溶质载体家族25,成员38; SLC25A38
HGNC 批准的基因符号:SLC25A38
细胞遗传学定位:3p22.1 基因组坐标(GRCh38):3:39,383,370-39,397,351(来自 NCBI)
▼ 说明
SLC25A38 属于线粒体载体蛋白的 SLC25 家族(Haitina 等,2006)。
▼ 克隆与表达
Haitina 等人通过搜索 SLC25 家族成员的数据库(2006) 确定了 SLC25A38。推导的蛋白质含有303个氨基酸。
根西岛等(2009) 发现转铁蛋白受体(TFRC; 190010) 阳性红系细胞中 SLC25A38 基因高表达。
▼ 基因结构
海蒂娜等人(2006)确定SLC25A38基因有7个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Haitina 等人(2006) 将 SLC25A38 基因对应到 3 号染色体。他们将小鼠基因对应到 9 号染色体。
▼ 分子遗传学
Guernsey 等人在 18 名铁粒幼细胞贫血 2 型(SIDBA2; 205950) 患者中进行了研究(2009)鉴定了SLC25A38基因中的11种不同的纯合或复合杂合突变(参见例如610819.0001-610819.0005)。来自加拿大沿海省份的三名无关的阿卡迪亚血统患者携带相同的突变(R117X;610819.0001)。其他患者有北欧、希腊、西班牙和亚洲印度血统。该疾病对吡哆醇治疗无效。
▼ 动物模型
在斑马鱼胚胎中,根西岛等人(2009) 发现 2 个功能性 SLC25A38 直系同源物 Slc25a38a 和 Slc25a38b 的敲低会导致贫血表型。在酵母中,假定的直系同源物 YDL119c 的缺失导致呼吸缺陷,表明血红素生物合成受损。生化分析表明,酵母缺失菌株中细胞总 5-氨基乙酰丙酸(ALA) 的量减少了 6.7 倍,这表明 YDL119c 的缺失会损害体内 5-氨基乙酰丙酸的合成。根西岛等(2009) 假设 SLC25A38 通过将甘氨酸导入线粒体或通过线粒体内膜将甘氨酸交换为 ALA 来促进 ALA 的产生。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 贫血,铁粒细胞,2,吡哆醇难治性
SLC25A38,ARG117TER
Guernsey 等人在 3 名来自加拿大沿海省份的患有常染色体隐性铁粒幼细胞贫血 2(SIDBA2; 205950) 的无关患者中进行了研究(2009) 在 SLC25A38 基因的外显子 4 中发现了一个纯合的 726C-T 转变,导致 arg117 到 ter(R117X) 的取代。未受影响的父母是杂合突变,而在 145 名对照中未发现这种突变。所有患者均为阿卡迪亚血统,并在 4 个月大前出现严重贫血。骨髓抽吸物显示环状铁粒幼细胞。在 2 名患有铁粒幼细胞贫血的希腊同胞中也观察到了相同的纯合突变。
.0002 贫血,铁粒细胞,2,吡哆醇难治性
SLC25A38,2-BP DEL,698CT
Guernsey 等人在 2 名患有常染色体隐性铁粒幼细胞贫血 2(SIDBA2; 205950) 的无关患者中(2009) 在 SLC25A38 基因中发现了一个纯合 2-bp 缺失(698delCT),导致移码和提前终止。一名患者是西班牙裔,另一名是欧洲裔。在另外 4 名患有铁粒幼细胞贫血的患者中,在另外 4 名患有铁粒幼细胞贫血的患者中,在复合杂合性中观察到 698delCT 缺失与另一种推定的致病性突变(参见,例如,R187P, 610819.0003)。
.0003 贫血,铁粒细胞,2,吡哆醇难治性
SLC25A38,ARG187PRO
Guernsey 等人的 2 名北欧血统同胞患有常染色体隐性遗传铁粒幼细胞贫血 2(SIDBA2; 205950)(2009) 鉴定了 SLC25A38 基因中 2 个突变的复合杂合性:937G-C 颠换,导致 arg187-to-pro(R187P) 取代,以及 2-bp 缺失(698delCT; 610819.0002)。R187P 取代发生在跨膜螺旋 4 的保守残基中。
.0004 贫血,铁粒幼细胞,2,吡哆醇难治性
SLC25A38,IVS3AS,GA,-1
Guernsey 等人在一名 10 个月大的患有常染色体隐性铁粒幼细胞贫血 2(SIDBA2; 205950) 的亚裔印度女孩中进行了研究(2009) 鉴定了 SLC25A38 基因内含子 3 中的纯合 G 到 A 转变,导致剪接缺陷。
.0005 贫血,铁粒细胞,2,吡哆醇难治性
SLC25A38,LYS264TER
Guernsey 等人在 2 名患有常染色体隐性遗传性铁粒幼细胞贫血 2(SIDBA2; 205950) 的西班牙裔同胞中(2009) 鉴定了 SLC25A38 基因中的纯合 1167A-T 颠换,导致 lys264-to-ter(K264X) 取代。