BRD4-相互作用染色质重塑复合物相关蛋白样; BICRAL

神经胶质瘤肿瘤抑制候选区域基因 1 样;GLTSCR1L
KIAA0240

HGNC 批准的基因符号:BICRAL

细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:42,746,339-42,868,556(来自 NCBI)

▼ 说明

SWI/SNF 染色质重塑复合物是基因调控和基因组完整性所需的相关蛋白质复合物的异质集合。所有 SWI/SNF 复合物均包含 BRM(SMARCA2;600014) 或 BRG1(SMARCA4;603254) 作为中心 ATP 酶,以及 10 至 14 个辅助亚基。BICRA(605690) 和 BICRAL 是包含 BRD9(618465) 的 SWI/SNF 子复合体的互斥组件和共享规范 SWI/SNF 亚基的子集(Alpsoy 和 Dykhuizen, 2018)。

▼ 克隆与表达

长濑等人(1996) 从 KG-1 人类未成熟骨髓细胞系 cDNA 文库中克隆了 BICRAL,他们将其称为 KIAA0240。推导的蛋白质含有983个氨基酸。Northern 印迹分析检测到 BICRAL 在人体组织和细胞系中普遍表达。

Alpsoy 和 Dykhuizen(2018) 报道称,人类 BICRAL 蛋白含有 1,079 个氨基酸。BICRAL 和 GLTSCR1(BICRA) 在其 N 端区域和 C 端结构域中具有显着的同源性。

▼ 基因功能

Alpsoy 和 Dykhuizen(2018) 通过对小鼠和人类细胞进行免疫沉淀和梯度分析,将 GLTSCR1 鉴定为一种新型 SWI/SNF 染色质重塑子复合物的亚基,他们将其称为 GBAF。敲除和过表达分析表明 GBAF 含有 GLTSCR1 或其旁系同源物 BICRAL。GLTSCR1 和 BICRAL 是 GBAF 的互斥亚基,部分定义了 SWI/SNF 复合物的化学计量。除了 GLTSCR1 或 BICRAL 之外,GBAF 还包含 BRD9 和 BAF 亚基 BAF155(SMARCC1;601732)、BAF60(参见 601735)、SS18(600192)、BAF53A(ACTL6A;604958)和 BRG1/BRM。GBAF 的体外 ATP 酶活性和本体染色质亲和力与 BAF SWI/SNF 复合物相当。免疫沉淀分析显示 GLTSCR1 与 BRD4 相关(608749)。然而,LNCaP 细胞的活力不需要 GLTSCR1,因为 LNCaP 细胞对 LNCaP 细胞中 BRD4 抑制或 BRD4 介导的 MYC(190080) 转录敏感。免疫印迹分析在大多数检查的细胞系中检测到相似水平的 GLTSCR1 和 BICRAL 表达,但仅在 PC3 前列腺癌细胞中,GLTSCR1 和 BICRAL 是细胞活力所必需的。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1996) 将 BICRAL 基因定位到 6 号染色体。

Gross(2019) 根据 BICRAL 序列(GenBank BC130302) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 BICRAL 基因对应到染色体 6p21.1。