RAS 相关蛋白 34; RAB34
RAH,小鼠,同源物;RAH
HGNC 批准的基因符号:RAB34
细胞遗传学位置:17q11.2 基因组坐标(GRCh38):17:28,714,281-28,718,428(来自 NCBI)
▼ 说明
RAB 蛋白,如 RAB34,是小 GTP 酶,可沿着胞吞作用和胞吐作用途径调节囊泡出芽、对接和融合(Chen 等,2003)。
▼ 克隆与表达
Chen 等人通过对人类树突状细胞 cDNA 文库进行测序,然后进行数据库分析(2003) 克隆了 RAB34 和一个剪接变体,他们将其称为 RAB39。全长蛋白有 259 个氨基酸,较短的变体有 211 个氨基酸,计算分子量为 23.7 kD。两种亚型均含有 3 个磷酸盐/Mg(2+) 结合基序、2 个鸟苷结合基序、一个 ATP/GTP 结合位点和一个肉豆蔻酰化位点。较短的变体包含 C 端微体靶向信号。全长蛋白质缺乏这种靶向信号,但有 48 个额外的 C 端残基。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到 1.4 kb RAB34 转录物,在肝脏中高表达,在脾、结肠、心脏、胎盘、肺、骨骼肌和肾中中等表达,在所有其他检查组织中低表达。在大多数检查的组织中还发现了较小的 2.0-bk 转录物,并且在脾脏和肝脏中检测到了 4.4-kb 转录物。RT-PCR检测到上皮肿瘤细胞系中高表达。荧光标记的 RAB34 定位于核周高尔基体相关细胞器。
孙等人(2003) 克隆了小鼠 Rab34,他们将其称为 Rah。推导的 259 个氨基酸的蛋白质包含小 GTP 酶特有的 4 个保守序列基序中的前 3 个。它还含有 C 端香叶基香叶基化基序和对应于效应结构域第一个氨基酸的酪氨酸磷酸化位点。Rah 与 RAB36(605662) 关系最密切,它也缺少最后一个 GTPase 共有序列。在小鼠成纤维细胞中,Rah 与肌节蛋白共定位于膜褶边和相邻巨胞质体的膜。
▼ 基因功能
陈等人(2003) 发现,在 RAB34 瞬时过表达后,HeLa 细胞中荧光牛血清蛋白的内吞作用增加了 2 至 3 倍。
孙等人(2003) 发现小鼠 Rah 主要与新生巨胞质体相关,而 Rab5(RAB5A; 179512) 则存在于后期的内体中。Rah 的过度表达使巨脂质体的数量增加了约 2 倍。野生型 Rah 促进血小板衍生生长因子(参见 173430)或佛波酯处理后巨脂质体的形成,而显性失活 Rah 突变体则抑制巨脂质体的形成。Rah 促进的巨胞质体形成被 Rac1(602048) 和 Wave2(WASF2; 605875) 的显性失活突变体所阻碍,这对于膜波纹至关重要。孙等人(2003) 得出结论,Rah 是膜皱褶有效形成巨胞质体所必需的。
Speight 和 Silverman(2005) 使用细菌双杂交系统筛选肾脏 cDNA 文库,结果表明 RAB34 结合 MUNC13(UNC13B;605836),这是一种胞质二酰基甘油(DAG) 结合蛋白。当共表达时,两种蛋白质都与高尔基体相关。MUNC13结合了能够结合但不水解GTP的RAB34突变体,但它不结合只能结合GDP的RAB34突变体。MUNC13 中第二个 MUNC 同源结构域的删除消除了与 RAB34 的相互作用。GTP-RAC34突变体定位于高尔基体,GDP-RAC34突变体定位于胞质。DAG 激活不会改变突变体和野生型 RAB34 的定位。Speight 和 Silverman(2005) 得出结论,MUNC13 的 DAG 激活导致其易位至高尔基体,在高尔基体中与 GTP 结合的 RAB34 结合。他们指出 RAB34 调节细胞内溶酶体定位,并提出 MUNC13 在溶酶体-高尔基体转移中充当 RAB34 效应子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Chen 等人(2003) 将 RAB34 基因定位到染色体 17q11.1。