溶质载体家族 27(脂肪酸转运蛋白),成员 6; SLC27A6
脂肪酸转运蛋白 6;FATP6
极长链酰基辅酶A 合成酶同源物 1;VLCSH1
VLCS 同源物 1
酰基辅酶A 合成酶超长链家族,成员 2;ACSVL2
胆酰辅酶A合成酶;BACS
HGNC 批准的基因符号:SLC27A6
细胞遗传学位置:5q23.3 基因组坐标(GRCh38):5:128,965,488-129,033,635(来自 NCBI)
▼ 说明
胆汁酸在肝脏中由胆固醇合成,与氨基酸结合,分泌到胆汁中并随后进入肠道,从肠道重吸收和再利用,需要多种酶、细胞器和组织的综合活动。SLC27A6 是一种肝脏特异性酰基辅酶 A 合成酶,似乎主要在 C24 胆汁酸的重新激活和再循环中发挥作用(Mihalik 等,2002)。
▼ 克隆与表达
Schaffer 和 Lodish(1994) 使用表达克隆策略从鼠脂肪细胞中鉴定出一种膜蛋白,他们将其称为脂肪酸转运蛋白或 FATP(SLC27A1;600691)。FATP 促进长链脂肪酸的吸收。赫希等人(1998) 鉴定了一个 FATP 大家族,其特征是存在 FATP 签名序列。他们在小鼠中鉴定出 5 种不同的 FATP,在人类中鉴定出 6 种不同的 FATP,并将其命名为 FATP1(SLC27A1)、-2(SLC27A2;603247)、-3(SLC27A3;604193)、-4(SLC27A4;604194)、-5(SLC27A5) ;603314)和-6(SLC27A6)。人和小鼠的 FATP 具有独特的表达模式,存在于脂肪酸代谢的主要器官中,例如脂肪组织、肝脏、心脏和肾脏。
Watkins 等人通过使用大鼠 Vlcs 作为查询来搜索 EST 数据库,然后采用额外的克隆技术来获得 5 素序列(1999)克隆了VLCSH1。推导的 619 个氨基酸的蛋白质包含 2 个在 FATP 和 VLCS 蛋白质家族中高度保守的基序。VLCSH1 还具有 N 端内质网靶向序列和与过氧化物酶体靶向信号相关的 C 端基序。
Gimeno 等人通过在数据库中搜索与 FATP1 相似的序列(2003) 鉴定出包含全长 FATP6 cDNA 的 EST。推导的 619 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 70.1 kD。Northern印迹分析检测到心脏中FATP6表达强烈,而胎盘、睾丸、肾上腺、肾脏、膀胱和子宫中表达较低。小鼠组织的蛋白质印迹分析显示心脏中的表达占主导地位,而睾丸中的表达要弱得多。在检查的任何其他组织中均未检测到表达。人心脏原位杂交和恒河猴心脏免疫组织化学分析发现FATP6在心肌细胞中表达。表达几乎完全在直接邻近微脉管系统的区域的肌膜上。较大血管区域不表达,这与 FATP6 在长链脂肪酸(LCFA) 从间质摄取到心肌细胞中的作用一致。
通过数据库分析,沃特金斯等人(2007) 鉴定了 SLC27A6 的 2 个剪接变体,他们将其称为 ACSVL2,仅在 5 素 UTR 上有所不同。推导的蛋白质包含酰基辅酶A合成酶特征的所有5个基序。系统发育分析表明 ACSVL2 属于超长链酰基辅酶 A 合成酶家族。
▼ 基因功能
米哈利克等人(2002) 发现,除了胆酸之外,人类 VLCSH2(他们称之为 BACS)还可以激活鹅去氧胆酸、次级胆汁酸脱氧胆酸和石胆酸。人VLCS(SLC27A2;603247)和VLCSH2都可以激活胆酸前体THCA,使其随后转化为胆酸盐,但VLCS不使用任何C24胆汁酸作为底物。基于这些观察结果以及原位杂交、拓扑定向和抑制研究的结果,作者提出 VLCSH2 的主要功能是 C24 胆汁酸的重新激活和再循环,而 VLCS 参与从头合成途径。
吉梅诺等人(2003) 发现 FATP6 介导放射性标记的油酸摄取到转染的人胚胎肾细胞中。FATP6 对棕榈酸和亚油酸的偏好高于主要肠道 LCFA 转运蛋白 FATP4(SLC27A4)。FATP6 不转运链长短于 C10 的脂肪酸。
▼ 基因结构
吉梅诺等人(2003) 确定 SLC27A6 基因包含 10 个外显子,跨度 67 kb。
沃特金斯等人(2007)确定SLC27A6基因至少含有11个外显子。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Gimeno 等人(2003) 将 SLC27A6 基因定位到染色体 5q23。沃特金斯等人(2007) 通过基因组序列分析将 SLC27A6 基因定位到染色体 5q23.3 的正链。
吉梅诺等人(2003) 将小鼠 Slc27a6 基因定位到 18 号染色体。