含三联基序的蛋白质 3; TRIM3
环指蛋白 22;RNF22
大脑表达的无名指;BERP
HGNC 批准的基因符号:TRIM3
细胞遗传学位置:11p15.4 基因组坐标(GRCh38):11:6,448,613-6,474,459(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
El-Husseini 和 Vincent(1999) 筛选了大鼠小脑 mRNA 中的核苷酸结合蛋白。他们使用所得 RT-PCR 产物作为探针筛选大鼠脑 cDNA 文库,孤立出一种新型无名指 cDNA Rnf22,并将其命名为 Berp。Berp 编码 RING 指蛋白 RBCC 亚组的成员,其特征为 3 个基序:N 端环指、B 框锌指和卷曲螺旋结构域。大鼠 Berp 蛋白包含一个 130 个氨基酸的区域,与肌节蛋白结合蛋白中存在的重复结构域有 41% 的同一性。它的 C 末端包含 6 个重复序列,预计会形成类似于 WD 和 kelch 蛋白的圆形 β 螺旋桨。Northern印迹分析检测到Berp在小脑中表达最高,在其他大脑区域以及肺、肝、肾和心脏中表达较弱。使用酵母 2-杂交系统和免疫沉淀实验,Berp 在细胞质中表达,其点状模式类似于内源性肌球蛋白 Va(MYO5A; 160777),这是细胞器相关蛋白的特征模式。
El-Husseini 等人使用大鼠 Berp 筛选海马 cDNA 文库,然后进行 EST 数据库分析和小脑总 RNA 的 RT-PCR(2001) 克隆人类 BERP。推导的 744 个氨基酸的辅助蛋白具有 N 端环指,随后是 B 框基序、卷曲螺旋结构域、推定的肌节蛋白结合蛋白样 β 折叠结构和预测的 C 端 6 叶片β-螺旋桨域。人类 BERP 与大鼠和小鼠 Berp 具有 98% 的氨基酸同一性,与推定的秀丽隐杆线虫直系同源物具有约 30% 的同一性。Northern 印迹分析检测到人脑中一个主要的 3 kb 转录本。EST数据库分析表明BERP也在乳腺、心脏、子宫和睾丸中表达。
▼ 基因功能
El-Husseini 和 Vincent(1999) 证明大鼠 BERP 的 RBCC 结构域可以同源二聚化。此外,Berp 的 C 端重复序列与 V 类肌球蛋白相互作用。El-Husseini 和 Vincent(1999) 假设 BERP 可能介导与各种蛋白质的相互作用,从而允许通过肌球蛋白 V 介导的途径进行货物转移。BERP 与 V 类肌球蛋白的相互作用在细胞器转移和神经突生长中也可能很重要。
埃尔-侯赛尼等人(2000) 证明了大鼠 BERP 的 RBCC 结构域与 α-肌节蛋白非肌肉亚型 Actn4 的大鼠脑 cDNA 之间的相互作用(604638)。El-Husseini 等人使用免疫组织化学(2000) 表明 Berp 和 Actn4 在分化的 PC12 细胞的细胞质和神经突中以点状表达。他们得出的结论是,BERP 可能通过与 ACTN4 的相互作用将 V 类肌球蛋白锚定到特定的细胞结构域。
Cheung 等人使用突变分析和报告基因检测(2010) 发现人 BERP 启动子区域中 4 个假定的 p53(TP53; 191170) 结合位点中只有 1 个激活了 BERP 表达。类似地,用戊四唑治疗上调 p53 +/+ 小鼠海马神经元中的 Berp 表达,但不上调 p53 -/- 海马神经元中的 Berp 表达。
▼ 基因结构
埃尔-侯赛尼等人(2001)确定TRIM3基因包含11个编码外显子。
张等人(2010) 在 TRIM3 基因的内含子 1 内发现了一个功能性 p53 结合位点。
▼ 测绘
El-Husseini 等人使用 FISH(2001) 将 TRIM3 基因定位到染色体 11p15.5。
▼ 动物模型
张等人(2010) 发现 Berp -/- 小鼠以预期的孟德尔比率出生,并且能够存活、健康且具有生育能力,没有肉眼或组织学异常。Berp -/- 小鼠比野生型小鼠对戊四氮诱导的癫痫发作具有更强的抵抗力。膜片钳记录显示,与野生型神经元相比,Berp -/- 小鼠的皮质神经元表现出平均微型抑制性突触后电流频率和幅度降低,这似乎是由于 Gabrg2(137164) GABA 受体亚基的表面表达减少所致。Berp -/- 神经元中的 Gabrg2 mRNA 含量没有改变。