B 黑色素瘤抗原; BAGE
BAGE 家族,成员 1;BAGE1
HGNC 批准的基因符号:BAGE
细胞遗传学定位:21p11.2 基因组坐标(GRCh38):21:7,000,001-10,900,000
▼ 说明
BAGE 与 MAGE(参见 MAGEA1,300016)和 GAGE(300595)家族的成员一起,编码细胞毒性 T 淋巴细胞识别的抗原。这些抗原也称为 CT 抗原(参见 300156),因为它们在癌细胞和睾丸中表达(Boel 等人总结,1995)。
▼ 克隆与表达
为了鉴定新的 CT 抗原基因,Boel 等人(1995)筛选了源自黑色素瘤克隆亚系MZ2-MEL.43的cDNA文库,该文库被溶细胞性T淋巴细胞克隆CTL 82/82裂解。他们用 MZ2-MEL.43 cDNA 文库转染 COS-7 细胞,向培养物中添加 CTL 82/82,并筛选受刺激释放肿瘤坏死因子(TNF;191160) 的细胞池。他们分离出一种 cDNA,BAGE,编码与 MAGE 家族无关的 43 个氨基酸肽。Southern印迹分析表明BAGE属于几个相关基因的家族。对 MZ2-MEL.43 细胞的 PolyA(+) RNA 进行 Northern 分析,鉴定出 1-kb 和 2.4-kb 转录物。与其他 CT 抗原基因类似,正常组织中 BAGE 的表达仅在成人睾丸中观察到。BAGE 在 22% 的黑色素瘤、30% 的浸润性膀胱癌、10% 的乳腺癌、8% 的头颈鳞状细胞癌和 6% 的非小细胞肺癌中表达。
Ruault 等人通过 PCR 检测人类黑色素瘤和睾丸 cDNA 文库(2002) 扩增了 6 个 BAGE1 剪接变体,仅在 3 引物末端有所不同。
▼ 基因结构
鲁奥特等人(2002)确定BAGE基因含有7个外显子。
▼ 测绘
Ruault 等人通过 FISH、体细胞杂交和基因组序列分析(2002) 确定 BAGE 基因对应到 13 号染色体。然而,Hartz(2017) 根据 BAGE 序列(GenBank U19180) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 BAGE 基因对应到染色体 21p11.2。
▼ 进化
鲁奥特等人(2003) 确定原始人类进化过程中复杂的染色体重排产生了 BAGE 基因家族。7 号染色体上的 MLL3 基因(KMT2C;606833)的近着丝粒重组产生了祖先 BAGE 基因,近着丝粒运动和/或近端着丝粒交换扩大了 BAGE 家族。纯化选择作用于 BAGE 家族以消除有害的氨基酸变化。