载脂蛋白 B mRNA 编辑酶,催化多肽样 3C; APOBEC3C

A3C

HGNC 批准的基因符号:APOBEC3C

细胞遗传学位置:22q13.1 基因组坐标(GRCh38):22:39,014,257-39,020,352(来自 NCBI)

▼ 说明

APOBEC3C 与 APOBEC1(600130) 相关,APOBEC1(600130) 是一种胞苷脱氨酶,负责载脂蛋白 B(APOB; 107730) mRNA 的胞苷至尿苷编辑(Jarmuz 等人,2002)。

▼ 克隆与表达

Jarmuz 等人通过使用 RNA 编辑胞苷脱氨酶的特征序列作为探针搜索 EST 数据库,然后使用来自 HeLa 细胞的 RNA 进行 RACE(2002)克隆APOBEC3C。推导的 190 个氨基酸蛋白共享 APOBEC1 的整体结构域结构,包括活性位点、接头区域和假活性位点,但缺少 N 端 α 螺旋。Northern印迹分析检测到脾、睾丸、外周血白细胞、心脏、胸腺、前列腺和卵巢中中度至高表达。在其他组织中也发现了中度至低度的表达,包括结肠。APOBEC3C 在结直肠腺癌和慢性粒细胞白血病细胞中高水平表达,在其他几种淋巴瘤和白血病细胞系中表达水平较低。

▼ 基因功能

哈里斯等人(2002) 表明 APOBEC1 及其同源物 APOBEC3C 和 APOBEC3G(607113) 在大肠杆菌测定中表现出有效的 DNA 突变活性。这些蛋白质似乎通过 dC 脱氨基作用触发 DNA 突变,并且每种蛋白质都表现出独特的局部靶序列特异性。结果揭示了一系列潜在的活性 dC/dG 突变体的存在,可能对癌症产生影响。

Vartanian 等人指出,三种人类 APOBEC3 基因:APOBEC3A(607109)、APOBEC3B 和 APOBEC3H(610976) 在角质形成细胞和皮肤中表达(2008) 调查人乳头瘤病毒 DNA 是否发生基因编辑。在一项针对 HPV1a 跖疣和 HPV16 癌前宫颈活检的研究中,发现了过度编辑的 HPV1a 和 HPV16 基因组。从使用 HPV 质粒 DNA 和 3 种核定位酶 APOBEC3A、APOBEC3B 和 APOBEC3H 的转染实验中获得了严格类似的结果。因此,瓦尔塔尼安等人(2008) 表明 APOBEC3 基因的随机或短暂过度表达可能会使基因组暴露于可能影响肿瘤发展的广泛突变。

▼ 生化特征

通过对 A3C 的结构进行建模和探测,Stauch 等人(2009) 表明,A3C 二聚化对于使用胚胎肾和骨肉瘤细胞系的非洲绿猴免疫缺陷病毒系统的抗病毒活性至关重要。他们在 A3C 中发现了一个类似于已知酶的核酸结合口袋的空腔,并发现该空腔对于 A3C 衣壳化和 5.8S RNA 结合非常重要。斯托赫等人(2009) 提出 A3C 的结合袋与 RNA 相互作用,并且这种相互作用是核衣壳结合介导的衣壳化所必需的,但抗病毒活性需要 A3C 二聚化。

▼ 基因结构

贾木兹等人(2002) 确定 APOBEC3C 基因包含 4 个外显子,并且 5 引物非翻译区包含长重复序列。启动子区域没有 TATA 或 CATT 框。

▼ 测绘

作者:FISH,Jarmuz 等人(2002) 将 APOBEC3C 基因对应到染色体 22q13.1-q13.2 上的 APOBEC3 基因和假基因簇。他们确定这些APOBEC3基因都是沿着着丝粒到端粒的方向转录的。