SIN3-HDAC 复合相关因子; SINHCAF
序列相似性60的家庭,成员A;FAM60A
HGNC 批准基因符号:SINHCAF
细胞遗传学位置:12p11.21 基因组坐标(GRCh38):12:31,280,584-31,326,150(来自 NCBI)
▼ 说明
FAM60A 是 SIN3(607776)-组蛋白脱乙酰酶(HDAC;参见 HDAC1;601241) 复合物的一个亚基,在转录抑制中发挥作用(Munoz et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Smith 等人通过对 HEK293 细胞中用 SIN3-HDAC 复合物纯化的肽片段进行质谱分析,然后进行数据库分析(2012) 确定了 FAM60A。对几种人类细胞系的蛋白质印迹分析检测到 FAM60A 的可变表达,其表观分子质量约为 25 kD。数据库分析表明,大多数后生动物中至少存在 1 个 FAM60A 直系同源物,但线虫中则不然。在 FAM60A N 端和 C 端结构域中观察到最高的保守性。
穆尼奥斯等人(2012) 表明推导的 221 个氨基酸蛋白具有 N 端 GATA(参见 305371)样锌指。
▼ 基因功能
史密斯等人(2012) 发现用表位标记的 FAM60A 纯化的蛋白质复合物表现出针对乙酰化核心组蛋白的脱乙酰酶活性。针对 FAM60A 或核心 SIN3-HDAC 成分 SDS3(608250) 的小干扰 RNA 减少了 2 种人类细胞系中的细胞-细胞接触,并导致细胞形态和迁移的类似变化,但不导致增殖。FAM60A 敲低细胞的微阵列分析揭示了与细胞形态、粘附、迁移、上皮间质转化、信号传导和发育相关的基因表达的改变。敲除、染色质免疫沉淀和抑制剂研究表明,SIN3-HDAC 复合物中的 FAM60A 通过 TGF-β(参见 190180)途径直接抑制细胞信号传导。
穆尼奥斯等人(2012) 孤立表明 FAM60A 是人类细胞系中 SIN3-HDAC 复合物的组成部分。在同步化的人U2OS细胞中,FAM60A表达在有丝分裂期间几乎检测不到,但在G1和S期增加至峰值,类似于细胞周期蛋白D1(CCND1;168461)的细胞周期表达。FAM60A 在 G1 和 S 期与 SIN3-HDAC 调节的启动子结合,包括细胞周期蛋白 D1 的启动子。FAM60A 的 GATA 样锌指中 2 对半胱氨酸的突变降低了 FAM60A 与细胞周期蛋白 D1 启动子的关联。FAM60A或SIN2-HDAC亚基HDAC1的敲低削弱了HDAC1与细胞周期蛋白D1启动子的周期性关联,减少了细胞周期蛋白D1启动子乙酰化,增加了细胞周期所有阶段的细胞周期蛋白D1表达,并导致过早进入S期。FAM60A 的敲低不会改变细胞周期蛋白 D1 表达的周期性。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,史密斯等人(2012) 将 FAM60A 基因定位到染色体 12p11。