环指蛋白13; RNF13
HGNC 批准的基因符号:RNF13
细胞遗传学位置:3q25.1 基因组坐标(GRCh38):3:149,812,688-149,962,139(来自 NCBI)
▼ 说明
RNF13 基因通过与 IRE1a(ERN1;604033)和 JNK(参见 601158)信号通路相互作用,编码内质网(ER) 应激反应和细胞凋亡的关键介质(Edvardson 等人总结,2019)。
▼ 克隆与表达
Tranque 等人通过消减杂交鉴定鸡胚脑细胞附着细胞外基质分子生腱蛋白(TNC; 187380) 后表达的基因(1996) 克隆了鸡 Rnf13,他们称之为 Crzf。推导的 381 个氨基酸蛋白包含一个 N 端亮氨酸拉链基序、一个富含半胱氨酸的 C3HC4 锌指基序和一个类似于转录因子激活结构域的 C 端酸性区域。Rnf13 还包含核定位信号。免疫荧光定位检测到细胞核中的 Rnf13。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 RNF13 序列(GenBank AF037204) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RNF13 基因对应到染色体 3q25.1。
▼ 分子遗传学
Edvardson 等人在 3 名患有发育性和癫痫性脑病 73(DEE73; 618379) 的无关患者中(2019) 鉴定了 RNF13 基因中的从头杂合错义突变(L311S, 609247.0001 和 L312P, 609247.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在gnomAD数据库中并未发现。这两种突变都发生在对翻译后修饰很重要的高度保守区域。对 L311S 突变患者细胞的体外功能表达研究表明,与对照组相比,内质网应激信号增强,内质网应激诱导的细胞凋亡增加,这与功能获得效应一致。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 发育性和癫痫性脑病 73
RNF13、LEU311SER
在一名患有发育性癫痫性脑病 73(DEE73; 618379) 的患者(个体 1)中,Edvardson 等人(2019) 在 RNF13 基因中发现了一个从头杂合的 c.932T-C 转变(c.932T-C, NM_007282.4),导致在一个对翻译后重要的高度保守区域发生 leu311 到 Ser(L311S) 的取代。修改。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在gnomAD数据库中并未发现。患者细胞的体外功能表达研究表明,与对照组相比,内质网应激信号增强,内质网应激诱导的细胞凋亡增加,这与功能获得效应一致。该患者在 7 周龄时出现多种癫痫发作类型。他几乎没有表现出精神运动发育,并在 33 个月大时去世。
.0002 发育性和癫痫性脑病 73
RNF13、LEU312PRO
在 2 名不相关的患有发育性癫痫性脑病 73(DEE73; 618379) 的患者(患者 2 和 3)中,Edvardson 等人(2019) 在 RNF13 基因中发现了一个从头杂合的 c.935T-C 转变(c.935T-C, NM_007282.4),导致在一个对翻译后重要的高度保守区域中由 leu312 到 pro(L312P) 取代。修改。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但在gnomAD数据库中并未发现。尚未进行该变体的功能研究和患者细胞的研究,但对邻近突变(L311S;609247.0001)的研究表明,L312P 突变可能导致功能获得,并增加 ER 应激诱导的细胞凋亡。患者分别在 2 个月和 7 个月大时出现癫痫发作。他们几乎没有实现任何发展里程碑。