基础转录激活剂1; ABT1
HGNC 批准的基因符号:ABT1
细胞遗传学定位:6p22.2 基因组坐标(GRCh38):6:26,596,953-26,600,739(来自 NCBI)
▼ 说明
ABT1 是一种 TBP(600075) 和 DNA 结合蛋白,可以激活基础转录(Oda et al., 2000)。
▼ 克隆与表达
小田等人(2000) 分别从 NT2 人畸胎癌细胞和小鼠胚胎细胞 cDNA 文库中克隆了人和小鼠 ABT1。人和小鼠 ABT1 分别含有 272 和 269 个氨基酸,氨基酸一致性为 75.6%。作者还在酵母和线虫中发现了 ABT1 直向同源物。Northern 印迹分析显示小鼠 Abt1 普遍表达。在转染的 COS-7 细胞中,荧光标记的小鼠 Abt1 定位于细胞核,有时定位于核仁。尽管作者在 Abt1 中发现了 2 个假定的核定位信号,但突变分析表明它们对于核定位并不是必需的。
▼ 测绘
Gross(2020) 根据 ABT1 序列(GenBank BC048812) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ABT1 基因对应到染色体 6p22.2。
▼ 基因功能
使用敲除分析,Oda 等人(2000) 表明 Abt1 对于酵母的生长至关重要。小鼠 Abt1 直接与小鼠和人类 TBP 相互作用,刺激转染细胞中的基础转录,从而增强报告基因表达。DNA 结合测定表明小鼠 Abt1 直接结合单链和双链 DNA。
小田等人(2004) 发现大鼠 Abtap(ESF1; 618765) 与小鼠 Abt1 相互作用,并通过以剂量依赖性方式抑制 Abt1 和 Tbp 之间的结合来抑制 Abt1 诱导的转录。当共转染 COS-7 细胞时,大鼠 Abtap 和小鼠 Abt1 几乎完全共定位。然而,Abt1/Abtap 复合物的亚核定位受细胞中每种蛋白质的相对量调节。当 Abtap 占主导地位时,两种蛋白质都定位于核体中,而 Abtap 则单独定位于核体中。当 Abt1 占主导地位时,两种蛋白质都定位于核仁和核质,而 Abt1 单独存在于核仁和核质中。