卷曲螺旋结构域含有蛋白质 22; CCDC22
HGNC 批准的基因符号:CCDC22
细胞遗传学定位:Xp11.23 基因组坐标(GRCh38):X:49,235,470-49,250,520(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Voineagu 等人通过寻找 X 染色体区域中与智力障碍相关的基因,(2012) 确定了 CCDC22。他们发现 CCDC22 在所有检查的成人组织以及胎儿肝脏和大脑中都有表达。前列腺中的表达最高,骨骼肌中的表达最低。
斯塔罗卡多姆斯基等人(2013) 报道推导的 627 个氨基酸的 CCDC22 蛋白具有 N 端保守结构域和 C 端卷曲螺旋结构域,类似于染色体结构维持(SMC) 蛋白(参见 SMC1A, 300040)。数据库分析显示,CCDC22在人体组织中表达存在差异,在许多血细胞谱系中表达最高,在肺、心脏、前列腺、甲状腺和胸腺中表达中等,在其他组织中表达较低。8 个小鼠组织的定量 RT-PCR 检测到肺中表达最高,肌肉中表达最低。蛋白质印迹分析显示小鼠 Ccdc22 在胸腺和胰腺中表达最高,在肾脏、肌肉、小肠和睾丸中几乎没有表达。荧光标记的 CCDC22 在转染的 HeLa 细胞中以点状核周分布表达。
▼ 基因功能
Starokadomskyy 等人通过对用 COMMD1(607238)、COMMD9(612299) 和 COMMD10(616704) 亲和纯化的蛋白质进行质谱分析(2013) 除了其他 COMM 结构域蛋白之外,还鉴定出了 CCDC22。相互免疫沉淀和蛋白质下拉分析表明,CCDC22 与所检查的所有 10 个 COMM 结构域蛋白相互作用。U2OS细胞中CCDC22的沉默使COMMD1从强核染色模式重新定位到大核周病灶,并将COMMD10从小核周病灶重新定位到大核周病灶。结构域分析表明,CCDC22 的保守 N 端结构域与 COMMD1 的 COMM 结构域结合。在与 滞蛋白 的蛋白质复合物中也检测到了 CCDC22 和 COMM 结构域蛋白(参见 CUL1,603134),其充当靶蛋白泛素化的连接酶。表位标记的 COMMD8(616656) 在 HeLa 细胞中结合 CCDC22、CUL1 和 CUL3(603136),并促进 NF-kappa-B(参见 164011)抑制剂 I-kappa-B-α(NFKB1A;164008) 的泛素化和降解。HEK293 细胞中 COMMD8(616656) 或 CCDC22 的沉默减少了几个 NF-kappa-B 通路基因的 TNF(191160) 依赖性激活。斯塔罗卡多姆斯基等人(2013) 得出结论,CCDC22-COMMD8 复合物调节 I-kappa-B 周转和 NF-kappa-B 激活。
辛格拉等人(2019) 证明人类 COMMD/CCDC22/CCDC93(CCC) 和猎犬复合体共享 VPS35L(618981) 作为共同亚基。CCC 复合体(而非猎犬)需要维持 3-磷酸磷脂酰肌醇(PI3P) 的正常内体水平。CCC 的消耗导致 PI3P 水平升高、WASH 的募集和激活增强(参见 613632)、内体 F-肌节蛋白过量以及内化受体的捕获。从机制上讲,CCC 调节 PI3P 磷酸酶 MTMR2 的磷酸化和内体募集(603557)。作者得出结论,CCC 对 PI3P 水平的调节对于内体区室中的蛋白质回收至关重要。
▼ 测绘
Hartz(2011) 根据 CCDC22 序列(GenBank AJ005890) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CCDC22 基因对应到染色体 Xp11.23。
▼ 分子遗传学
Voineagu 等人在患有与 Ritscher-Schinzel 综合征 2(RTSC2; 300963) 一致的综合征 X 连锁智力障碍的受影响家庭成员(IGOLD #586) 中(2012) 在 CCDC22 基因(300859.0001) 中发现了一个半合子剪接位点突变。患者细胞的 mRNA 水平下降了 5 倍,并且保留内含子 1 的异常剪接转录物水平增加。先证者是接受 X 染色体重测序的 208 名患者中的一名,之前曾是 Tarpey 等人研究的大型队列的一部分等人(2009)。
Kolanczyk 等人有 2 个兄弟,他们的父母都是奥地利人,患有 Ritscher-Schinzel 综合征 2(2015) 在 CCDC22 基因中发现了一个半合子错义突变(Y557C; 300859.0002)。该突变是通过全外显子组测序发现的,并与家族中的疾病分离。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 RITSCHER-SCHINZEL 综合征 2
CCDC22, 49A-G
Voineagu 等人在患有与 Ritscher-Schinzel 综合征 2(RTSC2; 300963) 一致的综合征 X 连锁智力障碍的受影响家庭男性成员(IGOLD #586) 中(2012) 在靠近内含子 1 5-prime 剪接位点的 CCDC22 基因外显子 1 中鉴定出半合子 c.49A-G 转变。虽然预计该转变会导致 thr17 到 ala(T17A) 取代,患者细胞的 mRNA 水平下降了 5 倍,并且保留内含子 1 的异常剪接转录本的水平增加。没有证据表明无义介导的 mRNA 衰减,Voineagu 等人(2012) 得出结论,该突变干扰了 CCDC22 的有效转录。通过检查淋巴母细胞系的基因表达谱,然后对 X 连锁智力障碍患者进行候选基因测序,发现了这种突变,该突变与该疾病在家族中分离。该患者是接受 X 染色体重测序的 208 名患者之一,之前曾是 Tarpey 等人研究的大型队列的一部分(2009)。
.0002 RITSCHER-SCHINZEL 综合征 2
CCDC22,TYR557CYS
Kolanczyk 等人有 2 名兄弟,他们的父母都是奥地利人,患有 Ritscher-Schinzel 综合征 2(RTSC2; 300963)(2015) 在 CCDC22 基因的外显子 15 中鉴定出半合子 c.1670A-G 转换(c.1670A-G,NM_014008.4),导致 C 中保守残基处的 tyr557 至 cys(Y557C) 取代-末端位于卷曲螺旋结构域。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在外显子组变异服务器数据库中未发现。该变体根据 dbSNP(版本 132)和 1000 基因组计划数据库进行过滤。与对照组相比,其中 1 名患者的淋巴细胞中 CCDC22 蛋白水平降低了 50%,并且 WASH1(613632) 蛋白丰度增加。科兰奇克等人(2015) 指出 RTSC1(220210) 是由编码斯特伦佩林(KIAA0196; 610657) 的基因突变引起的,该基因是 WASH 复合体的一部分。