E1A 结合蛋白,400-KD; EP400
p400
CAGH32
KIAA1498
KIAA1818
多米诺骨牌,果蝇,含有
三核苷酸重复基因 12 的同源物,以前;TNRC12,以前
HGNC 批准基因符号:EP400
细胞遗传学位置:12q24.33 基因组坐标(GRCh38):12:131,949,942-132,080,460(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
福克斯等人(2001) 鉴定了一种腺病毒 E1A 癌蛋白结合复合物,该复合物对于 E1A 介导的转化至关重要。其核心成分是 SWI2/SNF2 相关的 400 kD 蛋白质,他们将其称为 p400。通过离子阱质谱法对 p400 带进行序列分析,鉴定出 5 种肽,这些肽全部对应到 Margolis 等人鉴定的部分 cDNA 克隆 (CAGH32)(1997) 筛选具有长 CAG 三核苷酸重复的 cDNA。福克斯等人(2001)通过cDNA文库筛选、RACE以及与小鼠同系物片段的同源比对获得了编码p400的全长cDNA。预测的 3,124 个残基 p400 蛋白包含独特的特征基序,构成 SWI2/SNF2 家族成员的 DNA 依赖性 ATP 酶/解旋酶样结构域。该结构域的一个不寻常特征是存在大约 500 个残基的接头序列,将其分为 2 个子片段。RT-PCR 和原位杂交分析表明 p400 普遍表达。
▼ 基因功能
福克斯等人(2001)发现p400结合有缺陷的E1A突变体在转化中也有缺陷。某些 p400 片段部分挽救了这种表型,强调了 E1A-p400 复合物形成在 E1A 转化过程中的作用。此外,E1A 和 MYC(190080) 各自改变了 p400 复合物的亚基组成,这意味着生理 p400 复合物的形成有助于转化抑制。
NuA4 组蛋白乙酰转移酶(HAT) 复合物负责酵母中组蛋白 H4(参见 602822)和 H2A(参见 613499)N 末端尾部的乙酰化。其催化亚基 Esa1 与人 TIP60(HTATIP; 601409) 同源。Doyon 等人使用亲和纯化、蛋白质印迹分析、细胞分级分离、免疫沉淀和质谱分析(2004) 发现 TIP60 及其剪接变体 TIP60B/PLIP 是多亚基 NuA4 复合物的一部分,在多种人类细胞系中具有 HAT 活性。他们鉴定出 12 个酵母 NuA4 亚基中的 11 个与人类同源,其中包括 EP400,他们称之为多米诺骨牌。
Fazzio 等人在小鼠胚胎干(ES) 细胞中使用 RNA 干扰(2008) 发现 Tip60-p400 HAT 和核小体重塑复合物的 7 个成分(包括 p400)中的任何一个的耗尽都会导致相同的表型。与在球形 3 维集落中生长的正常 ES 细胞不同,耗尽任何 7 个 Tip60-p400 HAT 成分的 ES 细胞表现出扁平且拉长的形态,具有单层生长和减少的细胞与细胞接触。这些敲低细胞继续循环,S期细胞减少,G2期细胞增加。Tip60-p400 HAT 成分敲低的效果是 ES 细胞所特有的,因为在小鼠胚胎成纤维细胞中敲低后观察到的变化可以忽略不计。p400 定位于小鼠 ES 细胞中沉默基因和活性基因的启动子,这种定位依赖于组蛋白 H3(参见 602810)lys4 三甲基化(H3K4me3)。敲低 Tip60 或 p400 后 ES 细胞中失调的基因富含发育调节因子,并且与敲低转录因子 Nanog(607937) 后 ES 细胞中失调的基因显着重叠。Nanog 的耗尽减少了 p400 与靶启动子的结合,而不影响 H3K4me3 水平。法齐奥等人(2008) 得出结论,Tip60-p400 HAT 复合物整合来自 Nanog 和 H3K4me3 的信号来调节 ES 细胞中的基因表达。
Smith 等人使用全基因组小干扰 RNA 筛选和二次筛选(2010) 鉴定了 96 个细胞基因,这些基因有助于病毒 E2 蛋白介导的人乳头瘤病毒(HPV) 长控制区的抑制,该控制区控制病毒癌基因的表达。除了 E2 结合蛋白 BRD4(608749) 之外,其他相关基因还包括去甲基酶 SMCX(KDM5C; 314690) 和 EP400(NUA4/TIP60 组蛋白乙酰转移酶复合物的一个组成部分)。史密斯等人(2010) 得出结论,HPV E2 使用多种细胞蛋白来抑制其癌基因的表达。
奥布里等人(2014) 报道了作为 H2A.Z(142763) 特异性伴侣的人类蛋白 ANP32E(609611) 的鉴定和表征,并表明 ANP32E 是假定的 H2A.Z 组蛋白交换复合体 p400/TIP60(KAT5; 601409)。ANP32E 通过称为 H2A.Z 相互作用结构域(ZID) 的基序与 H2A.Z 对接结构域的短区域相互作用。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Margolis 等人(1997) 将 EP400 基因定位到 12q24.33。