SEC1 家族结构域蛋白 1； SCFD1

SLY1，酿酒酵母，同源物；SLY1
RA410

HGNC 批准的基因符号：SCFD1

细胞遗传学位置：14q12 基因组坐标（GRCh38）：14:30,622,254-30,735,850（来自 NCBI）

▼ 说明

Sec1/Munc18（参见 602926）样（SM） 蛋白，例如 SCFD1，是可溶性外周膜蛋白，在不同的细胞内转运步骤中发挥作用，并与可溶性 N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体（SNARE；参见 604026） 直接相互作用）参与膜融合。SCFD1 和保守的低聚高尔基体束缚（COG） 复合体（参见 COG4, 606976）之间的相互作用是参与高尔基体内转移的 SNARE 配对所必需的，从而实现高尔基体到内质网（ER） 逆行转移（Laufman 等，2016）。 ，2009）。

▼ 克隆与表达

松尾等人（1997） 克隆了大鼠 Scfd1，他们将其称为 Ra410。推导的大鼠蛋白含有 637 个氨基酸，计算分子量约为 70 kD。Ra410 包含与囊泡转运相关因子相关的共有序列，与酵母囊泡转运相关因子 Sly1 有 38% 的同源性。对大鼠组织的 Northern 印迹分析发现，Ra410 在睾丸中表达最高，在心脏、肠道和大脑中表达较低。大鼠星形胶质细胞裂解物的分级显示 Ra410 主要存在于质膜组分中。免疫电子显微镜显示 Ra410 存在于与高尔基体相关的大囊泡中，但不在高尔基体本身中。

▼ 基因功能

Matsuo 等人使用 Northern blot 分析（1997）发现，培养的大鼠星形胶质细胞经历一段缺氧期后，在重新充氧后很快观察到Ra410 mRNA，在0.5至1小时内达到最大值，随后在24小时内下降至基线。Ra410 蛋白的表达遵循与 Ra410 mRNA 相似的模式。通过 NADPH 氧化酶活性测定来评估再氧合的大鼠星形胶质细胞中超氧化物的产生，表明 Ra410 是再氧合环境中的立即早期基因。当大脑中动脉短暂闭塞后大鼠脑星形胶质细胞中观察到 Ra410 表达时，体内证实了体外结果。

Laufman 等人在人类细胞中使用免疫共沉淀分析和 Pull-down 分析（2009） 发现 SCFD1（他们称之为 SLY1）通过 COG4 亚基与 COG 复合物相互作用（606976）。突变分析显示COG4的氨基酸1至84含有SLY1结合位点，其中残基glu53和glu71在SLY1结合中起着至关重要的作用。作者指出，COG4 的这个区域在整个进化过程中高度保守，酿酒酵母直向同源物除外。进一步分析表明，COG4-SLY1 相互作用是 SNARE 复合体蛋白共定位和复合体组装所必需的。COG4-SLY1 相互作用的破坏会损害参与高尔基体内转移的 SNARE 配对，从而减弱高尔基体到内质网的逆行转移。

▼ 测绘

Gross（2018） 根据 SCFD1 序列（GenBank AF110646） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 SCFD1 基因对应到染色体 14q12。