TBC1 域家族,成员 7; TBC1D7

细胞迁移诱导蛋白 23
PIG51
TBC7

HGNC 批准的基因符号:TBC1D7

细胞遗传学定位:6p24.1 基因组坐标(GRCh38):6:13,304,951-13,328,537(来自 NCBI)

▼ 说明

TBC1D7 属于共享 180 至 200 个氨基酸 TBC 结构域的蛋白质家族,推测在调节细胞生长和分化中发挥作用。这些蛋白质与 TRE2(USP6;604334)、酵母 Bub2 和 CDC16(603461)具有显着的同源性(Nakashima 等,2007)。

▼ 克隆与表达

中岛等人(2007) 通过与来自转染的 HEK293 细胞的结节性硬化症复合体蛋白 TSC1(605284) 和 TSC2(191092) 进行免疫共沉淀,鉴定出 TBC1D7,他们将其称为 TBC7。推导的 293 个氨基酸的 TBC1D7 蛋白包含一个推定的 TBC 结构域。SDS-PAGE显示TBC1D7表达为30-kD蛋白。Northern 印迹分析检测到大约 1.1 kb 的转录物,在人心脏中高表达,在肾、肝和胎盘中低表达。当 TBC1D7 和 TSC1 在 NIH3T3 细胞中表达时,免疫荧光研究将其共定位于细胞质;通过亚细胞分离,TBC1D7 定位于内膜的细胞质囊泡,与 TSC1-TSC2 形成复合物。

▼ 基因功能

通过免疫印迹和 GST Pull-down 测定,Nakashima 等人(2007)证实TBC1D7与TSC1-TSC2复合物相互作用。进一步的研究表明,TBC1D7 通过 TSC1 卷曲螺旋结构域的 C 端部分直接与 TSC1 相互作用。TBC1D7 的过表达通过 RPS6 激酶(RPS6KB1; 608938) 激活导致核糖体 S6 蛋白(RPS6; 180460) 在 ser235/236 处的磷酸化增加,表明 TBC1D7 在 mTOR 信号通路的正向调节中发挥作用。TBC1D7 的过度表达也增加了 TSC1 泛素化。

▼ 测绘

Gross(2014) 根据 TBC1D7 序列(GenBank AB449888) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 TBC1D7 基因对应到染色体 6p24.1。

▼ 分子遗传学

Capo-Chichi 等人在 2 名同胞中,由北非血统的近亲父母所生,患有常染色体隐性巨头畸形/巨脑畸形综合征(MGCPH; 248000) 和智力障碍(2013) 鉴定了 TBC1D7 基因中的纯合截短突变(612655.0001)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序发现的。患者细胞没有显示出 TBC1D7 mRNA 或蛋白质,这与无义介导的 mRNA 衰减一致。与对照相比,患者细胞表现出 mTORC1 复合物的组成型激活(参见 601231),这与 TBC1D7 发挥 mTORC1 上游调节因子的作用一致。

Alfaiz 等人在 2 名患有大头畸形和智力障碍的意大利姐妹中(2014) 鉴定了 TBC1D7 基因中的纯合截短突变(612655.0002)。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 巨头畸形/巨脑畸形综合征,常染色体隐性
TBC1D7,1-BP DEL,538T

Capo-Chichi 等人在 2 名同胞中,由北非血统的近亲父母所生,患有常染色体隐性巨头畸形/巨脑畸形综合征(MGCPH; 248000) 和智力障碍(2013) 在 TBC1D7 基因中发现了一个纯合 1-bp 缺失(538delT),导致移码和提前终止(Tyr180ThrfsTer1)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序发现的,并且与家族中的疾病分离。它不存在于 dbSNP(版本 135)、1000 个基因组计划或外显子组测序计划数据库中,也不存在于 700 多个内部外显子组数据集中或来自北非的 285 个对照个体中。患者细胞没有显示出 TBC1D7 mRNA 或蛋白质,这与无义介导的 mRNA 衰减一致。与对照相比,患者细胞表现出 mTORC1 复合物的组成型激活(参见 601231),这与 TBC1D7 发挥 mTORC1 上游调节因子的作用一致。

.0002 巨头畸形/巨脑畸形综合征,常染色体隐性
TBC1D7,4-BP DEL,17AGAG

在 2 名患有 MGCPH 的意大利姐妹中(248000),Alfaiz 等人(2014) 在 TBC1D7 基因中发现了一个纯合 4-bp 缺失(c.17_20delAGAG),导致移码和提前终止(Arg7ThrfsTer21)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在蛋白质印迹分析中,患者细胞未检测到 TBC1D7 蛋白,表明功能丧失。TBC1D7 蛋白的缺失与 4EBP1(602223) 磷酸化的增加相关,4EBP1(602223) 是 mTORC1 的下游靶标(参见 601231)。将突变转染到 HEK293 细胞中会导致自噬过程启动延迟,而这种缺陷可以通过表达野生型 TBC1D7 来弥补。研究结果表明,自噬受损会导致这种疾病。除了大颅骨和智力障碍之外,两姐妹还患有乳糜泻、肾草酸盐结石、骨关节缺陷和髌骨半脱位。