滑膜肉瘤易位，染色体 18; SS18

滑膜肉瘤，转移至 X 染色体；SSXT
SYT

本条目中代表的其他实体：
SYT/SSX1 FUSION GENE，包含
SYT/SSX2 FUSION GENE，包含

HGNC 批准的基因符号：SS18

细胞遗传学位置：18q11.2 基因组坐标（GRCh38）：18:26,016,253-26,091,219（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

人类滑膜肉瘤含有复发性和特异性染色体易位 t（X;18）（p11.2;q11.2）。Clark 等人通过使用跨越 X 染色体断点的 YAC 筛选滑膜肉瘤 cDNA 文库（1994）鉴定了一个混合转录物，其中包含对应到 18 号染色体的 5 素序列和对应到 X 染色体的 3 素序列（参见 SSX1；312820）。Clark等人将18号染色体基因标记为SYT（1994）。cDNA克隆的测序表明，正常的SYT基因编码富含谷氨酰胺、脯氨酸和甘氨酸的蛋白质。

SYT 蛋白似乎充当转录共激活子，SSX 蛋白充当辅阻遏物。泰特等人（1999）发现 SYT 蛋白在其 N 末端含有一个新的 54 个氨基酸结构域（SNH 结构域），该结构域在多种物种的蛋白质中都是保守的。SYT 还具有一个 C 末端结构域，称为 QPGY 结构域，因为它富含谷氨酰胺、脯氨酸、甘氨酸和酪氨酸，其中包含转录激活序列。

de Bruijn 等人分离并测序了 SS18 的小鼠同源物（1996），他将该基因称为 Syt。人们发现它在进化过程中是保守的，并且是人类和小鼠 18 号染色体之间同线性区域的一部分。在早期胚胎发生中，小鼠 Syt 普遍表达。在后期阶段，表达仅限于软骨组织、特定神经元细胞和一些上皮来源的组织。在成熟睾丸中，在初级精母细胞中特异地观察到表达。

▼ 基因结构

通过基因组序列和 BAC 分析，de Bruijn 等人（2001）确定 SS18 基因包含 11 个外显子，跨度约为 70 kb。启动子区域缺少 CAAT 和 TATA 框，但包含 CpG 岛，表明 SS18 是一个管家基因。

▼ 测绘

SS18 基因对应到染色体 18p11.2（Clark 等，1994）。德布鲁因等人（1996）发现 SS18 基因是人类和小鼠 18 号染色体同线性区域的一部分。

▼ 基因功能

布雷特等人（1997）表明，人类荧光标记的 SYT 定位于几种不同转染细胞系中离散的核结构。斑点图案不与包含 PML（102578）的体或剪接体共定位。SYT-SSX2（300192）融合蛋白也定位于核斑点，并且在报告基因检测中保留了 SYT 的转录激活特性。布雷特等人（1997）得出结论，将 C 端 SSX 结构域添加到 SYT 中提供了一个新的相互作用结构域，该结构域将 SYT 激活结构域重定向到不同的目标启动子。

泰特等人（1999）发现删除 SYT 的 SNH 结构域会产生更活跃的转录激活因子，表明该结构域充当激活结构域的抑制剂。SYT-SSX 易位蛋白中存在的 C 端 SSX 结构域为该蛋白提供转录抑制结构域。因此，融合蛋白具有转录激活和抑制结构域。泰特等人（1999）证明 SNF2/Brahma 蛋白 BRM 的人类同源物（SMARCA2; 600014）与核斑点中的 SYT 和 SYT-SSX 共定位，并且在体外也与 SYT 和 SYT-SSX 蛋白相互作用。他们认为这种相互作用可以解释 SYT 蛋白如何激活基因转录。

佩拉尼等人（2005）发现COAA的C端YQ结构域和与YQ结构域相邻的最后84个氨基酸（RBM14；612409）特异性结合SYT的QPGY结构域。COAA 还与 SYT-SSX2 融合蛋白结合。SYT 与 COAA 一起作用，刺激雌激素受体（参见 133430）和糖皮质激素受体（GCCR；138040）依赖性转录激活。激活是激素依赖性的，并且需要功能性 BRM 和/或 BRG1（SMARCA4；603254）。

