锌指蛋白 689; ZNF689
肝细胞癌 1 中转录相关蛋白上调;TIPUH1
HGNC 批准的基因符号:ZNF689
细胞遗传学定位:16p11.2 基因组坐标(GRCh38):16:30,602,558-30,610,775(来自 NCBI)
▼ 说明
ZFP689 是一种 Kruppel 型锌指蛋白(Silva 等,2006)。
▼ 克隆与表达
Silva 等人通过微阵列分析来识别肝细胞癌(HCC; 114550) 中上调的转录本,然后进行数据库分析和睾丸 cDNA 文库的 5-prime RACE(2006) 克隆了人类 ZNF689,他们将其称为 TIPUH1。推导的 500 个氨基酸蛋白包含串联的 N 端 Kruppel 相关框(KRAB) 结构域和 12 个 C 端 Kruppel(C2H2) 型锌指。ZNF689 与其小鼠和大鼠直系同源物具有约 83% 的氨基酸同一性。对 16 个成人组织的 Northern 印迹分析仅在睾丸和胎盘中检测到 2.7 kb ZNF689 转录物。免疫印迹分析显示转染的 HEK293 细胞中存在 56 kD ZNF689 蛋白。转染的 HCC 和肝癌细胞的免疫细胞化学分析显示 ZNF689 的核定位。RT-PCR 分析证实,与相应的非癌性肝组织相比,在检查的 10 个 HCC 中有 7 个中 ZNF689 表达上调。ZNF689 在所有 7 种检测的人血肿细胞系中也上调。微阵列分析表明,ZNF689 在乳腺癌、结肠癌、膀胱癌或前列腺癌中并未上调。
▼ 基因功能
席尔瓦等人(2006) 发现人 ZNF689 在 NIH3T3 成纤维细胞中的表达使细胞能够在软琼脂中形成集落,这表明 ZNF689 转化细胞并赋予细胞贴壁依赖性生长。通过小干扰 RNA 敲低 HepG2 和其他 HCC 细胞中的 ZNF689 会降低细胞活力。免疫沉淀和质谱分析显示 ZNF689 与转录中间蛋白 TIF1-β(TRIM28; 601742) 以及 HNRNPF(601037)、HNRNPU(602869) 和核仁素(NCL; 164035) 相互作用,所有这些蛋白都参与其中在 mRNA 或核糖体 RNA 加工中。
▼ 基因结构
席尔瓦等人(2006) 报道 ZNF689 基因包含 3 个外显子,跨度 7 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Silva 等人(2006) 将 ZNF689 基因定位到染色体 16p11.2。