ZIC家族,成员5; ZIC5
小脑锌指蛋白 5
奇配对相关蛋白的锌指蛋白;OPR
OPA 相关蛋白
HGNC 批准的基因符号:ZIC5
细胞遗传学位置:13q32.3 基因组坐标(GRCh38):13:99,962,964-99,971,909(来自 NCBI)
▼ 说明
ZIC5 属于 ZIC 蛋白家族,参与发育过程中的转录调节(Ishiguro 等,2004)。
▼ 克隆与表达
古岛等人(2000) 克隆了小鼠 Zic5,他们将其称为 Opr。推导的 622 个氨基酸蛋白具有一个假定的锌指区域,与果蝇奇数配对(opa) 蛋白具有 75% 的氨基酸同一性。与小鼠 Zic 蛋白一样,Opr 包含 5 个锌指基序和 C 端丝氨酸/苏氨酸区域。Opr 的锌指 2 至 5 与其他 Zic 蛋白中发现的相似,但 Opr 的指 1 与 Zic1(600470)、Zic2(603073) 和 Zic3(300265) 共享的指 1 不同,并且 Opr 的独特指 1 Zic4(608948)。Opr 还包含富含丙氨酸的簇、脯氨酸簇和丝氨酸/甘氨酸簇。它缺乏 opa 和 Zic1 至 Zic3 中发现的组氨酸簇以及 opa 中存在的谷氨酰胺簇。小鼠胚胎的原位杂交显示胚胎第 6 天(E6.0) 的外胚层中有 Opr 表达。E7.5 时外胚层前半部的表达增加,但在 E8.0 时转移至与预期背神经管相对应的神经嵴。表达持续存在于神经管和顶板的背中线直至E10.5,并且还在发育中的肢芽中发现了表达。
▼ 基因功能
Ishiguro 等人使用凝胶迁移率变化测定法(2004) 发现小鼠 Zic4 和 Zic5 的锌指结构域结合了 Zic1、Zic2 和 Zic3 也结合的 DNA 序列。然而,与 Zic1、Zic2 和 Zic3 不同,Zic4 和 Zic5 在 293T 细胞和 10T1/2 细胞中瞬时过表达后,在荧光素酶报告基因检测中不会激活转录。Imfa(MDFI; 604971) 已被证明可抑制 Zic1、Zic2 和 Zic3 的转录活性,但 Zic4 和 Zic5 在 293T 细胞中过表达时不会与 Imfa 共免疫沉淀。此外,Imfa 的过表达不会改变 NIH3T3 细胞中过表达的 Zic4 或 Zic5 的核定位。石黑浩等人(2004) 提出 Zic4 和 Zic5 缺乏 Zic1、Zic2 和 Zic3 中发现的 N 末端结构域,该结构域参与转录激活和 Imfa 结合。
▼ 测绘
Gross(2018) 根据 ZIC5 序列(GenBank AF378304) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZIC5 基因对应到染色体 13q32.3。