卷曲螺旋结构域含有蛋白质 113; CCDC113
HGNC 批准的基因符号:CCDC113
细胞遗传学定位:16q21 基因组坐标(GRCh38):16:58,249,936-58,283,836(来自 NCBI)
▼ 说明
CCDC113 是有效纤毛发生所需的中心粒卫星蛋白(Firat-Karalar 等,2014)。CCDC113 和 CCDC96(619347) 形成连接纤毛中不同轴丝复合体的复合体,并且是适当纤毛跳动所必需的(Bazan et al., 2021)。
▼ 克隆与表达
Firat-Karalar 等人通过在数据库中搜索与牛 Ccdc113 相似的序列(2014) 鉴定出人类 CCDC113。EST数据库分析显示CCDC113在人体组织中广泛表达。荧光标记的 CCDC113 定位于转染的 HeLa 细胞中的中心粒卫星。数据库分析在大多数纤毛真核生物中检测到 CCDC113 的直系同源物,但在秀丽隐杆线虫中未检测到。
通过数据库分析,Bazan 等人(2021) 将 CCDC113 鉴定为一种进化上保守的卷曲螺旋蛋白,其直向同源物存在于组装活动纤毛的生物体中,包括人类。数据库分析表明,CCDC116 在含有组装活动纤毛细胞的小鼠和人体器官(例如睾丸和气管)中高表达。表位标记的 Ccdc116 定位于四膜虫的纤毛,但不定位于纤毛尖端。
▼ 基因功能
菲拉特-卡拉拉尔等人(2014) 发现中心粒卫星蛋白 PCM1(600299) 的敲低导致 CCDC113 从卫星重新定位到中心体。酵母 2 杂交和免疫沉淀分析表明,除了 PCM1 之外,CCDC113 还与中心粒蛋白 HAP1(600947) 相互作用。在人 RPE1 细胞中,短发夹 RNA 介导的 CCDC113 敲低显着减少了纤毛形成,并导致 PCM1 阳性卫星在整个细胞质中分散。通过荧光标记的小鼠 Ccdc113 的表达来挽救表型。
通过质谱分析,Bazan 等人(2021) 确定 Ccdc113 和 Ccdc96 是四膜虫纤毛中轴丝复合体的组成部分。冷冻电子断层扫描显示,Ccdc96 和 Ccdc113 在 3 个纤毛结构、径向辐条(RS)、连接蛋白-动力蛋白调节复合体(NDRC) 和内动力蛋白臂(IDA) g 之间形成复合体,将 RS3 的基部连接到 RS3 的尾部。 IDA g 和国家发改委。敲除分析表明,Ccdc113 和 Ccdc96 是四膜虫正常纤毛跳动所必需的。Ccdc96 和 Ccdc113 似乎孤立转运至四膜虫纤毛,但它们的轴丝组装和功能活动在纤毛中相互依赖。
▼ 测绘
Hartz(2014) 根据 CCDC113 序列(GenBank AF161550) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CCDC113 基因对应到染色体 16q21。