▼ 细胞遗传学

人类滑膜肉瘤含有复发性和特异性染色体易位 t（X;18）（p11.2;q11.2）。Clark 等人通过使用跨越 X 染色体断点的 YAC 筛选滑膜肉瘤 cDNA 文库（1994）鉴定出包含对应到 18 号染色体的 5-prime 序列和对应到 X 染色体的 3-prime 序列的混合转录本（参见 SSX1；312820）。来自 18 号染色体基因 SYT 的探针在 13 个滑膜肉瘤中的 10 个中检测到了基因组重排。cDNA克隆的测序表明SYT基因的重排导致融合蛋白的形成。

克鲁等人（1995）证明在人类滑膜肉瘤中发现的 t（X;18）（p11.2;q11.2）导致 18 号染色体 SS18 基因与 2 个不同基因 SSX1 或 SSX2 中的任意一个融合（300192），在 Xp11.2。SSX1 和 SSX2 基因编码 188 个氨基酸的密切相关的蛋白质（81% 同一性），这些蛋白质富含带电氨基酸。每个 SSX 蛋白的 N 端部分与 Kruppel 相关框（KRAB）具有同源性，KRAB 是一种转录抑制结构域，以前仅在 Kruppel 型锌指蛋白中发现，例如锌指蛋白 117（ZNF117; 194624）和 ZNF83（194558）。PCR 分析表明，在检查的 32 个滑膜肉瘤中，有 29 个存在 SYT-SSX1 或 SYT-SSX2 融合转录本，表明通过 PCR 检测这些混合转录本可能是一种有用的诊断方法。序列分析证明了融合转录本的进一步异质性，形成了 2 个不同的 SYT-SSX1 融合连接和 2 个不同的 SYT-SSX2 融合连接。SYT-SSX1和SYT-SSX2杂合转录物均编码融合蛋白，其中正常SYT蛋白的C端8个氨基酸已被SSX基因编码的78个氨基酸取代。这 2 种融合产物中存在的 SSX1 和 SSX2 蛋白质序列有 78 个氨基酸中的 66 个相同。

古雷等人（1997）鉴定了 SSX 基因的 5 个变体：SSX1、SSX2、SSX3（300325）、SSX4（300326）和 SSX5（300327），但只有 SSX1 和 SSX2 已被证明与易位 t 中的 SYT 基因融合。 X;18）滑膜肉瘤。斯凯廷等人（1999）通过巢式 RT-PCR 扩增分析了 3 个滑膜肉瘤活检标本中 SYT-SSX 融合 mRNA 的类型。其中两个肿瘤的 SSX1 或 SSX2 引物呈阳性，1 个肿瘤的两种 RT-PCR 检测均呈阳性。第三个样本显示一个与 SYT 基因具有 100% 同源性的 187 bp 片段，该片段与与 SSX4 的长剪接变体具有 100% 同源性的 246 bp 片段相连。SSX4 上的断点与 SSX1 和 SSX2 上观察到的断点相同；SYT-SSX 融合基因中涉及的所有 SSX 基因均在第四和第五外显子之间分裂。自从卡瓦伊等人。Skytting 等（1998）发现滑膜肉瘤中 2 个融合基因变体 SYT-SSX1 和 SYT-SSX2 的预后存在差异（1999）表明SSX转录本之间的碱基对差异可能具有生物学意义。他们推测这些偏差可能位于外显子 5。在所有 3 个 SYT-SSX 融合变体中，该结构域包含多个磷酸化位点。在SSX4中，有5个这样的残基（3个丝氨酸和2个苏氨酸）；在SSX1和SSX2中，分别有5个和6个残基。这些潜在磷酸化位点中只有 2 个是 3 个变体所共有的。

杨等人（2002）证明 SYT-SSX1 和 SYT-SSX2 共存于 121 个 SYT-SSX 阳性原发肿瘤中的 12 个（10%）。RNA、DNA 和染色体水平的表征表明，在所有 12 例中，SYT-SSX1 和 SYT-SSX2 融合产生相同的 SYT-SSX 融合转录本。然而，在基因组水平上，易位是不同的，并且很可能发生在靶基因的可变内含子位点之间。Yang等通过10例间期FISH分析（2002）确定 SYT-SSX2 易位是除 1 之外所有易位中最丰富的，其中 SYT-SSX1 占主导地位。

▼ 命名法

符号 SYT 也用于突触结合蛋白（185605），这是一种不相关的蛋白质。