HOXD 反义生长相关长非编码 RNA; HAGLR

长基因间非编码 RNA HAGLR
lincRNA HAGLR
MDGT

HGNC 批准的基因符号:HAGLR

细胞遗传学位置:2q31.1 基因组坐标(GRCh38):2:176,173,189-176,188,958(来自 NCBI)

▼ 说明

长基因间非编码 RNA(lincRNA),例如 HAGLR,是由不与蛋白质编码基因重叠的基因产生的,并且作为细胞过程的关键调节因子发挥作用(Sauvageau et al., 2013)。

▼ 克隆与表达

索瓦乔等人(2013) 报道小鼠 Haglr,他们称之为 Mdgt,是从与同源框基因 Hoxd1(142987) 共享的双向启动子转录而来的 443 bp lincRNA。另一个非编码转录物位于 Mdgt 的内含子内,似乎是从相反的链表达的。对各种成年小鼠组织和细胞类型的 RNA 测序分析表明,Mdgt 在睾丸中高表达,在脑、肾、结肠和骨骼肌中中等表达。LacZ 染色还揭示了胃和胸腺中 Mdgt 的表达。

▼ 测绘

Gross(2018) 根据 HAGLR 序列(GenBank BC030713) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 HAGLR 基因对应到染色体 2q31.1。

索瓦乔等人(2013) 报道 Haglr 基因定位于小鼠 2 号染色体,其第一个外显子距 Hoxd1 转录起始位点 84 bp。

▼ 动物模型

索瓦乔等人(2013) 发现小鼠中 Mdgt 的纯合缺失会导致小鼠活力降低,并在出生后 2 周内死亡。与野生型相比,Mdgt -/- 幼崽表现出严重的生长迟缓,雌性幸存者的生长迟缓持续长达 10 周,雄性幸存者的生长迟缓持续长达 8 周。