泛素特异性蛋白酶 25; USP25
21 号染色体上的泛素特异性蛋白酶;USP21
HGNC 批准的基因符号:USP25
细胞遗传学位置:21q21.1 基因组坐标(GRCh38):21:15,729,982-15,880,064(来自 NCBI)
▼ 说明
泛素(191339) 是一种高度保守的 76 个氨基酸蛋白质,参与细胞内蛋白质分解、细胞周期调节和应激反应的调节。泛素通过多泛素链的分解从降解的蛋白质中释放出来,这是由泛素特异性蛋白酶(USP)(例如 USP25)介导的(Valero 等,1999)。
▼ 克隆与表达
Valero 等人通过使用先前对应到 21q11.2 的 STS 探针筛选胎儿大脑 cDNA 文库,并搜索 EST 数据库(1999) 获得了编码 1,087 个氨基酸的蛋白质(称为 USP25)的 cDNA。Northern 印迹分析在除睾丸之外的所有测试组织中检测到 2 个 4.6 至 6.5 kb 的 USP25 转录本,其水平处于低至中等水平,睾丸除外,睾丸中仅检测到较短的转录本。胎鼠脑的原位杂交分析显示其表达与增殖神经上皮细胞和有丝分裂后神经元有明显的相关性。在成年小鼠睾丸中也检测到高表达。
Groet 等人利用微卫星分析(2000) 在 34 例鳞状非小细胞肺癌中的 13 例中发现 21q11-q21 基因贫乏区存在等位基因丢失。通过 FISH 分析缩小等位基因丢失区域后,作者在剩余片段中使用外显子捕获并鉴定了 USP25 基因,他们将其称为“21 号染色体上的 USP”或 USP21。他们指出,大多数 USP 基因对应到 3p21,该位点显示肺癌中最常见的等位基因不稳定性和缺失。
通过序列分析和 RT-PCR,Valero 等人(2001) 鉴定了几种 USP25 剪接变体。除外显子 10A 外还包含外显子 10B 的转录物主要在睾丸中检测到,在小肠、脾脏和外周白细胞中含量较低。外显子 10B 引入内部终止密码子,导致蛋白质被截短为 361 个氨基酸。Valero 等人鉴定的转录本(1999),它含有外显子 19B,在除胎儿和成人肌肉和心脏之外的所有检查组织中均检测到。在胎儿和成人的肌肉和心脏中检测到除了外显子 19B 之外还包含外显子 19A 的转录物。外显子 19B 在蛋白质上添加了 38 个氨基酸。最后,在所有 24 个检查组织中均检测到缺乏外显子 19A 和 19B 的转录本。
穆尔梅斯特等人(2008) 指出,1,055 个氨基酸的 USP25 亚型包含一个 N 端泛素相关(UBA) 结构域,随后是 2 个泛素相互作用基序(UIM)、一个中央泛素 C 端水解酶(UCH) 结构域和一个卷曲结构域。 -线圈区域。
▼ 基因功能
格鲁特等人(2000) 表明 USP25 在体外切割泛素。
穆尔梅斯特等人(2008) 表明重组人 USP25 的 2 个 UIM 是 4-泛素链有效水解所必需的。SUMO3(602231) 对 USP25 的苏酰化会损害 4-泛素链的结合和水解。SUMO3 对 USP25 的亲和力比 SUMO1(601912) 更高。穆尔梅斯特等人(2008)在USP25中鉴定了2个SUMO化位点,一个在第一个UIM内,另一个直接邻近第二个UIM,并且第一个UIM附近的7个氨基酸SUMO相互作用基序对于SUMO3结合是必要且充分的。
▼ 基因结构
瓦莱罗等人(1999) 确定单拷贝 USP25 基因包含 25 个外显子,跨度超过 150 kb。瓦莱罗等人(2001) 在 USP25 基因中鉴定出 2 个新的选择性剪接外显子,即外显子 10B 和 19A。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Valero 等人(1999) 将 USP25 基因定位到染色体 21q11.2。