突触结合蛋白结合细胞质 RNA 相互作用蛋白; SYNCRIP

NS1 相关蛋白 1；NSAP1
富含甘氨酸、精氨酸和酪氨酸的 RNA 结合蛋白；GRYRBP
异质核核糖核蛋白 Q；HNRNPQ

HGNC 批准的基因符号：SYNCRIP

细胞遗传学位置：6q14.3 基因组坐标（GRCh38）：6:85,607,784-85,643,870（来自 NCBI）

▼ 说明

SYNCRIP 基因编码在细胞核和/或细胞质中起作用的几种亚型。细胞质 SYNCRIP 蛋白与 mRNA 成熟和降解有关（Passos 等人总结，2006）。

▼ 克隆与表达

Harris等人利用小鼠微小病毒主要非结构蛋白NS1的反式激活结构域筛选HeLa细胞表达文库，然后进行EST数据库分析和PCR（1999）克隆了人类 SYNCRIP，他们将其命名为 NSAP1。推导的 562 个氨基酸的蛋白质具有 4 个串联核糖核蛋白（RNP）结构域，其中第一个结构域仅具有部分 RNP 基序。C 末端一半包含一个短的富含酪氨酸的重复序列和较长的富含甘氨酸和精氨酸的重复序列，其中包括 7 个精氨酸-甘氨酸-甘氨酸（RGG）重复序列。NSAP1 与异质核 RNP R（HNRNPR; 607201）具有 80% 的氨基酸同一性。小鼠和人类 NSAP1 仅存在 1 个氨基酸不同。Northern 印迹分析在所有 8 个小鼠组织中检测到 5 个 2.3 至 7.8 kb 之间的 Nsap1 带。Western blot 分析显示，小鼠 LA9 皮肤成纤维细胞中 Nsap1 的表观分子质量约为 65 kD。

水谷等人（2000）克隆小鼠 Syncrip。推导的 561 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 62.5 kD。Syncrip 具有 3 个中心 RNA 结合结构域和一个带有 RGG 框的 C 端富含 arg 和 gly 的区域。N 末端一半也含有富含 tyr 的 YYGY 四肽，与 HNRNPR 类似。Syncrip 定位于转染的 COS-7 细胞的细胞质，并用来自小鼠小脑的粗制微粒体进行分级。免疫组织化学分析在大多数小鼠小脑神经元中检测到 Syncrip。

Lau 等人使用 RNA 编辑酶 APOBEC1（600130）作为诱饵，对人胎盘 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选（2001）克隆了一个 SYNCRIP 剪接变体，他们称之为 GRYRBP。推导的 623 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 69.6 kD。GRYRBP 有 3 个 RNA 识别基序，与之前报道的人类和小鼠 SYNCRIP 同工型一样（Harris 等，1999；Mizutani 等，2000），但它还具有一个 C 末端延伸，其中包含在这些亚型中未发现的核定位信号。同工型。Northern 印迹分析检测到一个主要的 4.4 kb GRYRBP 转录本和几个次要转录本，这些转录本在所检查的所有 16 个人体组织中都有不同的表达。

通过免疫组织化学分析，Bannai 等人（2004）发现 Syncrip 定位于培养的大鼠海马神经元的树突和细胞体中的颗粒。延时显微镜显示，荧光标记的小鼠 Syncrip 在树突中沿顺行和逆行方向移动。

帕索斯等人（2006）报道SYNCRIP，他们称之为HNRNPQ，编码3种亚型，HNRNPQ1、HNRNPQ2和HNRNPQ3，它们的表观分子质量分别约为63、67和70 kD。70-kD HNRNPQ3 同工型包含 623 个氨基酸。质谱分析显示 HNRNPQ2 和 HNRNPQ3 定位于 HeLa 细胞核部分。这些亚型的核定位需要其 C 端 RGG/RxR 框区域的精氨酸甲基化。

▼ 基因功能

Mizutani 等人使用体外 RNA 结合测定法（2000）发现小鼠 Syncrip 优先与聚（A） RNA 结合，与聚（U） RNA 结合较弱。对整个小鼠大脑的免疫沉淀分析表明，Syncrip 的 C 末端结构域与重组突触结合蛋白 II（SYT2；600104）的分离 C2B 结构域相互作用。体外结合测定表明 Syncrip 还与其他几种突触结合蛋白的分离 C2B 结构域相互作用。COS-7 细胞的免疫沉淀分析表明，内源 Syncrip 与转染的全长突触结合蛋白 VII（SYT7; 604146）、VIII（SYT8; 607719）和 IX（SYT9; 613528）相互作用。

Lau 等人使用蛋白质结合测定法（2001）证实固定化的 GRYRBP 与 APOBEC1 同二聚体结合。结构域分析显示 GRYRBP 的 C 末端结合 APOBEC1。在体外测定中，HepG2 人肝癌细胞中的 GRYRBP 的免疫耗竭消除了 APOB（107730） mRNA 的编辑。刘等人（2001）得出结论，GRYRBP 是 APOB 编辑复合体的一个组成部分。

Hresko 和 Mueckler（2002）发现 Syncrip 与小鼠 3T3-L1 脂肪细胞中的 Paip1（605184）和核糖体蛋白 S6（RPS6; 180460）阳性多聚体相关。RNAse 处理使 Syncrip 与多核糖体分离。从低密度微粒体中提取的 Syncrip 是胰岛素受体酪氨酸磷酸化的底物（INSR; 147670）。RNA 与 Syncrip 的结合抑制了 Insr 的酪氨酸磷酸化，但并没有改变 Syncrip 与多核糖体的关联。Hresko 和 Mueckler（2002）提出，胰岛素（INS; 176730）依赖性的 mRNA 翻译调节可能涉及 SYNCRIP 的磷酸化。

通过蛋白质组学分析，Bannai 等人（2004）发现表位标记的小鼠 Syncrip 与转染的人 293EBNA 细胞中 mRNA 加工颗粒的成分相互作用。大多数 Syncrip 相互作用蛋白是核糖体蛋白，包括核编码的线粒体核糖体蛋白。RNA 结合蛋白、剪接因子、DEAD 框解旋酶和 hnRNP 也被鉴定。班奈等人（2004）发现大鼠海马神经元中 Syncrip 阳性颗粒的运动需要微管，但不需要肌节蛋白细胞骨架。Syncrip 阳性颗粒含有内源性 Efi-α（EEF1A1; 130590）、转染的人 staufen-1（STAU1; 601716）和 Ip3r1（ITPR1; 147265）的 mRNA，后者在中枢神经系统神经元中表达。班奈等人（2004）得出结论，SYNCRIP 是神经元中 mRNA 处理颗粒的一个组成部分。

帕索斯等人（2006）发现精氨酸甲基化的药理抑制导致 HeLa 细胞中 HNRNPQ3 从细胞核部分重新分布到细胞质。

▼ 测绘

Hartz（2015）根据 SYNCRIP 序列（GenBank AF037448）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 SYNCRIP 基因对应到染色体 6q14.3。