ATXN7 反义 RNA 1； ATXN7AS1

SCA7 反义非编码转录 1；SCAANT1

HGNC 批准的基因符号：SCAANT1

细胞遗传学定位：3p14.1 基因组坐标（GRCh38）：3:63,911,518-63,911,772（来自 NCBI）

▼ 说明

ATXN7AS1 或 SCAANT1 是一种非编码调节 RNA，源自 ATXN7 基因（607640） 的相反链，并通过替代启动子调节 ATXN7 表达（Sopher et al., 2011）。

▼ 克隆与表达

索弗等人（2011） 克隆人类 SCAANT1。RT-PCR 和 5-prime RACE 鉴定了 ATXN7 基因内含子 4 中的转录起始位点。人体组织的定量 RT-PCR 显示 ATXN7 和 SCAANT1 的反向表达。ATXN7在皮质、小脑、纹状体和肝脏中表达较高，在肺和肾脏中表达较弱，而SCAANT1在脑组织和肝脏中表达较弱，在肺和肾脏中表达较高。

▼ 基因功能

ATXN7 外显子 3 中 CAG 束的扩张导致脊髓小脑共济失调 7（SCA7; 164500）。通过定性 RT-PCR，Sopher 等人（2011）发现SCA7患者成纤维细胞和外周血样本中ATXN7表达异常升高，SCAANT1表达降低。他们生成了表达约 13.5 kb 人 ATXN7 小基因构建体的转基因小鼠，该构建体包含 SCAANT1，SCAANT1 是 ATXN7 内含子 2 3 引物末端的替代启动子（P2A），是外显子 3 中的 ATXN7 翻译起始位点，是外显子 3 中的致病性 CAG 扩展，以及位于外显子 3 侧翼的野生型或突变型 CTCF（604167） 结合位点。具有突变型 CTCF 结合位点的转基因小鼠（而非具有野生型 CTCF 结合位点的转基因小鼠）表现出 CTCF 结合减少、ATXN7 表达升高和 SCAANT1 表达降低，并且SCA7 的开发功能。使用在原代小鼠小脑星形胶质细胞中转染的反义 ATXN7 构建体进行的报告基因分析表明，CTCF 结合是最大 SCAANT1 启动子活性所必需的，并且致病性 CAG 扩展降低了 SCAANT1 启动子活性。人视网膜母细胞瘤细胞中 CTCF 的敲低显着降低了 SCAANT1 的表达，并增加了 P2A 启动子（而非典型上游启动子）表达的 ATXN7 mRNA。染色质免疫沉淀分析显示 P2A 启动子中存在 SCAANT1 表达的抑制性染色质修饰。索弗等人（2011） 得出结论，SCAANT1 是一种抑制 ATXN7 表达的调节 RNA，并受到 CTCF 的正转录控制。

▼ 测绘

索弗等人（2011） 将 SCAANT1 基因定位到染色体 3p14.1 上 ATXN7 基因的相反链。