 转录起始位点周围 5 个 lncRNA 的表达。其中之一 PANDA 与转录因子 NFYA（189903） 相互作用，并干扰其诱导促凋亡基因的能力。染色质免疫沉淀分析发现 p53（TP53; 191170） 结合在 CDKN1A 转录起始位点的上游，p53 的敲除可通过随后的 DNA 损伤抑制 PANDA 的诱导。 DNA 损伤后，p53 诱导 CDKN1A 和 PANDA，并且 PANDA 显示出更快的诱导动力学。功能获得性 p53 突变体（arg273 为 his，191170.0020）消除了 p53 诱导 CDKN1A 的能力，但保留了 p53 诱导 PANDA 的能力。通过短干扰RNA敲低人类胎儿成纤维细胞中的PANDA，增加了NYFA对靶基因的占据，诱导编码典型细胞凋亡激活剂的基因，并增加细胞对DNA损伤的敏感性。洪等人（2011） 得出结论，DNA 损伤诱导 p53 介导的 CDKN1A 和 PANDA 转录，分别介导细胞周期停滞和阻止凋亡基因的 NFYA 激活。

小竹等人（2016） 发现 U2OS 细胞中 PANDA 的敲低会降低 p53 蛋白水平，但不会降低 p53 mRNA。蛋白酶体抑制可防止 PANDA 敲低后 p53 的消耗，并且 p53 的这种消耗似乎与 NFYA 无关。

▼ 基因结构

洪等人（2011）确定PANDAR是一个单外显子基因。

▼ 测绘

洪等人（2011） 确定 PANDAR 位于 CDKN1A 转录起始位点上游约 5 kb 处，并且转录为 CDKN1A 的反义序列。

Hartz（2016） 根据 PANDAR 序列（GenBank JF803844） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 PANDAR 基因对应到染色体 6p21.2。