牙发生相关磷酸蛋白; ODAPH
4 号染色体开放解读码组 26;C4ORF26
HGNC 批准的基因符号:ODAPH
细胞遗传学位置:4q21.1 基因组坐标(GRCh38):4:75,556,066-75,565,893(来自 NCBI)
▼ 说明
据预测,C4ORF26 在牙釉质矿化中发挥作用(Parry 等人,2012)。
▼ 克隆与表达
帕里等人(2012) 在筛选中鉴定出 C4ORF26,以识别釉质形成不全症中突变的基因(参见 614832)。推导的 130 个氨基酸蛋白具有 N 端信号肽和 2 个在许多哺乳动物物种中保守的基序。它还具有 10 个可能的磷酸化位点。帕里等人(2012) 鉴定了 C4ORF26 的剪接变体,它将移码引入阅读框。这两种蛋白质仅共享信号肽,没有其他相似之处。在一组 20 个人体组织(不包括牙釉质器官)中,RT-PCR 仅在胎盘中检测到高表达。在其他几个组织中检测到 2 个转录物的非常弱的表达。C4ORF26 的大鼠直系同源物在分泌期和成熟期牙釉质器官中表达,但在心脏、肾脏或脾脏中不表达。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Parry 等人(2012) 将 C4ORF26 基因对应到染色体 4q21.1。
▼ 基因功能
Parry 等人使用体外矿物成核测定法(2012) 发现对应于 C4ORF26 磷酸化 C 末端的合成肽可促进羟基磷灰石成核并支持晶体生长。非磷酸化肽没有活性。
▼ 分子遗传学
Parry 等人在 9 个患有发育不全型釉质发育不全的家庭中(2012) 鉴定了 C4ORF26 基因的纯合或复合杂合突变(614829.0001-614829.0005)。预计所有突变都会导致 C4ORF26 功能丧失。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 成釉不全,低成熟型,IIA4
ODAPH,ARG77TER
Parry 等人在阿曼家族(AI-46) 的 7 名患有釉质形成不全(AI2A4; 614832) 的成员中(2012) 鉴定了 C4ORF26 基因中的纯合 229C-T 转变,导致 arg77 到 ter(R77X) 的取代。在 160 个种族匹配的对照和 78 个巴基斯坦对照或 1000 个基因组计划数据库的 1,135 个样本中没有发现这种突变。帕里等人(2012) 在另外 3 个患有 AI 的阿曼家族中发现了该突变(AI-47、AI-51 和 AI-67)。
.0002 成釉不全,低成熟型,IIA4
ODAPH,CYS43TER
在一个患有低矿化釉质生成不全症(AI2A4; 614832) 的伊拉克家庭(AI-1) 中,Parry 等人(2012) 鉴定了 C4ORF26 基因中的纯合 129C-A 颠换,预计会导致 cys43-to-ter(C43X) 取代。在 110 名土耳其人、50 名约旦人或 78 名巴基斯坦人对照者或千人基因组计划数据库的 1,131 个样本中未发现该突变。
.0003 成釉不全,发育不全型,IIA4
ODAPH,IVS1AS,AT,-2
在患有釉质发育不全(AI2A4;614832)的叙利亚家庭(AI-42)中,Parry 等人(2012) 在 C4ORF26 基因(68-2A-T) 内含子 1 的剪接受体位点中发现了纯合突变。在 110 名土耳其人、50 名约旦人或 78 名巴基斯坦人对照者或千人基因组计划数据库的 1,135 个样本中未发现该突变。
.0004 成釉不全,低成熟型,IIA4
ODAPH,TRP106TER(rs146645381)
Parry 等人在来自美国 2 个家族(AI-102 和 AI-103)的患有釉质发育不全(AI2A4;614832)的受影响个体中(2012) 发现了 C4ORF26 基因中 2 个突变的复合杂合性:318G 到 A 的转变导致 trp106 到 ter(W106X) 取代(rs146645381),以及导致移码和提前终止的 indel(614829.0005)。在 91 个欧洲对照或 1000 个基因组计划数据库的 1,133 个样本中未发现 W106X 突变。
.0005 成釉不全,发育不全型,IIA4
ODAPH,6-BP DEL/16-BP INS,NT51
Parry 等人在来自美国 2 个家族(AI-102 和 AI-103)的患有釉质发育不全(AI2A4;614832)的受影响个体中(2012) 发现了 C4ORF26 基因中 2 个突变的复合杂合性:trp106-to-ter 取代(614829.0004) 和导致移码和提前终止的 indel(Val18CysfsTer23)。帕里等人(2012) 在另一个患有 AI 的美国家庭(AI-108) 中受影响的个体中发现了纯合性插入缺失突变。在 91 个欧洲对照或 1000 个基因组计划数据库的 1,139 个样本中未发现插入缺失变体。