溶质载体家族 10(钠/胆汁酸协同转运蛋白家族),成员 4; SLC10A4
HGNC 批准的基因符号:SLC10A4
细胞遗传学位置:4p11 基因组坐标(GRCh38):4:48,483,343-48,489,526(来自 NCBI)
▼ 说明
SLC10A4 是一种蛋白酶激活的转运蛋白,参与胆汁酸的摄取(Abe 等人,2013)。
▼ 克隆与表达
Splinter 等人使用生物信息学方法(2006) 鉴定了人类 SLC10A4,它编码预测的 437 个氨基酸的蛋白质,计算出的分子量为 46.5 kD。SLC10A4 包含 8 个假定的跨膜结构域和 3 个潜在的 N 连接糖基化位点。人 SLC10A4 蛋白与其大鼠和小鼠直向同源物分别具有 89% 和 73% 的氨基酸同一性,与人 SLC10 家族的其他成员具有 24% 至 30% 的同一性。RT-PCR 分析鉴定了人 T84 结肠细胞、H69 人胆管细胞和人胆管癌细胞系中的 SLC10A4 转录本。人体组织的 Northern blot 分析显示,SLC10A4 在脑、胎盘和胰腺中表达最高,在肝脏和肾脏中表达较低。主要的 SLC10A4 转录本为 2.4 kb,但胰腺表达了一个额外的 0.7 kb 的重要转录本,肝脏和肾脏表达了一个额外的 1.4 kb 的次要转录本。转染的 CHO 细胞的免疫荧光分析表明,表位标记的 SLC10A4 主要定位于细胞内区室,并在较小程度上定位于质膜上。免疫印迹分析在转染的 CHO 细胞中检测到 49-kD 蛋白质。
Abe 等人使用蛋白质印迹分析(2013) 在 TE671 人髓母细胞瘤细胞中检测到 SLC10A4 为大约 90 kD 和 35 kD 的蛋白质。进一步分析表明,90-kD 蛋白代表 SLC10A4 的糖基化形式,35-kD 蛋白代表被凝血酶切割后的 SLC10A4 C 末端(F2;176910)。免疫荧光分析检测到TE671细胞质膜上有SLC10A4。
通过免疫荧光分析,Schmidt 等人(2015) 表明 SLC10A4 在人和小鼠神经元细胞系的囊泡结构中表达。该蛋白沿着长轴突样生长被检测到,表明 SLC10A4 蛋白按照分化神经元细胞的突触方向进行分类。截短分析表明,SLC10A4 的 C 末端负责蛋白质的囊泡分选。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 SLC10A4 序列(GenBank BC012048) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SLC10A4 基因对应到染色体 4p11。
▼ 基因功能
阿部等人(2013) 发现凝血酶的裂解激活了 SLC10A4,导致 TE671 细胞对牛磺胆酸和石胆酸的摄取增加,并增加了细胞死亡。
Popova 和 Alafuzoff(2013) 使用免疫组织化学方法表明,SLC10A4 在老年人大脑中普遍表达,特别是在胆碱能和单胺能神经元以及外侧膝状体中。在阿尔茨海默病(AD; 104300) 患者中,随着 AD 相关病理严重程度的增加,经内嗅皮层中的 SLC10A4 表达降低。
Schmidt 等人利用体外转移研究(2015)表明SLC10A4不转运各种神经递质和神经调节剂。此外,他们发现在转染的 HEK293 细胞中,凝血酶处理不能激活 SLC10A4 转运活性。