PININ; PNN
DRS
HGNC 批准的基因符号:PNN
细胞遗传学位置:14q21.1 基因组坐标(GRCh38):14:39,175,254-39,183,220(来自 NCBI)
▼ 说明
Pinin 是一种细胞粘附相关的核蛋白,对于角膜上皮细胞间粘附的建立和维持至关重要(Zimowska 等,2003)。
▼ 克隆与表达
桥粒密切参与邻近上皮细胞的结构和功能整合。它们充当细胞间粘附的加固位点,以及上皮细胞中间支架的横向锚定点。已经鉴定了许多与桥粒相关的蛋白质,包括桥粒斑蛋白(125647)、斑珠蛋白(173325)、桥粒芯糖蛋白(例如,125670)和桥粒胶蛋白(例如,125643)。Ouyang 和 Sugrue(1996) 发现了一种新的磷蛋白,称为 pinin,与成熟桥粒相关。通过用他们克隆的犬pinin cDNA 筛选人胎盘cDNA 文库,他们分离出了编码PNN 的cDNA。推导的 743 个氨基酸的 PNN 蛋白含有富含丝氨酸的结构域;谷氨酰胺-脯氨酸、谷氨酰胺-亮氨酸重复结构域;富含谷氨酸的酸性结构域;和许多潜在的激酶识别基序。通过蛋白质印迹分析,重组 PNN 迁移为 140 kD 蛋白。Ouyang 和 Sugrue(1996) 发现重组 pinin 在人胚胎肾源性 293 细胞的侧缘表达,与桥粒斑蛋白相关。他们注意到细胞/组织形态的显着变化。Northern 印迹分析检测到 PNN 在人体组织中普遍表达,包括那些缺乏桥粒的组织。PNN 表达为 4.1、3.7 和 3.2 kb 转录本,显示组织特异性表达模式。Southern印迹分析证明人类基因组中存在单个pinin基因。由于 PNN 编码序列的 3-prime 末端与猪中性粒细胞 cDNA 文库中鉴定的部分 cDNA 几乎相同,并且由于不与 pinin 抗体反应的白细胞表达与 pinin cDNA 杂交的 mRNA,因此作者推测可能存在与pinin相关的基因。
Brandner 等人通过筛选角质形成细胞 cDNA 文库(1997) 和布兰德纳等人(1998) 分离出编码一种蛋白质的 cDNA,他们将其称为 DRS(富含丝氨酸的结构域),该蛋白质与 Ouyang 和 Sugrue(1996) 描述的 PNN 蛋白质基本相同。然而,细胞分级分离和免疫荧光显微镜分析将 DRS 严格定位于细胞核而不是桥粒。序列分析预测,717 个氨基酸的 DRS 蛋白含有一个 N 端核定位信号和一段约 80 个氨基酸的 C 端序列,其中 73% 是丝氨酸。80 个氨基酸的 C 端结构域和随后的 79 个氨基酸结构域还包含大量 Ser-arg 和 arg-ser 二肽。
Degen 等人在具有不同转移潜能的黑色素瘤细胞系中使用消减杂交(1999) 获得了编码与 DRS 蛋白相同的蛋白的 cDNA,他们将其命名为 MEMA(黑色素瘤转移克隆 A)。序列分析预测,亲水性 MEMA 蛋白含有 N 末端富含甘氨酸的区域以及富含单个氨基酸或其他类别氨基酸的其他区域。此外,德根等人(1999) 鉴定了 3 个假定的卷曲螺旋结构域、2 个潜在的 N-糖基化位点和一些磷酸化位点。Northern印迹分析检测到MEMA在平滑肌、肺和肾髓质中强表达,在脾中中等表达,在结肠、前列腺、胎盘、肝脏和肾皮质中弱表达或不表达。德根等人(1999)观察到人类肿瘤细胞系中的可变表达。作者认为,MEMA 参与蛋白质-蛋白质相互作用,并且可以稳定核蛋白颗粒和桥粒-中间丝复合物。
通过 HCE-T 人角膜上皮细胞的免疫荧光,Zimowska 等人(2003) 在细胞粘附和细胞核内检测到 PNN,它广泛分布在整个核质中并集中在核斑点中。
▼ 基因功能
Zimowska 等人通过对 HeLa 细胞进行酵母 2 杂交分析,然后进行序列分析(2003) 发现表位标记的人类 PNN 与富含丝氨酸/精氨酸(SR) 的蛋白质 SRP75(SRSF4; 601940)、SRM300(SRRM2; 606032) 和 SRRP130(PNISR; 616653) 相互作用。截短分析表明,PNN 的聚丝氨酸/RS 结构域和侧翼序列参与了与这些 SR 蛋白的结合。这 4 种蛋白质共定位于 HCE-T 细胞的细胞核中,其中任何一种蛋白质的过度表达都会影响其他蛋白质在核斑点和核质之间的分布。
▼ 测绘
Hartz(2015) 根据 PNN 序列(GenBank BM850066) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PNN 基因对应到染色体 4q21.1。