MAKORIN 1; MKRN1
HGNC 批准的基因符号:MKRN1
细胞遗传学位置:7q34 基因组坐标(GRCh38):7:140,453,033-140,479,569(来自 NCBI)
▼ 说明
Makorin 环指蛋白 1 基因(MKRN1) 是编码一类新型锌指蛋白的无内含子哺乳动物基因家族的高度转录、含有内含子的来源。系统发育分析表明 MKRN1 基因是该基因家族的祖先(Gray 等,2000)。
▼ 克隆与表达
格雷等人(2000) 从人类、小鼠、小袋鼠、鸡、果蝇和线虫中克隆了 MKRN1 直向同源物,强调了该基因的年龄和保守性。人类 MKRN1 cDNA 包含 3,026 个碱基对的连续序列,包括从核苷酸 121 到 1567 的开放解读码组(ORF),编码 482 个氨基酸的推定蛋白质。小鼠和果蝇 Mkrn1 蛋白与人类蛋白分别具有 92% 和 27% 的同一性,果蝇 Mkrn1 从 RING 指上游到 C 端 C3H 锌指的 123 个氨基酸达到 63% 的同一性。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到一个显着的 3.2 kb 转录本,表明 MKRN1 基因在所有组织中高度一致地表达,包括大脑的不同区域。在小鼠胚胎神经系统和成年睾丸中观察到高水平。
▼ 基因功能
Kim 等人使用酵母 2 杂交系统(2005) 发现 MKRN1 与 TERT(187270) 的 C 末端结构域相互作用,TERT 是端粒酶核糖核蛋白的催化亚基。他们证明 MKRN1 作为 E3 泛素连接酶发挥作用,促进 TERT 泛素化和蛋白酶体降解。MKRN1 的 his307 突变或其 C 端环指结构域的缺失使该酶失活。端粒酶阳性人类细胞中 MKRN1 的过度表达会降低端粒酶活性并缩短端粒长度。金等人(2005) 得出结论,MKRN1 在端粒稳态中发挥负面作用。
▼ 基因家族
MKRN 基因家族编码具有一系列独特锌指基序的假定核糖核蛋白,包括 2 至 4 个 C3H 锌指、可能代表新型锌指结构的不寻常 cys/his 排列以及高度保守的 RING 锌指。格雷等人(2000) 总结了分布在整个人类基因组中的 9 个 MKRN 家族基因座。
▼ 基因结构
MKRN1 基因由 8 个外显子组成,长度约为 28 kb(Gray et al., 2000)。
▼ 测绘
Gray等人分别通过FISH和种间回交分析(2000) 确定人类和小鼠 MKRN1 位点对应到人类 7q34-q35 染色体和小鼠 6A 染色体中靠近 T 细胞受体 - β 簇(TCRB;参见 186930)的保守同线性组。
▼ 动物模型
广常等人(2003) 报道,假定的假基因 Mkrn1-p1 的转基因破坏导致反式 Mkrn1 mRNA 不稳定,并产生多囊肾和骨畸形的表型。格雷等人(2006) 无法复制 Hirotsune 等人的研究结果(2003)。他们表明,5-prime Mkrn1-p1 在两个等位基因上都完全甲基化,表明染色质沉默,并且 Mkrn1-p1 不被转录,因此不能稳定反式 Mkrn1 转录本。他们确定 Hirotsune 等人报道的假定 Mkrn1-p1(2003)实际上是Mkrn1基因的短剪接变体。Mkrn1 被直接破坏的小鼠没有表现出 Hirotsune 等人所归因的任何表型(2003) 部分还原了 Mkrn1 同工型。此外,格雷等人(2006) 发现 Mkrn1-p1 似乎对小鼠具有特异性;在包括老鼠在内的任何其他物种中都没有发现这种现象。