信号识别颗粒,68-KD; SRP68
HGNC 批准的基因符号:SRP68
细胞遗传学位置:17q25.1 基因组坐标(GRCh38):17:76,038,785-76,072,517(来自 NCBI)
▼ 说明
SRP68 是信号识别颗粒(SRP) 的一个亚基,信号识别颗粒是膜蛋白靶向的核心核糖核蛋白复合物。SRP68 驱动的 SRP RNA 重塑能够实现 RNA-RNA 与核糖体的直接接触(Grotwinkel et al., 2014)。
▼ 克隆与表达
Politz 等人通过使用 EST 探针筛选肝癌 cDNA 文库(2000) 克隆了编码 619 个氨基酸蛋白质的 SRP68 cDNA(GenBank AF19591)。利用原位杂交、免疫细胞化学和绿色荧光蛋白分析,作者确定,与 SRP RNA 一样,SRP19、SRP68 和 SRP72 蛋白除了预期的细胞质分布外,还显示出核仁定位。相反,SRP54 仅定位于细胞质中。
源自乳腺癌、食道或卵巢组织的人类癌症经常显示染色体 17q25 上的等位基因丢失。此外,一个与食管癌(TOC;148500)有关的位点已被定位到该区域。Harada 等人在通过鸟枪法对 1 Mb 目标区域进行测序的过程中,将其定义为含有与这些事件有关的推定肿瘤抑制基因的 DNA 片段(2001) 鉴定了一种他们认为新颖的 cDNA。该 cDNA 编码一个 627 个氨基酸的蛋白质,与信号识别颗粒的犬 68-kD 亚基具有显着的序列同源性,该信号识别颗粒参与将分泌蛋白和膜蛋白转运至内质网进行适当处理。Northern 印迹分析检测到大约 2.8 kb 的转录物,该转录物普遍表达,但在骨骼肌中表达最高,并且优先在心脏、肾脏和胎盘中表达。
▼ 基因家族
信号识别颗粒(SRP) 是一种核糖核蛋白复合物,可介导蛋白质靶向内质网(ER)。该复合物由 7S(或 7SL)RNA 和 6 种不同的蛋白质组成:SRP9(600707)、SRP14(600708)、SRP19(182175)、SRP54(604857)、SRP68 和 SRP72(602122)。这些蛋白质以单体(SRP19 和 SRP54)或异二聚体(SRP9/SRP14 和 SRP68/SRP72)形式与 7S RNA 结合。SRP9和SRP14构成7S的Alu结构域,而其他4个蛋白属于S结构域。SRP 具有至少 3 种与蛋白质亚基相关的不同功能:信号识别、翻译停滞以及通过与对接蛋白相互作用实现 ER 膜靶向(Lingelbach 等人总结,1988)。
有关信号识别粒子数据库的信息,请参阅 Larsen 等人(1998)。
▼ 测绘
Harada 等人通过辐射杂交作图和荧光原位杂交(2001) 证实了该基因位于 17q25.1 的位置。
▼ 生化特征
冷冻电子显微镜
哈利克等人(2004) 提出了靶向复合物的结构,该复合物由与携带信号序列的活性 80S 核糖体结合的哺乳动物 SRP 组成。这种结构通过冷冻电子显微镜确定为 12 埃分辨率,使 Halic 等人得以实现(2004) 生成 SRP 功能构象的分子模型。该模型显示了 SRP 的 S 结构域如何在新生链出口位点接触大核糖体亚基以结合信号序列,以及 Alu 结构域如何进入核糖体的延伸因子结合位点,解释了其延伸抑制活性。
晶体结构
格罗温克尔等人(2014) 展示了单独的 SRP68 的 RNA 结合结构域以及与 SRP RNA 和 SRP19 形成的复合物的晶体结构(182175)。SRP68 RNA 结合结构域是一种类似四肽的模块,它与 RNA 三向连接结合,使 RNA 弯曲,并将富含精氨酸的 α 螺旋基序插入到主沟中。富含精氨酸的基序打开保守的 5f RNA 环,在核糖体结合的 SRP 中建立与核糖体 RNA 的接触。格罗温克尔等人(2014) 得出的结论是,他们的数据为蛋白质易位所需的真核生物特异性、SRP68 驱动的 RNA 重塑提供了结构基础。