Ly1 抗体反应蛋白; LYAR

Ly1 抗体反应蛋白,小鼠,同源物

HGNC 批准的基因符号:LYAR

细胞遗传学定位:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:4,267,701-4,290,154(来自 NCBI)

▼ 说明

LYAR 是一种转录因子,可结合并沉默 γ-珠蛋白基因(参见 142200)(Ju et al., 2014)。

▼ 克隆与表达

苏等人(1993) 用抗 Ly1(CD5; 153340) 筛选了 EL4 小鼠白血病 T 细胞系 cDNA 文库并鉴定了 Lyar。推导的 388 个氨基酸蛋白包含 2 个假定的 N 端锌指结构域、一个酪氨酸磷酸化位点、3 个核定位信号、一个高电荷区域和一个 C 端 cAMP 依赖性蛋白激酶(参见 601639)磷酸化位点。免疫印迹分析在 EL4 细胞中检测到 45 kD 蛋白质,但在小鼠骨髓来源的基质细胞系中未检测到。免疫荧光分析显示,Lyar 主要在小鼠白血病 B 细胞和 T 细胞、小鼠胚胎成纤维细胞和转染的 COS-7 细胞的核仁中表达。Northern 印迹分析显示,Lyar 在小鼠白血病 B 细胞和 T 细胞中高表达,但在小鼠骨髓源性基质细胞系或细胞毒性 T 细胞系中不表达。在成年小鼠组织中,睾丸中表达量较高,肾脏和脾脏中表达量较低,脑、胸腺、肝脏、骨髓、心脏和肌肉中不表达。在小鼠胚胎干细胞和整个小鼠胚胎中表达也很高。原位杂交显示Lyar在小鼠胎儿肝脏和胸腺以及未成熟精母细胞中表达。

▼ 基因功能

苏等人(1993)发现过表达小鼠Lyar的小鼠成纤维细胞在体外没有被转化,但它们在裸鼠中形成肿瘤的能力增加。他们提出 LYAR 是一种参与细胞生长调节的核仁癌蛋白。

通过免疫沉淀和下拉分析,Ju 等人(2014) 发现 LYAR 与 K562 人红白血病细胞中的 PRMT5(604045) 相互作用。免疫荧光分析证明 PRMT5 和 LYAR 在 K562 细胞核中共定位。染色质免疫沉淀分析显示 LYAR 与人 γ-珠蛋白启动子结合,但不与 MYOD(159970) 启动子结合。LYAR 优先与 GGTTAT 基序结合。LYAR 抑制 K562 细胞和原代人成人红系祖细胞中的 γ-珠蛋白表达。朱等人(2014) 得出结论,LYAR 与 γ-珠蛋白基因的 5-prime UTR 结合,对于沉默胎儿珠蛋白基因表达至关重要。

▼ 测绘

Gross(2017) 根据 LYAR 序列(GenBank BC015796) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 LYAR 基因对应到染色体 4p16.3。

苏等人(1993) 将小鼠 Lyar 基因定位到 1 号染色体,与 Idh1 基因(147700) 紧密相连。