含有三联基序的蛋白质 13; TRIM13

RET 手指蛋白 2;RFP2
LEU5

HGNC 批准的基因符号:TRIM13

细胞遗传学位置:13q14.2 基因组坐标(GRCh38):13:49,997,042-50,018,467(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

B 细胞慢性淋巴细胞白血病通常与染色体 13q14 上视网膜母细胞瘤基因(RB1; 614041) 和基因座 D13S25 之间的区域丢失有关(Liu et al., 1993; Liu et al., 1995)。Kapanadze 等人通过构建对应于最小缺失区域的粘粒重叠群并筛选前 B 淋巴细胞 cDNA 文库(1998)克隆了LEU5。推导的 407 个氨基酸的 LEU5 蛋白含有 RING 型锌指结构域,并与 RET 指蛋白(RFP; 602165) 和肿瘤抑制基因 BRCA1(113705) 具有显着的同源性。

勒纳等人(2007) 指出 RFP2 蛋白具有 RING Finger、B框 和卷曲螺旋结构域,属于 RBCC/TRIM 蛋白家族。

通过数据库和 PCR 分析,Corcoran 等人(2004) 鉴定了几个 RFP2 转录本,包括假定的双顺反子 7.5-kb 转录本,其中包含 RFP2 和 DLTET 的 ORF(KCNRG; 607947)。除了双顺反子转录本之外,他们还鉴定了 4 个主要的单顺反子 RFP2 转录本、3 个主要的单顺反子 DLTET 转录本以及缺少两个 ORF 的转录本。RT-PCR 在所有检查的人体组织中检测到 4 个主要转录物,大小范围为 1.7 至 7.5 kb。小鼠体内存在双顺反子和单顺反子 Rfp2 和 Dltet 转录本。小鼠胚胎的原位杂交显示,在所有检查的组织中,Rfp2/Dltet 与 Dleu2(605766)(一种推定的非编码 RNA)共表达。在小鼠和人类中,RFP2/DLTET 基因与 DLEU2 基因以反义方向重叠,表明 DLEU2 可能调节 RFP2/DLTET 表达。

▼ 基因功能

勒纳等人(2007) 发现 RFP2 蛋白不稳定,并且在体内和体外经历多聚泛素化,这是一个针对蛋白质去除的过程。他们表明,RFP2 充当 RING E3 泛素连接酶,并与内质网(ER) 中的多种蛋白质相互作用,其中包括 VCP(601023),这是 ER 相关降解(ERAD) 所需的蛋白质。

▼ 基因结构

科科伦等人(2004) 提出 RFP2 和 DLTET 由双顺反子基因编码,该基因跨度为 24 kb,包含至少 7 个外显子,包括 2 个替代的第一个外显子(1A 和 1B)。在此结构中,外显子 3 包含 RFP2 ORF。RFP2/DLTET 基因以反义方向完全位于 DLEU2 基因的外显子 10 和 12 之间。所有 RFP2 和 DLTET 外显子均来自 DLEU2 内含子,但 RFP2 外显子 1A 除外,该外显子直接与 DLEU2 外显子 11 重叠。

▼ 测绘

卡帕纳泽等人(1998) 将 RFP2 基因定位到染色体 13q14。

科科伦等人(2004) 将小鼠 Trim13 基因定位到 14 号染色体的一个区域,该区域与人类染色体 13q14.3 具有同源性。