TECTONIC家族,成员 2; TCTN2

TECTONIC 2; TECT2

HGNC 批准的基因符号:TCTN2

细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:123,671,113-123,708,399(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索与 TCTN1(609863) 相似的序列,Reiter 和 Skarnes(2006) 鉴定出了小鼠和人类的 TCTN2 和 TCTN3(613847)。推导的小鼠Tctn2蛋白含有700个氨基酸。它具有果蝇构造中保守的 N 端信号肽和 C 端跨膜结构域。

▼ 测绘

Hartz(2011) 根据 TCTN2 序列(GenBank AK023037) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 TCTN2 基因对应到染色体 12q24.31。

▼ 基因功能

沙欣等人(2011) 进行 RT-PCR 来定量各种小鼠成体组织中 Tctn2 的表达。Tctn2 在所有组织中均表达,其中在脑、肾和眼以及受 MKS 表型影响的器官中表达显着。对小鼠发育表达的研究检测到胚胎第 8.5 天神经管中的显着表达,最明显的是在未来后脑的菱形中。到胚胎第 10.5 天,Tctn2 mRNA 遍布小鼠大脑、神经管的长度以及肢芽、心脏和眼睛的生长边缘。此外,在胚胎第 14.5 天小鼠胚胎的肾脏中观察到强 Tctn2 表达。

▼ 分子遗传学

梅克尔综合症8

沙欣等人(2011) 在分离 Meckel-Gruber 综合征 8(MKS8; 613885) 的家族中鉴定出 TCTN2 基因(613846.0001) 剪接位点突变的纯合性。

朱伯特综合症 24

Sang 等人在来自 3 个不相关家庭的 6 名患有 Joubert 综合征 24(JBTS24; 616654) 的患者中(2011) 鉴定了 TCTN2 基因中的 3 个不同的纯合突变(613846.0002-613836.0004)。这些突变是通过对患有纤毛病的家族进行基因组连锁分析以及针对通过针对纤毛病的网络疾病途径建模而确定的候选基因而发现的。尽管预测所有变体都会导致功能丧失,但尚未对这些变体进行功能研究。

一名 7.5 岁的土耳其男孩,由近亲父母出生,患有 JBTS24,Huppke 等人(2015) 鉴定了 TCTN2 基因中的纯合剪接位点突变(613846.0002)。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。没有可用于进一步研究的患者材料。

▼ 动物模型

加西亚-贡萨洛等人(2011) 发现 Tctn2 缺失的小鼠胚胎缺乏结纤毛,神经管中的纤毛稀缺且存在形态缺陷,无法延长轴丝。然而,基体正常对接至质膜。肢芽间充质中的纤毛数量减少,但纤毛看起来正常。这些发现与 Tctn1(609863) 缺失小鼠的结果相似,表明具有共同的功能,并表明 Tctn1 和 Tctn2 以组织特异性方式影响纤毛发生。加西亚-贡萨洛等人(2011) 还证明 Tctn2 和 Tctn1 与位于睫状轴丝和基体之间过渡区的大型复合物中的其他蛋白质相互作用。

▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):

.0001 梅克尔综合征,8 型(1 系列)
TCTN2,IVS13AS,AG,-2

Shaheen 等人在患有 Meckel-Gruber 综合征(MKS8;613885)的多重近亲阿拉伯家庭的受影响成员中(2011) 鉴定了 TCTN2 基因中外显子 14(1506-2A-G) -2 位置处剪接位点突变的纯合性,该突变破坏了剪接并产生了 2 个异常转录本。第一个转录物从内含子 13-14 引入 104 个碱基对,并删除 196 个原始氨基酸,引入 2 个新氨基酸,并在残基 504 处提前终止 697 个氨基酸的蛋白质。第二个转录物缺少外显子 14,并将删除 195 个原始氨基酸酸,引入 4 个新氨基酸,并在残基 507 处提前终止蛋白质。该突变与该家族中的疾病分离,并且在 192 个种族匹配的对照中未观察到。

.0002 朱伯特综合症 24
TCTN2,IVS10AS,GA,-1

Huppke 等人对一名 7.5 岁的土耳其男孩进行了研究,该男孩由近亲结婚生,患有 Joubert 综合征 24(JBTS24;616654)(2015) 鉴定了 TCTN2 基因内含子 10 中的纯合 G 到 A 转换(c.1235-1G-A, NM_024809.4)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,公共数据库中不存在该突变,包括 dbSNP(版本 138)或内部对照数据库。未受影响的母亲是该突变的杂合子。该突变预计会导致外显子 11 的框内跳跃和 26 个氨基酸的丢失。无法从患者身上获取 cDNA 来验证突变对转录本的影响。

桑等人(2011) 此前曾在一名 6 岁土耳其女孩(A1443 家族)的 TCTN2 基因中发现了这种突变(IVS10-1GA),该女孩由近亲父母出生,携带 JBTS24。该突变被证明会导致患者细胞中外显子 11 的框内跳跃。孩子未受影响的父母是杂合突变,而在 90 名白人和 86 名种族匹配个体的对照组中未发现这种突变。该突变是通过对纤毛病家族的基因组连锁分析以及针对通过针对纤毛病的网络疾病路径建模确定的候选基因发现的。

.0003 朱伯特综合症 24
TCTN2,GLN625TER

Sang 等人在 4 名同胞(MR20 家族)中,由近亲巴基斯坦父母所生,患有 Joubert 综合征 24(JBTS24;616654)(2011) 在 TCTN2 基因的外显子 16 中发现了纯合的 c.1873C-T 转换,导致 gln625 到 ter(Q625X) 的取代。该突变与家庭中的疾病分离。

.0004 朱伯特综合症 24
TCTN2,1-BP INS,77G

Sang 等人在一名患有 Joubert 综合征 24(JBTS24; 616654) 的东印度裔患者(UW95-3) 中(2011) 在 TCTN2 基因的外显子 1 中发现了纯合 1-bp 插入(c.77insG),导致移码和提前终止(Asp26GlyfsTer51)。