聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员 10; PARP10
聚(ADP-核糖)聚合酶 10
HGNC 批准的基因符号:PARP10
细胞遗传学位置:8q24.3 基因组坐标(GRCh38):8:143,977,158-144,012,764(来自 NCBI)
▼ 说明
聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP),例如 PARP10,通过向组蛋白添加 ADP-核糖来改变染色质组织来调节基因转录。PARP 还可以作为转录辅助因子发挥作用(Yu 等人,2005)。
▼ 克隆与表达
于等人(2005) 通过从人 Jurkat T 细胞中免疫纯化含有 MYC 的复合物,将 PARP10 鉴定为 MYC(190080) 相互作用蛋白。通过使用 PARP10 肽序列搜索 EST 数据库,他们鉴定出了 PARP10 cDNA。通过 SDS-PAGE 推导的 1,025 个氨基酸蛋白的表观分子量为 150 kD。PARP10 包含一个 N 末端 RNA 识别基序,随后是富含甘氨酸的结构域、富含谷氨酸的结构域和 PARP 催化结构域。富含谷氨酸的结构域具有潜在的富含亮氨酸的核输出信号(NES) 和 2 个泛素相互作用基序。Northern 印迹分析在所有分析的组织中检测到 3.8 kb PARP10 转录物,其中在脾脏和胸腺中表达最高。PARP10 主要定位于转染的人骨肉瘤细胞的细胞质,但 NES 突变或核输出抑制剂的使用导致 PARP10 在核区室中积累。
▼ 基因功能
于等人(2005) 发现 PARP10 的 C 端一半显示出 PARP 活性。PARP 结构域具有自动 PARP 活性,可修饰所有 4 个测试的核心组蛋白(参见 142711),优先选择组蛋白 H2A,但它不会修饰 MYC、MAX(154950)、组蛋白 H1 或 YY1(600013)。全长蛋白还表现出 PARP 活性。his887或gly888的点突变使该酶失活,lys916的点突变强烈降低了催化活性。通过免疫共沉淀和体外蛋白质下拉测定,Yu 等人(2005) 证实了 PARP10 和 MYC 之间的直接相互作用。突变分析表明 PARP10 的 C 端部分与 MYC 的 N 端和 C 端区域相互作用。PARP10 过表达抑制 MYC/HRAS(190020) 和腺病毒 E1A/HRAS 介导的大鼠胚胎成纤维细胞的共转化,并抑制血清刺激的小鼠成纤维细胞进入 S 期。PARP10 对细胞增殖的影响与 PARP 结构域无关。
克莱恩等人(2008) 证明,与催化多 ADP 核糖基化的 PARP1(173870) 不同,PARP10 仅催化单 ADP 核糖基化。参与 NAD+ 结合的核心二级结构元件和关键残基在 PARP1 和 PARP10 中是保守的,但 PARP10 用异亮氨酸(I987) 代替了 PARP1(E988) 中的催化谷氨酸。PARP10 催化自动 ADP 核糖基化,主要在 E882 上。结构分析表明,E882 位于分子的催化中心附近,Kleine 等人(2008) 表明,E882 通过底物辅助催化,起到催化谷氨酸的作用。他们得出的结论是,催化谷氨酸的自动修饰会阻止 PARP10 作为聚 ADP 核糖聚合酶发挥作用。
▼ 基因结构
莱斯涅维奇等人(2005) 确定小鼠 Parp10 基因至少包含 11 个外显子。除内含子 9 跨度超过 6 kb 外,所有内含子都很小。潜在的 TATA 框位于最 5 素数序列的上游。Parp10 基因的 3 素序列与 Plec1 基因(601282) 的 5 素序列在同一链上重叠。Parp10 基因的外显子 10 和 11 编码最后 109 个氨基酸和 Parp10 的 3-prime UTR,在不同位点剪接形成 Plec1 剪接变体的非翻译外显子 -1 和 0a。莱斯涅维奇等人(2005) 鉴定出含有 Parp10 和 Plec1 序列的小鼠 EST,但他们没有找到通读转录本。
▼ 测绘
通过 FISH,Yu 等人(2005) 将 PARP10 基因对应到染色体 8q24。
莱斯涅维奇等人(2005) 将小鼠 Parp10 基因定位到 15 号染色体,紧邻 Plec1 基因的上游,并与 Plec1 基因处于头尾相连的方向。