RAC GTP 酶激活蛋白 1; RACGAP1
RAC GTP 酶激活蛋白,雄性生殖细胞;MGRACCGAP
CYK4,线虫,同系物
HGNC 批准的基因符号:RACGAP1
细胞遗传学位置:12q13.12 基因组坐标(GRCh38):12:49,989,162-50,033,440(来自 NCBI)
▼ 说明
Rho GTPases 控制多种细胞过程。小 G 蛋白 Ras 超家族中有 3 种 Rho GTPases 亚型:RHO(参见 165370)、RAC(参见 RAC1;602048)和 CDC42(116952)。GTP 酶激活蛋白(GAP) 结合激活形式的 Rho GTP 酶并刺激 GTP 水解。通过这种催化功能,Rho GAP 负向调节 Rho 介导的信号。GAP 还可以充当效应分子,并在 Rho 和其他 Ras 样 GTP 酶下游信号传导中发挥作用。
▼ 克隆与表达
Toure 等人通过使用酵母 2 杂交系统以活化形式的 RAC 作为诱饵筛选 Jurkat cDNA 文库,然后筛选胎盘 cDNA 文库(1998) 分离出编码 RACGAP1 的 cDNA,他们将其称为 MGRACAGAP。预测的 527 个氨基酸的 RACGAP1 蛋白具有一个大的 N 末端区域,其中包含蛋白激酶 C(参见 176960)样富含半胱氨酸的基序。作者确定,RACGAP1 与果蝇 RnRacGAP 以及大鼠和人类的嵌合蛋白具有最高的同源性(参见 602857)。功能分析表明,RACGAP1 的 GAP 结构域对 CDC42、RAC1 和 RAC2 表现出很强的 GAP 活性(602049)。Northern blot分析检测到大约3.2 kb的RACGAP1转录物,该转录物在睾丸中表达最丰富,在大多数其他组织中表达量较低。蛋白质印迹分析在睾丸提取物中检测到 58 kD 的 RACGAP1 蛋白。原位杂交表明RACGAP1表达仅限于成熟睾丸的生殖细胞。
▼ 基因功能
通过酵母 2-杂交筛选,Toure 等人(2001) 发现 RACGAP1 的非 Rho 结合 N 末端与阴离子交换剂 SLC26A8(608480) 相互作用。通过突变分析,他们确定RACGAP1的N端与SLC26A8的细胞质C端结构域相互作用。成年睾丸的原位杂交显示精母细胞中 SLC26A8 和 RACGAP1 表达重叠。图雷等人建议的具体表达模式(2001) SLC26A8 的表达比 RACGAP1 的表达短。
Zhao 和 Fang(2005) 鉴定出 RACGAP1 是 HeLa 细胞中促进后期复合物/环体的底物,环体是一种控制有丝分裂进展的泛素连接酶。在胞质分裂开始时,RACGAP1 将苯胺(ANLN;616027) 和肌球蛋白组装到收缩环中,并通过 RhoA(165390) 介导的肌球蛋白调节轻链(MYL2;160781) 磷酸化来激活肌球蛋白。在后期和胞质分裂过程中,RACGAP1 与 ECT2(600586) 相关,ECT2 是 RhoA 的鸟嘌呤核苷酸交换因子,RACGAP1 是 ECT2 定位到中央纺锤体和收缩环所必需的。ECT2 或 RACGAP1 的敲除导致收缩环的缺失和皱纹的侵入。Zhu和Fang(2005)得出结论,RACGAP1是胞质分裂启动的主要调节因子,控制收缩环的组装和卵裂沟的进入。
坎曼等人(2008) 指出,在胞质分裂期间,GTPase RhoA 协调收缩环组装和收缩。RhoA 信号传导由中央纺锤体控制,中央纺锤体是在分离的染色体之间形成的一组微管束。Centralspindlin 是一种由 ZEN4(KIF23; 605064) 和 CYK4 组成的蛋白质复合物,是秀丽隐杆线虫中枢纺锤体组装和胞质分裂所必需的。坎曼等人(2008) 发现 CYK4 GAP 结构域中的 2 个功能分离突变导致胞质分裂缺陷,类似于中枢轴蛋白功能丧失。这些缺陷可以通过消除 GTPase RAC 或其效应子来挽救,但不能通过消除 RhoA 来挽救。坎曼等人(2008) 得出结论,CYK4 对 RAC 的灭活与 RhoA 激活并行,在胞质分裂过程中驱动收缩环收缩。
