无名指蛋白 4; RNF4
HGNC 批准的基因符号:RNF4
细胞遗传学定位:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:2,469,106-2,515,857(来自 NCBI)
▼ 说明
RNF4 是一种 SUMO(参见 601912)依赖性泛素 E3 连接酶。它在 DNA 去甲基化中发挥作用,是有效碱基切除修复和维持基因组稳定性所必需的(Hu 等人总结,2010)。
▼ 克隆与表达
RING Finger 基序是许多转录调节蛋白中发现的特殊锌指结构域。在分析 2 杂交筛选期间分离的“自身阳性”克隆时,Chiariotti 等人(1998) 鉴定了一个包含环指基序的新型小鼠序列。相应的全长人类 cDNA 编码一个 190 个氨基酸的多肽,包含一个典型的环指基序和 2 个假定的核定位信号。观察到的体外翻译蛋白的大小为 31 kD,而预测的分子量为 21.3 kD。Northern 印迹分析检测到 3 kb mRNA 在睾丸中高表达,而在所有其他测试的成人组织中表达较低。
胡等人(2010) 指出 RNF4 包含 4 个 N 端 SUMO 相互作用基序和一个对泛素化活性至关重要的 C 端 RING 指基序。
▼ 基因功能
在急性早幼粒细胞白血病(APL;612376) 中,RARA(180240) 基因几乎总是与 PML 基因(102578) 融合。砷可以有效治疗 APL,砷会诱导小蛋白修饰剂 SUMO(参见 SUMO2;603042)与 PML 缀合,导致 PML 和 PML-RARA 融合蛋白泛素化和蛋白酶体降解。Tatham 等人利用 RNA 干扰(2008) 证明 RNF4 是砷诱导的 PML 降解所必需的。仅当 PML 与 SUMO2 缀合时,RNF4 才泛素化 PML。体外结合研究表明,大鼠 Rnf4 主要结合聚 SUMO2,并且这种结合是由 Rnf4 N 末端区域中的 4 个保守串联 SUMO 相互作用基序(SIM) 介导的。HeLa 细胞中 RNF4 的敲低导致砷无法诱导 PML 降解以及 SUMO 修饰的 PML 在细胞核中积累。塔瑟姆等人(2008) 得出结论,RNF4 是 SUMO 特异性 E3 泛素连接酶。
Hu 等人使用小鼠和人类表达 cDNA 文库来鉴定编码 DNA 去甲基酶的克隆(2010) 确定了 RNF4。RNF4 在转染人类细胞系后增加了几种甲基化测试质粒的表达。去甲基化孤立于DNA复制和细胞增殖。内源性碱基切除修复酶 TDG(601423) 和 APE1(107748) 与 HEK293 细胞中的 RNF4 相互作用。HEK293 细胞中 TDG 或 APE1 的敲低消除了 RNF4 介导的甲基化测试质粒的去甲基化。相反,RNF4 过表达显着增加了 TDG 和 APE1 的酶活性,并增加了它们的 G:T 错配修复效率。胡等人(2010) 得出结论,RNF4 可能作为支架将碱基切除修复酶聚集在一起,以实现有效的 DNA 修复。
▼ 基因结构
基亚里奥蒂等人(1998) 确定 RNF4 基因由 8 个外显子组成,跨度约为 47 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Chiariotti 等人(1998) 发现 RNF4 是靠近 HTT 基因(613004) 的 4 号染色体特征明确区域的一部分。RNF4基因定位于染色体4p16.3,大约500kb的HTT端粒。
▼ 动物模型
胡等人(2010) 发现敲除小鼠 Rnf4 会导致胚胎死亡。Rnf4 -/- 胚胎发育迟缓,无法发育,并在胚胎第 14 天至 15 天死亡时表现出心室间隔缺损和心功能不全。对 Rnf4 -/- 胚胎成纤维细胞的检查显示整体 DNA 高甲基化和 DNA 损伤升高。Rnf4+/-动物没有表现出明显的表型。