丙氨酰-tRNA 合成酶 2; AARS2
丙氨酰-tRNA 合成酶,线粒体
MT-ALARS
KIAA1270
HGNC 批准的基因符号:AARS2
细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:44,298,731-44,313,347(来自 NCBI)
▼ 说明
AARS2 基因编码线粒体丙氨酰-tRNA 合成酶,该酶负责在线粒体翻译过程中用丙氨酸对 tRNA-ala 进行充电(Gotz 等人总结,2011)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,(1999) 克隆了 AARS2,他们将其命名为 KIAA1270。该mRNA的3-prime末端含有重复元件,推导的986个氨基酸的蛋白质与人AARS(601065)有46%的同一性。RT-PCR ELISA 显示所有成人和胎儿组织中均存在 AARS2 中度至高表达,其中卵巢中表达最高。在所有检查的成人大脑区域中表达都很高。
Bonnefond 等人通过搜索 tRNA 合成酶数据库(2005) 确定了 AARS2,他们将其称为 MT-ALARS。推导的 985 个氨基酸的蛋白质具有 68 个氨基酸的线粒体靶向信号,从而产生 917 个氨基酸的成熟蛋白质。AARS2 是一种 II 类氨基酸 tRNA 合成酶,其 C 端活性位点结构域通过短铰链与 N 端反密码子结合结构域相连。
▼ 基因结构
博内丰德等人(2005) 确定 AARS2 基因包含 22 个外显子,跨度为 13.7 kb。
▼ 测绘
通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1999) 将 AARS2 基因定位到 6 号染色体。
▼ 分子遗传学
联合氧化磷酸化缺陷 8
通过外显子组测序,Gotz 等人(2011) 在一名患有联合氧化磷酸化缺陷 8(COXPD8; 614096) 的芬兰女孩中发现了 AARS2 基因(R592W; 612035.0001) 的纯合突变,表现为致命的婴儿肥厚性线粒体心肌病并在 10 个月时死亡。第二名无关的芬兰女婴患有更严重的线粒体心肌病,导致 3 天时死亡,被发现为 R592W 突变和第二个突变(612035.0002) 的复合杂合子。这些突变分别影响编辑和催化氨酰化结构域。两名患者的心脏组织中几乎完全缺乏呼吸复合物 I、III 和 IV,而大脑和骨骼肌的缺陷则较轻。肝脏没有受到影响。
Taylor 等人在 5 名不相关的欧洲血统患者中发现了 COXPD8,表现为致命的婴儿心肌病(2014)鉴定了AARS2基因中的纯合或复合杂合突变(参见例如612035.0001和612035.0003)。所有患者至少在 1 个等位基因上携带 R592W 突变,单倍型分析表明该突变具有创始人效应。没有进行变体的功能研究。这些患者是一项对 53 名线粒体呼吸链复合物缺陷患者进行的研究的一部分,这些患者接受了全外显子组测序。
伴有卵巢功能衰竭的进行性白质脑病
Dallabona 等人在 6 名进行性白质脑病(LKENP; 615889) 患者中进行了研究,其中包括 5 名患有卵巢早衰的女性(2014)鉴定了AARS2基因中的复合杂合突变(参见例如612035.0004-612035.0007)。前两名患者的突变是通过全外显子组测序发现的。对另外 11 名脑白质营养不良患者中的 4 名进行的 AARS2 基因直接测序发现了致病性双等位基因突变。这些患者患有严重的神经退行性疾病,其特征是运动和认知技能丧失,在成年早期发病。对 2 个变体(F50C,612035.0004 和 R521X,612035.0005)的酵母同源物的研究表明,它们导致蛋白质功能完全或部分丧失;尚未进行其他变体的功能研究。
▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):
.0001 组合氧化磷酸化缺陷 8
AARS2、ARG592TRP(rs138119149)
Gotz 等人在一名患有联合氧化磷酸化缺陷 8(COXPD8; 614096) 的芬兰女孩中表现为致命的婴儿肥厚性线粒体心肌病(2011) 在 AARS2 基因的外显子 13 中发现了一个纯合的 1774C-T 转变,导致 arg592 到 trp(R592W) 的取代,预计会损害编辑域,导致误译。该患者在 10 个月大时死亡。每个未受影响的亲本都是该突变的杂合子。一名患有该疾病的无关芬兰女婴被发现为 R592W 突变和外显子 3 中 464T-G 颠换的复合杂合子,导致 leu155 到 arg(L155R;612035.0002)的取代,影响催化氨酰化结构域并导致缺乏tRNA 氨酰化。她在出生第三天就去世了。她的父母是各自突变的杂合携带者。这两种突变均影响高度保守的残基,并且在 400 条芬兰对照染色体中未发现。这些突变导致患者心脏中呼吸链复合物 I、III 和 IV 几乎完全缺乏,导致肥厚性心肌病的主要表现,尽管大脑和骨骼肌也表现出较轻微的呼吸链缺陷,表明多系统存在缺陷。紊乱。两名患者的肝脏均未受到影响。
