RNA 聚合酶 II 亚基 A、磷酸酶、亚基 1 的 C 末端结构域； CTDP1

POLR2A 的 CTD，亚基 1 的磷酸酶，
转录因子 IIF 相关 CTD 磷酸酶 1；FCP1
TFIIF 相关 CTD 磷酸酶 1

本条目中代表的其他实体：
转录因子 IIF 相关 CTD 磷酸酶 1，ISOFORM A，包含；FCP1A，包含
转录因子 IIF 相关 CTD 磷酸酶 1，异构体 B；FCP1B，包括

HGNC 批准的基因符号：CTDP1

细胞遗传学位置：18q23 基因组坐标（GRCh38）：18:79,676,768-79,756,625（来自 NCBI）

▼ 说明

如果没有称为通用转录因子（GTF）的额外蛋白质，真核 RNA 聚合酶无法启动 RNA 合成。GTF 在 DNA 启动子上组装成复合物并招募 RNA 聚合酶。多亚基 GTF 复合物，例如 TFIIF，对于 RNA 聚合酶 II 介导的许多（如果不是全部）蛋白质编码基因的转录至关重要。TFIIF 由 2 个亚基 RAP30（GTF2F2; 189969）和 RAP74（GTF2F1; 189968）组成，介导与 RNA 聚合酶 II 的相互作用。在转录物延伸过程中，RNA 聚合酶 II 亚基 A（POLR2A；180660）的 C 末端结构域（CTD）通过 CCNK（603544）变得严重磷酸化。CTDP1 是 POLR2A CTD 特异性的磷酸酶（Archambault 等，1998）。

▼ 克隆与表达

Archambault 等人使用外周淋巴细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选来鉴定编码与 RAP74 相互作用的蛋白质的 cDNA，然后筛选结肠癌和胎儿脑 cDNA 文库（1998）分离出编码 CTDP1 的 cDNA，他们将其称为 FCP1（TFIIF 相关 CTD 磷酸酶-1）。鉴定出的一种 CTDP1 cDNA 编码一种推导的 842 个氨基酸的蛋白质，作者将其命名为 FCP1A。另一种鉴定出的 CTDP1 cDNA 编码一种推测的剪接变体，称为 FCP1B，缺少最后 139 个氨基酸。Northern 印迹分析在所有测试组织（即心脏、大脑、胎盘、肺、肝脏、骨骼肌、肾脏和胰腺）中检测到 3.6-kb CTDP1 转录物。免疫印迹分析在 HeLa 核提取物中检测到 150 kD 的蛋白质。

▼ 基因功能

Archambault 等人使用免疫印迹分析（1998）表明 CTDP1 与 HeLa 核提取物中的 CTD 磷酸酶活性精确共纯化。结合分析表明CTDP1的C端与RAP74的C端结合。阿尚博等人（1998）得出结论，CTDP1 是 RAP74 刺激的磷酸酶的一个重要亚基，它能够使 POLR2A 的 C 末端进行去磷酸化，使其可用于启动基因表达。

利卡多等人（2003）发现表达 FCP1 的人肺癌细胞系（H1299）中的 FCP1 亲和纯化复合物含有 RNA 聚合酶 II 和 MEP50（WDR77; 611734），MEP50 是参与剪接体小核核糖核蛋白甲基化和组装的复合物的一个组成部分（snRNP）。H1299 全细胞提取物的甘油梯度分级分离和蛋白质印迹分析在 400 kD 和超过 800 kD 的蛋白质复合物中检测到 MEP50。在核提取物中，MEP50 仅与 400 kD 复合物相关，该复合物似乎也包含 FCP1，并且与包含 PRMT5（604045）的较大甲基转移酶复合物不同。免疫沉淀分析表明，FCP1 与前 mRNA 剪接体 snRNP 的成分（例如 SNRP70；180740）特异性相互作用。利卡多等人（2003）得出结论，FCP1 可能参与连接转录延伸和剪接。

▼ 分子遗传学

瓦龙等人（2003）发现先天性白内障伴有面部畸形和神经病（604168），这是一种发生在 Vlax Roma（吉普赛人）内源性群体中的常染色体隐性遗传疾病，是由内含子 6 中反义 Alu 元件的单核苷酸取代引起的CTDP1（604927.0001）。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 先天性白内障、面部畸形和神经病变
CTDP1、IVS6、CT、+389

Varon 等人在患有先天性白内障、面部畸形和神经病的 Rudari Vlax Roma（吉普赛人）中（CCFDN；604168）（2003）发现疾病表型的完美分离，在 CTDP1 基因（IVS6+389C-T）内含子 6 的反义 Alu 元件中具有 C 到 T 的转变。对 887 个未受影响人群对照的筛查发现鲁达里人的携带率为 6.9%，与基于 CCFDN 流行率的预测非常一致；其他吉普赛人群的平均携带率为 0.6%；非吉普赛欧洲人的这一比例为 0.0%。RT-PCR 和测序分析确定了一种罕见的异常剪接机制，其中 CT 转换产生的供体位点激活上游隐性受体位点，导致在加工的 CTDP1 mRNA 中插入 Alu 序列的 95 个核苷酸。此前仅在鸟氨酸转氨酶缺乏症中发现了这种机制（258870.0023）。CTDP1 mRNA 中的插入导致外显子 6 下游 17 个密码子处的过早终止信号，突变转录物预计会经历无义介导的衰变或导致缺乏核定位信号的无功能蛋白质。瓦龙等人（2003）在所有研究的细胞类型中观察到异常产物，无论它们是否参与临床表型。

莫拉尔等人（2004）使用 IVS6+389C-T 突变和罗姆人（吉普赛人）中的其他 4 个私人突变来推断与吉普赛人人口历史的综合特征相关的一些缺失参数。突变共享和高携带率支持了强大的创始人效应。