载脂蛋白 L-II; APOL2

APOL-II

HGNC 批准的基因符号:APOL2

细胞遗传学位置:22q12.3 基因组坐标(GRCh38):22:36,226,209-36,239,954(来自 NCBI)

▼ 说明

载脂蛋白 L(APOL) 蛋白属于高密度脂蛋白家族,在胆固醇转运中发挥核心作用。细胞膜的胆固醇含量在细胞过程中很重要,例如调节成人大脑和神经发育过程中的基因转录和信号转导。6 个 APOL 基因聚集在染色体 22q12.3 上。

▼ 克隆与表达

通过 EST 和基因组序列分析,Duchateau 等人(2001) 鉴定了 22 号染色体上的几个 APOL 基因,包括 APOL2,与 APOL1(603743) 表现出密切的同源性。他们从胎盘 cDNA 文库中克隆了 APOL2,并鉴定了一个剪接变体,该剪接变体在 5-prime 非翻译区包含一个额外的外显子。由于 APOL 基因之间的密切同源性,Duchateau 等人(2001) 共扩增 APOL1、APOL2 和 APOL3(607253) 的转录本,并使用基因特异性限制酶来鉴定 APOL2 特异性 PCR 产物。仅检测到单个 APOL2 转录本,并且该转录本表现出无处不在的表达,在肺部表达水平最高。

通过基因组序列分析,Page 等人(2001) 在 APOL 基因簇中鉴定出 APOL2。推导的 337 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 37.1 kD。作者指出,APOL 蛋白在预测的两亲性 α 螺旋内具有显着的序列同一性。半定量RT-PCR显示APOL2普遍表达,在肺、胸腺、前列腺和胎盘中表达水平最高,在心脏中表达较弱。

Monajemi 等人使用 APOL3 作为探针(2002) 从激活的人脐静脉内皮细胞(HUVEC) cDNA 文库中克隆了 APOL2。他们在推导的蛋白质序列中没有发现信号肽。Northern 印迹分析在大脑中检测到 2.4 kb 的转录物,在心脏中表达较低,在其他组织中表达水平非常低。在大脑中也检测到了 2.7 kb 的转录本。人类血管组织的原位杂交显示 APOL2 在内皮细胞中表达,但在新内膜或中膜中没有表达。

▼ 基因功能

莫纳杰米等人(2002) 发现在肿瘤坏死因子-α(TNFA;191160) 长时间刺激后,HUVEC 中 APOL1、APOL2 和 APOL3 的表达上调。6 小时后,APOL2 上调超过 6 倍。

在对精神分裂症(181500) 和对照大脑前额叶皮层基因表达的微阵列分析中,Mimmack 等人(2002) 发现 APOL1、APOL2 和 APOL4(607254) 基因显着上调。

▼ 基因结构

杜夏托等人(2001) 确定 APOL2 基因包含 6 个外显子,其中 5 个用于最常见的变体,而更罕见的变体则使用全部 6 个外显子。APOL1、APOL2、APOL3 和 APOL4 基因的启动子区域至少有 1 个外显子。 SP1(189906) 位点、多个 AP1(165160) 和 AP4(600743) 位点、至少 1 个 GC 框、多个锌指结合位点和至少 1 个甾醇调节元件结合蛋白(参见 184756)位点。每个包含至少 2 个保守的起始序列。最常用的启动子区域不含 TATA,具有多个转录起始位点。与其他 APOL 基因不同,APOL2 没有 CAAT 框,并且由于其额外的 5-prime 外显子而包含一个替代转录起始位点。

莫纳杰米等人(2002) 确定 APOL2 基因跨度为 14 kb。他们在 3-prime 非翻译区内发现了 2 个聚腺苷酸化信号。Monajemi 等人注意到内含子序列内的同源性(2002) 得出结论,APOL1、APOL2、APOL3 和 APOL4 基因簇是串联基因复制的结果,而 APOL5(607255) 和 APOL6(607256) 的相关性更远。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Duchateau 等人(2001) 将 APOL2 基因定位到染色体 22q12.1-q13.1。它位于包含 APOL1、APOL3 和 APOL4 的集群中,跨度为 127 kb。APOL1 与其他 3 的方向相反。 Page 等人(2001) 发现 APOL 簇包含 6 个基因,跨度 619 kb。

在他们的图 3 中,Mimmack 等人(2002) 绘制了染色体 22q12.3 上 APOL 基因家族的基因组结构图。染色体 22q11 上的 COMT 基因(116790) 距 APOL6 基因 15.2 Mb,该基因位于 APOL 基因簇的端粒末端。APOL1 基因位于簇的端粒末端。