泰勒等人(2014) 在 5 名不相关的欧洲血统患者中发现了 R592W 突变(rs138119149),COXPD8 表现为致命性婴儿心肌病。两名患者为突变纯合子,而 3 名患者为 R592W 和另一种致病性突变的复合杂合子(参见例如 612035.0003)。这些突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。R592W 在 1000 个基因组计划数据库或 238 个内部对照中未发现,但在外显子组测序计划数据库中以非常低的频率(0.0002) 出现。单倍型分析表明 R592W 具有创始人效应。
.0002 组合氧化磷酸化缺陷 8
AARS2、LEU155ARG
Gotz 等人讨论了 AARS2 基因中的 leu155 至 arg(L155R) 突变,该突变在合并氧化磷酸化缺陷 8(COXPD8;614096) 的患者中以复合杂合状态发现(2011),参见 612035.0001。
在酵母研究中,Dallabona 等人(2014) 发现 L155R 突变表现为无效等位基因。
.0003 组合氧化磷酸化缺陷 8
AARS2,1-BP INS,647G
Taylor 等人在一名患有联合氧化磷酸化缺陷 8(COXPD8; 614096) 的英国女孩中表现为致命的婴儿心肌病(2014) 鉴定了 AARS2 基因中 2 个突变的复合杂合性:1 bp 插入(c.647_648insG),导致移码和提前终止(Cys218LeufsTer6) 和 R592W(612035.0001)。她在 3 个月大时去世。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。c.647insG 突变不存在于外显子组测序计划、1000 基因组计划或 dbSNP(版本 137)数据库或 238 个内部对照中。
.0004 进行性白质脑病,伴有卵巢衰竭
AARS2、PHE50CYS
Dallabona 等人在一名患有进行性白质脑病并伴有卵巢功能衰竭的年轻女性中(LKENP; 615889)(2014) 鉴定出 AARS2 基因中的复合杂合突变:外显子 1 中的 c.149T-G 颠换,导致氨酰化结构域中高度保守的残基处发生 phe50 至 cys(F50C) 取代,以及 c.1561C外显子 11 中的 -T 转换,导致 arg521 至 ter(R521X;612035.0005)的取代。这些突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在外显子组变异服务器数据库中的出现频率低于 0.01%。对酵母ala1同源物的研究表明,截短突变体未能在功能不健全的菌株中恢复生长,这与功能丧失一致。错义突变在 28 摄氏度下与野生型相似,但它导致在 37 摄氏度下生长减少。研究结果表明,F50C 突变仅在应激条件下才是有害的。
.0005 进行性白质脑病,伴有卵巢衰竭
AARS2,ARG521TER
Dallabona 等人讨论了 AARS2 基因中的 arg521-to-ter(R521X),该基因在患有进行性白质脑病伴卵巢衰竭的患者(LKENP; 615889) 中以复合杂合状态被发现(2014),参见 612035.0004。
.0006 进行性白质脑病,伴有卵巢衰竭
AARS2,GLY965ARG
Dallabona 等人在一名患有进行性白质脑病(LKENP; 615889) 的男性中(2014) 鉴定出 AARS2 基因中的复合杂合突变:c.2893G-A 转变,导致 gly965 到 arg(G965R) 取代,以及 c.1213G-A 转变,导致 glu405 到 lys(E405K;612035.0007)替代。这些突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在外显子组变异服务器数据库中的出现频率低于 0.01%。没有对该变体进行功能研究。
.0007 进行性白质脑病,伴有卵巢衰竭
AARS2,GLU405LYS
讨论 Dallabona 等人在患有进行性白质脑病(LKENP; 615889) 的患者中以复合杂合状态发现的 AARS2 基因中的 glu405-to-lys(E405K) 突变(2014),参见 612035.0006。