程序性细胞死亡2; PDCD2
锌指 MYND 结构域蛋白 7;ZMYND7
HGNC 批准的基因符号:PDCD2
细胞遗传学定位:6q27 基因组坐标(GRCh38):6:170,575,295-170,584,637(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
程序性细胞死亡是有机体发育的重要机制。这种现象可以在未成熟的胸腺细胞中得到证实,当用糖皮质激素(Wyllie,1980)或辐射(Sellins 和 Cohen,1987)处理时,未成熟的胸腺细胞会经历程序性细胞死亡。未成熟胸腺细胞中的程序性细胞死亡可以通过转录或翻译抑制剂来预防(Cohen 和 Duke,1984)。这些发现意味着某些类型的蛋白质是执行细胞死亡程序所必需的。已知一些基因在程序性细胞死亡过程中特异性表达。在大鼠中,在未成熟胸腺细胞中短暂表达的 Rp8 基因被认为与程序性细胞死亡有关(Owens 和 Cohen,1992)。川上等人(1995)从胎肺cDNA文库中分离出与大鼠Rp8高度同源的人类cDNA克隆。该基因的 cDNA 命名为 PDCD2,包含一个 1,032 bp 的开放解读码组,编码 344 个氨基酸;它与大鼠Rp8的DNA序列有81%的同一性,氨基酸序列有83%的同一性。PDCD2 基因在所有检查的人体组织中都有表达。
▼ 基因功能
BCL6(109565) 编码 Kruppel 型锌指转录阻遏蛋白。该基因的重排在各种淋巴瘤中很常见,尤其是大细胞 B 细胞类型。BCL6 核磷蛋白在多种组织中表达,尤其在淋巴结生发中心表达上调。BCL6 的锌指以序列特异性方式结合 DNA。为了确定 BCL6 抑制作用的目标,Baron 等人(2002) 使用 BCL6 和单纯疱疹病毒激活结构域的融合蛋白(含有锌指但不含阻遏结构域)与瞬时转染的 B 细胞系中内源性 BCL6 的结合竞争,然后进行消减杂交以选择性扩增差异表达的序列。他们发现 PDCD2 基因是 BCL6 抑制的目标。如上所述,PDCD2 是 Rp8 的人类同源物,Rp8 是一种与胸腺细胞程序性细胞死亡相关的大鼠基因。免疫组织化学证明了人扁桃体中 BCL6 和 PDCD2 表达之间预期的反比关系。结果提出了BCL6可能通过其对PDCD2的抑制作用来调节细胞凋亡的可能性。BCL6 失调可能导致 PDCD2 持续下调、细胞凋亡减少,从而导致含有 BCL6 的淋巴瘤细胞积聚。
Baron 等人使用 EMSA(2007) 表明 BCL6 直接结合 PDCD2 启动子并抑制其转录。B 细胞淋巴瘤系中小干扰 RNA 介导的 BCL6 敲低导致 PDCD2 蛋白表达增加。过度表达人类 BCL6 的小鼠的 Pdcd2 水平最低。免疫组织化学分析表明,人 B 和 T 淋巴瘤中 PDCD2 和 BCL6 的表达呈负相关。巴伦等人(2007) 得出结论,PDCD2 是 BCL6 的靶标,并且 BCL6 抑制 PDCD2 在某些人类淋巴瘤的发病机制中很重要。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Kawakami 等人(1995) 将 PDCD2 基因对应到 6q27。Trachtulec 和 Forejt(2001) 将 Pdcd2 基因定位到小鼠 17 号染色体。该基因和其他小鼠 17 号染色体基因的直向同源物位于秀丽隐杆线虫的 III 号染色体上,从而定义了脊椎动物和无脊椎动物之间保守的同线性群。在人类、小鼠和蛇中,PDCD2 和 TBP(600075) 基因尾对尾相邻。TBP 和 PDCD2 基因在果蝇中也是连锁的,并且它们在人类、小鼠、线虫和粟酒裂殖酵母中是同线性的。