内质网-高尔基中间室蛋白 3; ERGIC3
能能蛋白和高尔基体蛋白 3
内质网相关蛋白,43-KD;ERP43 乳腺癌抗原 NY-BR-84
染色体 20 开放读码框 47;C20ORF47
HGNC 批准的基因符号:ERGIC3
细胞遗传学位置:20q11.22 基因组坐标(GRCh38):20:35,542,078-35,557,634(来自 NCBI)
▼ 说明
钙平衡的丧失或错误折叠的分泌蛋白的积累会导致内质网(ER) 应激,导致细胞死亡或诱导 ER 质量控制机制,包括未折叠的蛋白质反应。ERGIC3 在内质网应激诱导的细胞死亡和细胞生长中发挥作用(Nishikawa 等,2007)。
▼ 克隆与表达
Nishikawa等人通过扣除抑制杂交在正常条件或ER应激下开发的人肝癌细胞cDNA文库,然后进行EST数据库分析和人肝cDNA文库的PCR(2007) 克隆了 ERGIC3,他们将其称为 ERP43。推导的 383 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 43.2 kD。它在 N 末端附近有一个跨膜结构域,在 C 末端附近有一个可能的 ER 保留信号,以及 2 个潜在的 N-糖基化位点、4 个肉豆蔻酰化位点和几个推定的蛋白激酶位点。小鼠组织的定量 PCR 检测到大脑皮层、小脑、脊髓和肾脏的表达最高。蛋白质印迹分析检测到脊髓中的表达最高,其次是肾、肺、肝和髓质。免疫组织化学分析显示,脊髓神经细胞和肾近曲小管细胞中有显着的 Erp43 表达。共聚焦显微镜显示荧光标记的 ERP43 的表达模式与 ER 标记蛋白的表达模式很大程度上重叠。HEK293 细胞的差异溶解和蛋白酶处理表明荧光标记的 ERP43 的 23 个 N 端氨基酸位于 ER 腔内。通过蛋白质印迹分析,ERP43 的表观分子质量为 72 kD。
▼ 基因功能
通过交联 HepG2 细胞的免疫沉淀分析,Breuza 等人(2004) 表明,与 ERGIC2(612236) 一样,ERGIC1(617946) 与 ERGIC3 相互作用。在仅用 ERGIC3 转染并用布雷菲德菌素 A(BFA) 处理的细胞中,会导致循环蛋白在 ER-高尔基体中间室中积累,ERGIC3 在 ER 中积累。然而,当ERGIC1与ERGIC3共转染时,BFA处理后ERGIC1和ERGIC3都在高尔基体中积累。通过RNA干扰沉默ERGIC1或ERGIC2会缩短ERGIC3的半衰期,而沉默ERGIC2或ERGIC3对ERGIC1的表达没有影响,表明ERGIC1稳定了ERGIC2-ERGIC3复合物。同时消耗 ERGIC1 和 ERGIC3 并不影响蛋白质分泌,表明这些蛋白质对于囊泡转移不是必需的。
西川等人(2007) 发现 ER 应激上调 HepG2 人肝癌细胞中的 ERP43。ERP43 的过度表达增加了增殖率和细胞对 ER 应激诱导细胞毒药物的抵抗力。通过 HEK293 细胞中的短干扰 RNA 敲低 ERP43,可降低生长速度并增加细胞对 ER 应激诱导剂的敏感性。
使用实时 PCR,Zhang 等人(2013) 发现与对照组相比,ERGIC3 和 microRNA MIR490-3p(616972) 在肝细胞癌组织和细胞中表达上调。MIR490-3p 或 ERGIC 在人类癌症和非癌细胞系中的过度表达增加了细胞活力、集落形成潜力、细胞迁移和侵袭以及指示上皮间质转化的基因表达。MIR490-3p 或 ERGIC3 的敲低具有相反的效果。张等人(2013) 在 ERGIC3 转录物的 3-prime UTR 中鉴定出一个保守的 MIR490-3p 互补位点。MIR490-3p 直接上调 ERGIC3 mRNA 和蛋白水平以及 ERGIC3 报告基因的活性。ERGIC3 3-prime UTR 中假定的 MIR490-3p 结合位点的突变消除了这些效应。沉默 AGO2(606229) 还可消除 MIR490-3p 对 ERGIC3 的上调。
▼ 测绘
Hartz(2016) 根据 ERGIC3 序列(GenBank AF077030) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ERGIC3 基因对应到染色体 20q11.22。