核糖核酸酶 P/MRP 亚基 p38; RPP38
核糖核酸酶 P/MRP,38-KD 亚基
核糖核酸酶 P,38-KD 亚基
HGNC 批准的基因符号:RPP38
细胞遗传学位置:10p13 基因组坐标(GRCh38):10:15,097,355-15,104,257(来自 NCBI)
▼ 说明
核糖核酸酶 P(RNase P) 可去除前体 tRNA 分子中的 5 引物前导序列。RNase P 由 RNA 种类(H1 RNA)、POP1 蛋白(602486) 和至少 7 种称为 RPP 的蛋白质组成。RPP 的表观分子量为 14 kD(RPP14; 606112)、20 kD(RPP20; 606113)、25 kD(RPP25; 619235)、29 kD(RPP29; 606114)、30 kD(RPP30; 606115)、38 kD( RPP38) 和 40 kD(RPP40; 606117)。硬皮病患者(181750) 的血清与 RNase P、Th 抗原(也称为 To 抗原)以及 RPP30 和 RPP38 发生反应(Jarrous 等人,1998 年和 Jarrous 等人,1999 年总结)。
▼ 克隆与表达
Eder等人通过RNase P的生化纯化、微肽序列分析、胎肝cDNA文库的PCR以及EST数据库检索(1997)获得了编码RPP38的cDNA。推导的 283 个氨基酸蛋白具有亮氨酸拉链 RNA 结合基序,预测分子量接近 32 kD,小于 SDS-PAGE 分析中观察到的 38 kD。
贾罗斯等人(1998) 确定 RPP38 是系统性硬化症患者抗血清的主要靶标,并且该抗原可能位于核质和核仁中。免疫沉淀分析表明,针对 RPP20、RPP30、RPP38 或 RPP40 产生的多克隆抗体与 HeLa 细胞中的 RNase P 相互作用。
▼ 基因功能
Reiner 等人从 HeLa 细胞提取物中耗尽 RNase P 后(2006) 发现 RNA 聚合酶(Pol) III(参见 606007)介导的 tRNA 和其他小非编码 RNA 基因的转录存在严重缺陷。RNase P 的 H1RNA(RPPH1; 608513) 部分的靶向切割改变了酶特异性并减少了 Pol III 转录。类似地,小干扰RNA使RNase P蛋白亚基(例如RPP38)失活会抑制细胞中的Pol III功能和Pol III指导的启动子活性。RNase P 通过与活性 tRNA 和 5S rRNA(180420) 基因的 Pol III 和染色质关联来发挥其在转录中的作用。赖纳等人(2006) 得出结论,RNase P 在 Pol III 转录中发挥作用,并且转录和早期 tRNA 加工可能是协调的。
▼ 测绘
Gross(2013) 根据 RPP38 序列(GenBank BC029494) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 RPP38 基因对应到染色体 10p13。