负伸长因子复合体,成员 B; NELFB
BRCA1 的辅因子;COBRA1
负延伸因子多肽 B
KIAA1182
HGNC 批准的基因符号:NELFB
细胞遗传学定位:9q34.3 基因组坐标(GRCh38):9:137,255,327-137,273,542(来自 NCBI)
▼ 说明
NELFB 是负伸长因子(NELF) 的一个亚基,其中还包括 NELFA(606026)、NELFC 或 NELFD(NELFCD;605297) 和 NELFE(154040)。NELF 与 DRB 敏感性诱导因子(DSIF)、SPT4(SUPT4H1; 603555) 和 SPT5(SUPT5H; 602102) 的异二聚体一起作用,引起 RNA 聚合酶 II 的转录暂停(参见 180660)(Narita 等,2003)。
▼ 克隆与表达
Hirosawa 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1999)克隆了KIAA1182。RT-PCR ELISA 检测到卵巢和脊髓中表达最高。高表达还存在于心脏、大脑、骨骼肌、肾脏、睾丸、胎儿大脑和胎儿肝脏中。肺和胰腺中的表达稍低,肝脏和脾中的表达中等。在所检查的所有特定脑区域中均检测到高表达,特别是在尾状核和底丘脑核中。
Narita 等人通过从 HeLa 细胞核提取物中纯化 NELF,然后进行序列和数据库分析(2003) 克隆 NELFB。推导的 580 个氨基酸的蛋白质具有 2 个卷曲螺旋结构域。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 2.7 kb NELFB 转录物。通过 SDS-PAGE,NELFB 的表观分子质量为 62 kD。
▼ 基因功能
叶等人(2001) 发现 BRCA1(113705) 在中国仓鼠卵巢细胞中诱导大规模染色质解浓缩。COBRA1 结合 BRCA1 的染色质展开结构域之一,COBRA1 本身诱导大规模染色质解缩。
成田等人(2003)通过在昆虫细胞中过表达表位标记的 NELFA、NELFB、NELFD 和 NELFE 重建了活性 NELF 样复合物。他们发现 NELFB 和 NELFE 直接相互作用,并且 NELFD 直接与 NELFA 和 NELFB 相互作用,这与 NELFB 和 NELFD(或 NELFC)通过 3 个蛋白质-蛋白质相互作用将 NELFA 和 NELFE 结合在一起的模型一致。NELF 功能需要所有 4 个 NELF 亚基。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Hirosawa 等人(1999) 将 COBRA1 基因定位到 9 号染色体。