RNA 结合基序蛋白 15; RBM15
OTT
1-20 2 蛋白质 1;OTT1
本条目中代表的其他实体:
RBM15/MKL1 融合基因,包括在内
HGNC 批准的基因符号:RBM15
细胞遗传学定位:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:110,339,377-110,346,677(来自 NCBI)
▼ 说明
SPEN(分裂末端)蛋白家族的成员,包括 RBM15,在多种信号传导途径中具有阻抑功能,并且可以通过与剪接体成分的相互作用与 RNA 结合(Hiriart 等,2005)。
▼ 克隆与表达
默彻等人(2001) 鉴定了 RBM15,他们将其称为 OTT,并确定推导的 957 个氨基酸的蛋白质包含 3 个 N 端 RNA 识别基序和一个保守的 C 端 SPOC 结构域。RBM15 与 OTT3(RBM15B; 612602) 和人类 SPEN(也称为 SHARP)具有密切的同源性。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到 8.3-kb 转录物,在心脏、肌肉、胸腺、肾脏、胎盘和外周血白细胞中强表达,在脑、结肠、脾、肝、小肠和肺中表达较弱,并且3.9-kb 转录本,在肌肉、脾脏和肾脏中强表达。
▼ 基因功能
Horiuchi 等人使用质谱分析来鉴定用 WTAP(605442) 从人脐静脉内皮细胞(HUVEC) 中免疫沉淀的蛋白质(2013) 鉴定了一种蛋白质复合物,其中包括 RBM15、HAKAI(CBLL1; 606872)、virilizer(KIAA1429; 616447)、ZC3H13(616453)、BCLAF1(612588) 和 THRAP3(603809)。WTAP 复合物定位于 HeLa 细胞和 HUVEC 的核斑点,交联实验表明它与剪接因子短暂相关。敲除任何 WTAP 复合体成分(包括 RBM15),减少 WTAP 的选择性剪接,导致全长 WTAP 蛋白的产量增加,并减少细胞增殖,细胞周期停滞在 G2 期。BCLAF1 和 THRAP3 的敲低降低了其他 WTAP 复合物成分的核斑点定位。
帕蒂尔等人(2016) 证明,在人类细胞中,XIST(314670) 高度甲基化,至少有 78 个 N6-甲基腺苷(m6A) 残基。m6A 在长非编码 RNA 中的功能尚未得到证实。帕蒂尔等人(2016) 表明 XIST 以及细胞 mRNA 中 m6A 的形成是由 RBM15 及其旁系同源物 RBM15B 介导的,它们结合 m6A 甲基化复合物并将其募集到 RNA 中的特定位点。这导致相邻 m6A 共有基序中的腺苷核苷酸甲基化。此外,帕蒂尔等人(2016) 表明,RBM15 和 RBM15B 的敲低,或 METTL3(612472)(一种 m6A 甲基转移酶)的敲低,会损害 XIST 介导的基因沉默。m6A 结合蛋白的系统比较表明,YTHDC1 优先识别 XIST 上的 m6A 残基,并且是 XIST 功能所必需的。此外,YTHDC1 与 XIST 的人工连接可挽救 m6A 丢失时 XIST 介导的沉默。这些数据揭示了 XIST 介导的转录抑制所需的 m6A 形成和识别途径。
▼ 基因结构
默彻等人(2001) 确定 RBM15 基因包含 2 个外显子。
▼ 测绘
RBM15 基因定位于染色体 1p13(Mercher 等,2001;Ma 等,2001)。
▼ 细胞遗传学
复发性 t(1;22)(p13;q13) 易位仅与婴儿急性巨核细胞白血病(AMKL、FAB-M7)相关。默彻等人(2001) 和 Ma 等人(2001) 证明这种染色体重排导致 2 个基因的融合。这两个基因在果蝇基因组中具有同源序列。Mercher 等人将 22 号染色体基因(参见 606078)命名为 MAL(2001) 和 Ma 等人的 MKL1(2001)。1 号染色体基因,被 Ma 等人称为 RNA 结合基序蛋白 15(RBM15)(2001),被 Mercher 等人称为 OTT(“一-二十二”)(2001)。Mercher 等人的结构分析(2001)表明OTT启动子启动融合RNA的转录,该融合RNA将编码包含几乎所有OTT和MAL产物的融合蛋白,而相互的融合转录物将编码共同易位中的17个氨基酸肽。OTT-MAL 产品具有与 HRX 融合(159555) 相同的几个特征,HRX 融合是婴儿急性白血病中常见的另一种融合。两种融合蛋白预计将通过结合富含 AT 的 DNA 序列参与染色质组织,这些 DNA 序列可被 HRX 融合中的 AT 钩基序和 OTT-MAL 融合中的 SAF(支架附着因子)框识别。
马等人(2001) 发现虽然两个相互融合转录本都在 AMKL 中表达,但预测的 RBM15-MKL1 嵌合蛋白涵盖了每个基因编码的所有推定功能基序,因此是 t(1;22) 的候选癌蛋白。
默彻等人(2002)报道了 3 例发生在婴儿中的急性巨核细胞白血病(M7) 病例,并表明 RBM15-MKL1 融合基因存在于迄今为止研究的所有 5 t(1;22) 病例中。对 2 个易位断点的核苷酸序列分析表明,该易位的起源中存在非同源末端连接机制,并揭示了 RBM15 基因内的非典型拓扑异构酶 II(126430) 样共有序列。默彻等人(2002) 表明他们的研究中使用的 FISH 和 PCR 技术对于识别与 M7 相关的 t(1;22) 非常有用。
▼ 动物模型
拉斐尔等人(2009) 指出 Ott1 缺失的小鼠胚胎在胚胎第 9.5 天左右死亡。然而,他们发现死亡可能是由于早期胎盘滋养层发育和胎盘血管分支的特定缺陷所致。条件性敲除方案避免了滋养层中 Ott1 的缺失,从而挽救了胎盘表型,并揭示了 Ott1 在心脏、脾脏和脉管系统发育中的关键作用。获得的条件性 Ott1 -/- 小鼠的比例接近孟德尔比例,但它们在出生后几小时内死亡。突变小鼠经常表现出心包积液、膜性室间隔缺损和外显率不同的脾功能减退症。在胚胎第 18.5 天收获的 Ott1 -/- 胚胎通常是水肿的,与心力衰竭一致。拉斐尔等人(2009) 得出结论,OTT1 是中胚层组织发育的关键因素。