中枢纺锤体复合体是纺锤体中区和中体的保守组成部分,由 2 个驱动蛋白 MKLP1(605064) 分子和 2 个 Rho 家族 GTPase 激活蛋白 RACGAP1 分子组成(Lekomtsev 等人总结,2012)。列科姆采夫等人(2012) 鉴定了中枢纺锤体蛋白复合物(纺锤体中区和中体的保守成分)中的质膜束缚活性,并证明 RACGAP1 的 C1 结构域通过与聚阴离子磷酸肌醇脂质相互作用而与质膜结合。Lekomtsev 等人使用 X 射线晶体学(2012) 确定了这种非典型 C1 结构域的结构。RACGAP1 的疏水帽和 C1 结构域的碱性残基中的突变可防止蛋白质与质膜的结合,并消除人和鸡细胞中的胞质分裂。在 RACGAP1 的 C1 结构域缺失的情况下,中央纺锤蛋白的人工膜束缚可恢复细胞分裂。尽管 C1 结构域功能对于中区和中体的形成是可有可无的,但它促进收缩性并且是质膜附着到中体所必需的,这是该细胞器的长期假定功能。列科姆采夫等人(2012) 认为centralspindlin 将有丝分裂纺锤体与质膜连接起来,以确保动物细胞胞质分裂过程中的最终切割。
▼ 测绘
Gross(2022) 根据 RACGAP1 序列(GenBank BC032754) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RACGAP1 基因对应到染色体 12q13.12。
▼ 分子遗传学
Wontakal 等人对一名患有先天性红细胞生成障碍性贫血 IIIb 型(CDAN3B;619789)的男孩进行了研究(2022) 鉴定了 RACGAP1 基因中的复合杂合错义突变:L396Q(604980.0001) 和 P432S(604980.0002)。通过全外显子组测序发现的这些突变均遗传自未受影响的父母,与常染色体隐性遗传一致。两种变体都影响 GAP 结构域中的保守残基,并且都不存在于 gnomAD 数据库中。体外红系细胞系中RACGAP1的敲低会导致去核方面的显着缺陷以及多核成红细胞的增加,而这两种突变的表达都无法挽救这种缺陷。进一步的体外研究表明,突变对刺激其他 GTP 酶的能力具有不同的影响。与野生型相比,L396Q 变体显示对 CDC42(116952) 和 RAC1(602048) 的刺激减少,但刺激 RHOA(165390) 的能力没有变化。相比之下,P432S对CDC42或RAC1没有显示出影响,但与野生型相比,刺激RHOA的能力显着增加。HeLa 细胞中 RNAi 介导的 RACGAP1 敲低导致胞质分裂受损,L396Q 可以部分挽救这种受损的胞质分裂,但 P432S 则不能。L396Q 变体在胞质分裂过程中表现出与野生型相似的细胞定位,但一部分 L396Q 细胞显示出较晚的皱纹退化。P432S变体异常定位为环状图案,而不是聚集在纺锤体中部;该变异导致严重的胞质分裂缺陷,作者推测这是由于 RHOA 活性增加所致,可能会干扰收缩环的形成并导致中枢纺锤体的错误定位。作者指出,KIF23 基因(605064) 是中枢轴蛋白的一个组成部分,其突变会导致类似的常染色体显性形式的 CDAN3(CDAN3A;105600),这表明存在一种常见的发病机制。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 贫血,先天性红细胞生成障碍,IIIb 型(1 名患者)
RACGAP1,LEU396GLN
Wontakal 等人对一名患有先天性红细胞生成障碍性贫血 IIIb 型(CDAN3B;619789)的 3 岁男孩进行了研究(2022) 鉴定了 RACGAP1 基因中的复合杂合错义突变:c.1187T-A 颠换,导致 leu396 到 gln(L396Q) 取代,以及 c.1294C-T 转换,导致 pro432 到 - Ser(P432S;604980.0002)替换。通过全外显子组测序发现的这些突变均遗传自未受影响的父母,与常染色体隐性遗传一致。两种变体都影响 GAP 结构域中的保守残基,并且都不存在于 gnomAD 数据库中。详细的体外研究表明,这些突变无法挽救多核红细胞或 RACGAP1 缺失细胞中的胞质分裂缺陷。此外,L396Q 变体导致靶标 GTP 酶功能丧失,而 P432S 则显示出对靶标 RHOA 的刺激增加(165390)。
.0002 贫血,先天性红细胞生成障碍,IIIb 型(1 名患者)
RACGAP1,PRO432SER
讨论 RACGAP1 基因中的 c.1294C-T 转变,导致 pro432 到 Ser(P432S) 取代,这种取代在先天性红细胞生成障碍性贫血 IIIb 型患者(CDAN3B; 619789) 的复合杂合状态下被发现旺塔卡尔等人(2022),参见 604980.0001。