生发中心相关、信号传导和运动; GCSAM
生发中心表达的转录本 2;GCET2
HGAL
HGNC 批准的基因符号:GCSAM
细胞遗传学位置:3q13.2 基因组坐标(GRCh38):3:112,120,839-112,133,248(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过基因表达谱分析,Lossos 等人(2003) 鉴定了一种人类 EST,其表达与弥漫性大 B 细胞淋巴瘤(DLBCL) 患者的临床结果密切相关。在微阵列上,EST 的表达在生殖细胞(GC) 淋巴细胞中较高,在记忆 B 细胞中中等,在外周血 B 细胞中相对较低。洛索斯等人(2003) 从分选的 GC 淋巴细胞和 Ramos 细胞系中克隆了全长 GCET2 cDNA,他们将其命名为人 GC 相关淋巴瘤(HGAL)。推导的 178 个氨基酸的细胞质蛋白与 Christoph 等人鉴定的小鼠 GC 表达的 M17 蛋白具有 51% 的序列同一性(1994)。人类和小鼠蛋白质均含有基于免疫受体酪氨酸的激活基序(ITAM)。Northern 印迹分析检测到 1.7 kb 主要转录本和 3.5 kb 转录本。RT-PCR 分析显示 GC 淋巴细胞中 HGAL 表达最高,其次是胸腺和脾脏。该蛋白在 GC 衍生的淋巴瘤中也高度表达。
Pan 等人使用微阵列分析来鉴定在正常 GC B 细胞和 GC B 细胞衍生的恶性肿瘤中高表达的基因(2003) 确定了 GCSAM,他们将其称为 GCET2。他们通过 DHL16 GC B 细胞衍生的淋巴瘤细胞系的 5-prime RACE 克隆了 GCET2。该转录本在其 3 引物末端包含 5 个聚腺苷酸化信号,推导的 178 个氨基酸蛋白具有一个推定的 N 端肉豆蔻酰化位点、2 个推定的 SH2 结合位点、一个 ITAM 样基序和一个推定的 PDZ 相互作用序列在C终点。它还具有多个酪氨酸磷酸化位点。DHL16 细胞的 Northern 印迹分析检测到 1.5 kb 处的主条带和 3.3 kb 处的次要条带。RT-PCR 显示从反应性扁桃体或脾脏显微解剖的 GC 中 GCSAM 表达最高,其次是 NALM-6 前 B 细胞系、静止扁桃体、胸腺和脾脏。在边缘区、套区以及其他淋巴瘤和白血病细胞系中检测到较低的表达。
▼ 基因功能
洛索斯等人(2003) 证明 HGAL 基因的表达是由白细胞介素 4(IL4; 147780) 在 B 细胞中特异性诱导的。
洛索斯等人(2003) 发现表达高水平 GCET2 mRNA 的 DLBCL 患者比该基因低表达的患者表现出显着更长的总生存期。
细胞形状和迁移由肌节蛋白细胞骨架的动态重塑控制,而肌节蛋白细胞骨架由小 GTP 酶的 Rho(参见 RHOA;165390)家族调节。Jiang 等人利用敲低和过度表达研究(2010) 发现 HGAL 调节 RHOA 信号通路。HGAL 与 Raji 淋巴瘤细胞和 HeLa 细胞膜和细胞质中的 RHOA 特异性鸟嘌呤核苷酸交换因子 PDZ-RHOGEF(ARHGEF11; 605708) 和 LARG(ARHGEF12; 604763) 共定位。免疫共沉淀分析显示HGAL直接结合PDZ-RHOGEF和LARG。结构域分析表明,HGAL 的 C 端 PDZ 结构域结合基序直接与 PDZ-RHOGEF 的催化 Dbl(311030) 同源(DH) 结构域结合。HGAL 诱导的 RHOA 及其下游效应子的激活导致淋巴瘤细胞运动的抑制和血清反应因子(SRF; 600589) 诱导转录激活。江等人(2010) 假设 HGAL 对 RHOA 信号传导的调节可能有助于将 GC 淋巴细胞限制在 GC 中,并将其与其他淋巴结区域隔离。
▼ 基因结构
洛索斯等人(2003) 确定 GCET2 基因包含 6 个外显子,跨度 11 kb。
潘等人(2003) 确定 GCSAM 基因包含 6 个外显子,跨度约为 15 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Lossos 等人(2003) 鉴定了染色体 3q13 上的 GCET2 基因。
潘等人(2003) 通过基因组序列分析将 GCSAM 基因定位到染色体 3q13.13。