聚合酶 I，RNA，亚基 D； POLR1D
RNA 聚合酶 A，16-KD，小鼠，同源物；RPA16
RPAC2
HGNC 批准的基因符号：POLR1D
细胞遗传学位置：13q12.2 基因组坐标（GRCh38）：13:27,620,743-27,667,411（来自 NCBI）
▼ 克隆与表达
Yao 等人使用小鼠 Rpa40（POLR1C；610060）作为酵母 2 杂交系统中的诱饵（1996） 克隆了小鼠 Polr1d，他们将其称为 Rpa16。推导的 133 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 15.1 kD。它与 RNA 聚合酶 I 和 III 的酵母亚基 Ac19 有 45% 的氨基酸同一性。SDS-PAGE和Western blot分析表明Rpa16编码小鼠RNA聚合酶I的16-kDa亚基。
▼ 测绘
Amberger（2011）发现Yao等人报道的小鼠Polr1d序列（GenBank D86609）（1996） 与人类 POLR1D 基因（GenBank NM_015972） 的变体 1 有 92% 的同一性，该基因对应到染色体 13q12.2（GRCh37）。
▼ 基因功能
使用酵母 2-杂交分析，Yao 等人（1996） 表明小鼠 Rpa16 与小鼠 Rpa40 相互作用，突变分析表明 Rpa40 的 α 基序是相互作用所必需的。Rpa40 和 Rpa16 都不能在酵母 2 杂交系统中自缔合。
▼ 分子遗传学
Dauwerse 等人对一名 TCOF1 基因（606847） 突变呈阴性、患有 Treacher Collins 综合征（TCS2; 613717） 的 3 岁男孩进行了研究（2011） 进行了全基因组拷贝数分析，并在染色体 13q12.2 上发现了一个 156 kb 的从头缺失，该缺失包含整个 POLR1D 基因和 LNX2 基因的外显子 1（609733）。对另外 10 名 TCOF1 突变呈阴性的 Treacher Collins 患者的 POLR1D 和 LNX2 进行序列分析，结果显示一名男孩的 POLR1D 无义突变为杂合子（R87X；613715.0001）。对另外 242 名具有典型 TCS 或具有 TCOF1 突变阴性的 TCS 表型谱临床表现的个体进行 POLR1D 分析，在 20 个指示病例中产生了 10 个杂合无义突变和 7 个杂合错义突变（参见例如 613715.0002-613715.0006）。20 个突变中有 19 个位于 POLR1D 基因的外显子 3；1 名患者的内含子 2 存在剪接位点突变。
谢弗等人（2014） 报道了来自 2 个不相关的近亲家庭的 4 名患有轻度 Treacher Collins 综合征的儿童，他们在 POLR1D 基因中具有相同的纯合错义突变（L55V; 613715.0007）。该突变定位于编码 RNA 聚合酶二聚化结构域的区域。在第一个家族中通过实时定量 RT-PCR 对 TCOF1 进行了功能分析，表明索引病例中的转录本减少了 50%，这与这种突变损害 RNA 聚合酶并导致成熟转录本数量减少的假设相一致。二聚体核糖体。
▼ 等位基因变异体（7 个精选示例）：
.0001 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，ARG87TER
在来自 3 个不相关家庭的 Treacher Collins 综合征 2（TCS2；613717）的先证者中，Dauwerse 等人（2011） 鉴定了 POLR1D 基因外显子 3 中 259C-T 转变的杂合性，导致 arg87 到 ter（R87X） 取代。在 280 名对照者中未发现该突变。两个家庭表现出非外显性：在一个家庭中，有 2 名受影响的兄弟和 3 名未受影响的家庭成员（他们的父亲、他的双胞胎兄弟和祖父）携带该突变。在另一个家庭中，受影响的兄弟姐妹、姐妹受影响的女儿以及他们未受影响的母亲中都存在这种突变。
.0002 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，GLU47LYS
Dauwerse 等人在 2 名兄弟和一名患有 Treacher Collins 综合征 2（613717） 的无关先证者中（2011） 鉴定了 POLR1D 基因外显子 3 中 139G-A 转变的杂合性，导致 POLR1D RNA 聚合酶二聚化结构域中进化保守残基处的 glu47 到 lys（E47K） 取代。该突变在 280 名对照者中未发现，预计会破坏 α 亚基的二聚化。
.0003 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，LEU51ARG
Dauwerse 等人在一位患有 Treacher Collins 综合征 2（613717） 的母亲和 2 个女儿中（2011） 鉴定了 POLR1D 基因外显子 3 中 152T-G 颠换的杂合性，导致 POLR1D RNA 聚合酶二聚化结构域中进化保守残基处的 leu51 到 arg（L51R） 取代。该突变在 280 名对照者中未发现，预计会破坏 α 亚基的二聚化。
.0004 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，2-BP DEL，326CA
在一个分离常染色体显性 Treacher Collins 综合征 2（613717） 的 3 代家族中，Dauwerse 等人（2011） 鉴定了 POLR1D 基因外显子 3 中 2 bp 缺失（326delCA） 的杂合性，预计会导致移码，导致过早终止密码子。该突变存在于 3 名受影响的家庭成员中，即先证者、他的父亲和他的祖父；在 280 个对照中未发现该物质。先证者唯一的 TCS 表现是下颌发育不全。
.0005 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，2-BP DUP，263G
在一对患有 Treacher Collins 综合征 2（613717） 的父女中，Dauwerse 等人（2011） 鉴定了 POLR1D 基因外显子 3 中 2 bp 重复（263dupG） 的杂合性，预计会导致移码，从而导致过早终止密码子。在 280 名对照者中未发现该突变。
.0006 特雷彻柯林斯综合症 2
POLR1D，2-BP INS，88TG
Dauwerse 等人在一对患有 Treacher Collins 综合征 2（613717） 的母女中（2011） 鉴定出 POLR1D 基因外显子 3 中 2 bp 插入（88insTG） 的杂合性，导致移码和提前终止密码子。在 280 名对照者中未发现该突变。
.0007 TREACHER COLLINS 综合征 2，常染色体隐性
POLR1D，LEU55VAL
Schaefer 等人对来自 2 个不相关的近亲家庭的 4 名患有轻度 Treacher Collins 综合征（TCS2; 613717） 的儿童进行了研究（2014） 鉴定了纯合的 c.163C-G 颠换，导致 POLR1D 基因中 leu55 到 val（L55V） 的取代，该基因位于编码 RNA 聚合酶二聚化结构域的区域。两组未受影响的父母和第一个先证者未受影响的姐妹都是突变杂合子。在一系列 150 条对照染色体中未发现该突变，并且在 1000 个基因组计划或外显子组变异服务器数据库中也未观察到该突变。55 位亮氨酸在物种间高度保守。该突变位于 POLR1D 基因的外显子 3，位于氨基酸 45 和 57 之间的 8 个突变热点内。单倍型分析支持了以下假设：2 个家族中的该突变孤立出现，而不是源自创始人效应。
